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一个光合组织特异表达启动子的克隆、功能分析及其转录因子的鉴定

中文摘要第1-15页
英文摘要第15-18页
英文缩略表第18-20页
1. 引言第20-49页
   ·植物启动子的基本结构第20-22页
     ·转录起始位点的特点第20页
     ·TATA-box第20-21页
     ·CAAT-box第21页
     ·GC-box第21页
     ·特殊的上游顺式作用元件第21-22页
   ·组成型启动子第22-26页
     ·CaMV35S启动子第23-24页
     ·CsVMV 启动子第24页
     ·Act1启动子第24页
     ·Ubiquitin 启动子第24-25页
     ·NOS、OCS 启动子第25-26页
   ·诱导型启动子第26-36页
     ·光诱导启动子第26-28页
     ·伤诱导启动子第28-29页
     ·植物激素诱导启动子第29-34页
       ·生长素诱导启动子第29-30页
       ·赤霉素诱导启动子第30-31页
       ·脱落酸诱导启动子第31-32页
       ·乙烯诱导启动子第32页
       ·水杨酸诱导启动子第32-33页
       ·茉莉酮酸诱导启动子第33-34页
     ·温度诱导启动子第34-36页
       ·高温诱导启动子第34-35页
       ·低温诱导启动子第35-36页
   ·组织特异性启动子第36-46页
     ·根特异启动子第36-37页
     ·韧皮部特异表达启动子第37-39页
       ·植物病毒来源的韧皮部特异表达启动子第38页
       ·植物来源的韧皮部特异表达启动子第38-39页
       ·植物病原菌来源的韧皮部特异表达启动子第39页
     ·维管束特异表达启动子第39-40页
     ·叶片表达启动子第40-41页
       ·光诱导型叶片特异表达启动子第40-41页
       ·组成型叶片特异表达启动子第41页
     ·花特异表达启动子第41-42页
       ·花药特异表达启动子第41-42页
       ·花粉特异表达启动子第42页
     ·果实特异表达启动子第42-43页
     ·种子特异表达启动子第43-46页
       ·单子叶植物种子特异表达启动子第44-45页
       ·双子叶植物种子特异表达启动子第45-46页
   ·植物碱性亮氨酸拉链蛋白的结构和分类第46-47页
     ·植物bZIP 蛋白的结构第46-47页
     ·植物bZIP 蛋白的分类第47页
     ·植物bZIP 蛋白的功能第47页
   ·本研究的目的和意义第47-49页
2 材料与方法第49-130页
   ·实验材料第49-51页
     ·植物材料第49页
     ·菌株与质粒第49页
     ·酶与各种生化试剂第49页
     ·实验用的引物和寡核苷酸第49-51页
   ·实验方法第51-76页
     ·植物基因组总 DNA第51-52页
     ·植物基因组 DNA 的纯化第52页
     ·植物总 RNA 的提取第52-53页
       ·异硫酸氰胍-酸性酚-LiCl 法第52-53页
       ·用 RNeasy Plant Mini Kit 提取总 RNA第53页
       ·RNA 纯化第53页
     ·PNZIP 启动子的分离第53-54页
     ·DNA 片段与克隆载体的连接第54页
     ·大肠杆菌 DH5α感受态的制备第54页
     ·大肠杆菌细胞的转化第54-55页
     ·克隆载体的酶切鉴定第55页
     ·序列的测定第55页
     ·质粒 DNA 的提取第55-56页
       ·煮沸法第55-56页
       ·大量法提质粒第56页
     ·PNZIP 基因转录起始位点的鉴定第56-57页
     ·亚克隆的测序第57-58页
     ·凝胶电泳中 DNA 片段的回收第58页
     ·根癌农杆菌 LBA4404 感受态细胞的制备第58页
     ·冻融法转化农杆菌第58-59页
     ·农杆菌介导的烟草的转化第59页
     ·GUS 活性的组织化学分析第59-60页
     ·GUS 基因表达的定量分析第60-61页
     ·Northern 杂交第61-63页
       ·RNA 提取及电泳第61-62页
       ·转膜及烘膜第62页
       ·探针的合成第62页
       ·预杂交及杂交第62-63页
     ·Southern 杂交第63页
       ·限制性内切酶消化第63页
       ·转膜第63页
       ·预杂交及杂交第63页
     ·植物核蛋白的提取第63-64页
     ·EMSA 探针的标记第64-65页
     ·EMSA 探针的纯化第65页
     ·制备聚丙烯酰胺凝胶第65页
     ·DNA 探针与蛋白质的结合第65-66页
     ·电泳、干胶及放射自显影第66页
     ·小量 LiAc/PEG 法制备酵母感受态细胞及其质粒转化第66-67页
     ·报告载体的3-AT 浓度的选择第67页
     ·酵母质粒提取第67页
     ·烟草mRNA 的分离第67-68页
     ·烟草 cDNA 第一链的合成第68页
     ·文库蛋白双链 DNA 的合成第68-69页
     ·双链文库 DNA 的纯化第69页
     ·报告载体和cDNA 文库质粒向酵母的共转化第69-70页
     ·阳性克隆的互作分析第70-71页
     ·文库插入片段的分离和电泳鉴定第71页
     ·阳性克隆全长序列的获得第71-72页
       ·烟草cDNA 第一条链的合成第71页
       ·阳性克隆 5′ 端序列的获得第71-72页
       ·cDNA 全长序列的获得第72页
     ·原核表达烟草 NtbZIP 蛋白第72-74页
       ·原核表达载体的构建第72页
       ·大肠杆菌 BL21 原核表达的诱导第72-73页
       ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第73-74页
       ·目的蛋白的纯化第74页
     ·启动子活性的瞬时表达分析第74-75页
       ·烟草叶片的处理第74页
       ·轰击时微弹的准备第74页
       ·基因枪的轰击第74-75页
     ·农杆菌介导的目的蛋白的细胞定位第75-76页
       ·洋葱表皮细胞的浸染和转化第75页
       ·目的蛋白的细胞定位观察第75-76页
 3 结果与分析第76-120页
   ·PNZIP 启动子是一个光合组织特异表达强启动子第76-85页
     ·PNZIP 启动子的分离第76-77页
     ·PNZIP 启动子转录起始位点的确定第77-78页
     ·PNZIP 全长启动子与 GUS 基因融合第78-79页
     ·番茄 Rbcs-3A 启动子与 GUS 基因融合第79-80页
     ·含有 PNZIP 全长启动子、Rbcs-3A 启动子转基因烟草的获得第80-81页
     ·GUS 活性与转基因拷贝数的关系第81-82页
     ·PNZIP 启动子是一个光合组织特异表达启动子第82-85页
   ·PNZIP 启动子是一个受昼夜节律调控的启动子第85-86页
   ·PNZIP 启动子的调控分析第86-102页
     ·PNZIP 启动子的结构分析第86-88页
     ·PNZIP 启动子不同缺失突变体的获得第88-92页
       ·PNZIP 启动子 5′ 端缺失突变体的获得第89-90页
       ·PNZIP 启动子 3′ 端缺失突变体的获得第90-91页
       ·PNZIP 启动子 3′ 端缺失片段与 90-35S 启动子的嵌合第91-92页
     ·含有不同长度 PNZIP 启动子转基因烟草的获得第92-93页
     ·各类转基因烟草 GUS 活性的检测第93-96页
       ·PNZIP 启动子的外部缺失突变体驱动 GUS 基因表达活性的检测第93-94页
       ·PNZIP 启动子的内部缺失突变体驱动 GUS 基因表达活性的检测第94-95页
       ·PNZIP 启动子的内部缺失片段与 90-35S 启动子嵌合体的 GUS 活性的检测第95-96页
     ·GAAATA 元件是一个正调控元件第96-99页
       ·GAAATA 元件可以和烟草核蛋白特异性结合第96-97页
       ·GAAATA 元件中参与和烟草核蛋白结合的关键核苷酸第97-98页
       ·GAAATA 元件是一个正调控元件第98-99页
     ·GATACT 元件、G-box 元件相互作用决定了启动子的叶片特异表达第99-101页
     ·ODN 技术对 PNZIP 启动子-379 到-100 区段的功能鉴定第101-102页
   ·与 PNZIP 启动子-379 到-100 区段结合转录因子的克隆与功能分析第102-120页
     ·与 PNZIP 启动子-379 到-100 区段结合转录因子的克隆第102-109页
       ·酵母报告载体的构建第102-103页
       ·酵母报告载体向酵母 Y187 的转化以及3-AT 浓度的选择第103-104页
       ·烟草cDNA 文库的构建第104-105页
       ·报告载体和cDNA 文库质粒向酵母的转化第105页
       ·阳性克隆的初步筛选第105-106页
       ·部分阳性克隆文库载体与报告载体作用强弱的鉴定第106-107页
       ·部分阳性克隆的复筛第107页
       ·阳性克隆的测序和分析第107-109页
       ·NtbZIP 全长序列的获得第109页
     ·NtbZIP 基因序列的分析第109-113页
     ·NtbZIP 蛋白 DNA 结合特性的分析第113-116页
       ·NtbZIP 基因的原核表达第113-114页
       ·NtbZIP 蛋白的纯化第114-115页
       ·NtbZIP 重组蛋白与 PNZIP 启动子-379 到-100 区段结合第115-116页
     ·NtbZIP 蛋白可以增强 PNZIP 启动子-379 到-100 区段的活性第116-117页
     ·NtbZIP 基因的亚细胞定位第117-118页
     ·NtbZIP 基因的 Southern 杂交分析第118页
     ·NtbZIP 基因的表达分析第118-120页
 4 讨论第120-128页
   ·PNZIP 启动子是一个特殊的组织特异启动子第120-122页
     ·PNZIP 启动子是一个光合组织特异启动子第120-121页
     ·PNZIP 启动子受昼夜节律调控第121-122页
   ·PNZIP 启动子可能的调控方式第122-125页
     ·G-box 与 GATACT 相互作用共同决定启动子的叶片特异表达第122-123页
     ·GAAATA 元件是一个正调控元件第123-124页
     ·Box-II 是一个正调控元件第124页
     ·A/T 富集基序是一个正调控元件第124-125页
   ·酵母单杂交试验中的假阳性和假阴性第125页
   ·NtbZIP 基因编码一种含有亮氨酸拉链的蛋白质第125-126页
   ·融合蛋白的原核表达和培养条件对表达产量的提高第126-128页
 5. 结论第128-130页
参考文献第130-150页
附录1第150-154页
附录2第154-155页
致谢第155页

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