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分子动力学模拟的若干基础应用和理论

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-9页
第一章 绪论第9-20页
   ·计算机模拟方法第9-10页
   ·分子模拟简介第10-12页
   ·分子力学与分子动力学第12-19页
     ·基本思想第13页
     ·分子力学简介第13-14页
     ·分子动力学方法第14-15页
     ·力场第15-17页
     ·课题的提出第17-19页
 参考文献第19-20页
第二章 主客体包结第20-52页
   ·前言第20-22页
   ·真空条件下β-CD和对甲基苯酚包结物动态结构的分子动力学模拟第22-30页
     ·计算方法第22页
     ·变量示意图第22-23页
     ·包结物的动态结构第23-26页
     ·游离对甲基苯酚及CD包结前后的结构及性质的差异第26-29页
     ·小结第29-30页
   ·纳米水滴中β-CD和对甲基苯酚1:1包结物的约束动力学模拟第30-38页
     ·计算方法第30-31页
     ·氢键、水化及疏水作用第31-34页
     ·包结物动态结构及均时构象第34-37页
     ·小结第37-38页
   ·β-CD和间甲基苯酚1:1包结物的疏水作用及溶剂效应的分子动力学模拟第38-48页
     ·模拟方法第38-39页
     ·模拟细节第39-40页
     ·溶剂效应对包结物稳定性的影响——疏水性第40-42页
     ·溶剂效应对客体运动的影响第42-44页
     ·溶剂效应对β-CD动态结构的影响第44-46页
     ·溶剂效应对β-CD包结物动态结构的影响第46-47页
     ·小结第47-48页
   ·本章结论与展望第48-49页
   ·本章实验所采用的分析方法第49-50页
 参考文献第50-52页
第三章 纳米颗粒分子间作用第52-84页
   ·前言第52-60页
     ·纳米技术中的金元素第52-54页
     ·金纳米材料的制备第54-55页
     ·金纳米材料的理论研究现状第55-60页
   ·金簇表面物理吸附不对称硫醚链的纳米粒子的计算机模拟第60-69页
     ·系统模型的构建与模拟细节第60-61页
     ·结果与讨论第61-68页
     ·小结第68-69页
   ·金簇表面化学吸附不对称硫醚链的纳米粒子的内在结构的分子模拟第69-75页
     ·系统模型的构建与模拟细节第69-70页
     ·结果与讨论第70-74页
     ·小结第74-75页
   ·金纳米粒子的结构、温度及稳定性第75-81页
     ·模型的构建及模拟第75页
     ·结果与讨论第75-80页
     ·小结第80-81页
   ·本章结论与展望第81-82页
 参考文献第82-84页
第四章 化学键断裂第84-105页
   ·前言第84-88页
   ·RPMD势与CRACK力场第88-93页
     ·反应势RPMD第88页
     ·CRACK力场中的RPMD势第88-92页
     ·CRACK力场中的非键作用项第92-93页
   ·MD模拟细节第93-94页
     ·反应系统及模型构建第93页
     ·编程第93-94页
     ·参数设定第94页
     ·模拟细节第94页
   ·结果与讨论第94-102页
     ·裂解可能性和裂解温度第94-96页
     ·位移参数de第96-97页
     ·裂解反应动力学第97-100页
     ·裂解产物分布第100-102页
   ·本章结论与展望第102-104页
 参考文献第104-105页
第五章 物质的某些物理性质第105-126页
   ·柴油凝结过程及降凝机理的分子动力学模拟第105-114页
     ·前言第105-106页
     ·热容、自扩散系数和凝点的关系第106-107页
     ·模型构建及MD模拟第107-108页
     ·模拟结果和讨论第108-111页
     ·小结与展望第111-112页
     ·其它体系模拟工作简介第112-114页
   ·一种利用常压分子动力学计算各向异性材料弹性性质的新方法第114-123页
     ·前言第114页
     ·模型的建立第114-115页
     ·Materials Studio软件中弹性性质的计算第115页
     ·各向异性材料弹性性质的计算方法第115-116页
     ·模拟细节第116-117页
     ·结果与讨论第117-121页
     ·小结与展望第121-123页
   ·本章总结第123-124页
 参考文献第124-126页
结语第126-127页
致谢第127-128页
附录一 作者简介第128-129页
附录二 博士研究期间发表的论文第129-131页

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