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Ic类氨酰tRNA合成酶对tRNA的种属特异性识别

目录第1-5页
摘要第5-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 tRNATrp的识别依赖于色氨酰tRNA合成酶的两个重要肽段第8-32页
 1 引言第8-10页
 2 材料和方法第10-14页
   ·序列同源性分析第10-11页
   ·枯草杆菌TrpRS缺失突变体的构建第11页
   ·色氨酰tRNA合成酶的表达与纯化第11-12页
   ·tRNATrp体外转录及纯化第12-13页
   ·磷交换反应动力学分析第13页
   ·tRNA氨酰化反应的动力学测定第13-14页
   ·色氨酰tRNA合成酶识别tDNATrp小螺旋的凝胶阻滞实验第14页
 3 结果第14-23页
   ·不同种属来源的色氨酰tRNA合成酶具有较高的保守性第15-16页
   ·枯草杆菌色氨酰tRNA合成酶及其突变体的纯化和表达性质第16-17页
   ·磷交换反应证明缺失掉的肽段对氨基酸的活化影响不大第17-19页
   ·TrpRS突变体蛋白质对tRNATrp的识别与催化第19-21页
   ·色氨酰tRNA合成酶与tDNATrp小螺旋结合实验第21-23页
 4 讨论第23-27页
 参考文献第27-32页
第二章 K149和E153参与枯草杆菌色氨酰tRNA合成酶的种属特异性识别第32-58页
 1 引言第32-35页
 2 材料和方法第35-38页
   ·菌株、质粒和生化试剂第35页
   ·序列同源性分析第35-36页
   ·枯草杆菌TrpRS突变体的构建和纯化第36页
   ·tRNATrp体外转录及纯化第36-37页
   ·氨基酸活化反应的动力学实验第37页
   ·tRNATrp氨酰化反应的动力学分析第37-38页
 3 结果第38-44页
   ·K149/E153及其对应残基的侧链基团电性呈进化多样性第38-40页
   ·色氨酸活化反应中TrpRS突变体对反应的影响第40-42页
   ·K149和E153的改变使TrpRS对枯草杆菌tRNATrp的氨酰化活力降低第42页
   ·枯草杆菌TrpRS突变体交叉催化人源tRNATrp的氨酰化活力第42-44页
 4 讨论第44-52页
 参考文献第52-58页
第三章 保守残基的种属差异确保了Ic类合成酶的种属特异性第58-92页
 1 引言第58-62页
 2 材料和方法第62-64页
   ·菌株、质粒和生化试剂第62页
   ·序列同源性分析第62-63页
   ·构建和纯化枯草杆菌TrpRS和人TrpRS突变体第63页
   ·tRNATrp体外转录及纯化第63-64页
   ·tRNATrp氨酰化反应的动力学分析第64页
   ·Ic类氨酰tRNA合成酶tRNA结合位点的预测第64页
 3 结果第64-80页
   ·Ic类氨酰tRNA合成酶tRNA结合位点的保守残基表现出明显的种属差第64-66页
   ·tRNATrp中识别元件与TrpRS的保守残基表现出共进化特征第66-69页
   ·TrpRS保守残基侧链基团上的电性存在种属差异性与tRNATrp识别元件的种属差异相对应第69-71页
   ·改变保守残基的电性会削弱TrpRS对相应tRNATrp的催化活力第71-76页
   ·保守残基侧链基团电荷变化可能改变TrpRS的种属特异性第76-78页
   ·催化tRNATrp突变体的动力学数据表明保守残基主要与tRNATrp识别元件相作用第78-79页
   ·未知结构的Ic类氨酰tRNA合成酶的tRNA结合位点预测第79-80页
 4 讨论第80-85页
 参考文献第85-92页
第四章 重组人酪氨酰tRNA合成酶的表达、纯化及性质测定第92-106页
 1 引言第92-94页
 2 材料和方法第94-97页
   ·菌株、质粒、细胞和化学试剂第94页
   ·RT-PCR和质粒构建第94-95页
   ·人酪氨酰tRNA合成酶的异源表达第95页
   ·C末端含组氨酸残基的重组人TyrRS蛋白质的纯化第95-96页
   ·人tRNATyr的体外转录和纯化第96页
   ·氨酰化反应的动力学分析第96-97页
 3 结果第97-100页
   ·pET24a(+)-TyrRS质粒的构建第97页
   ·重组人TyrRS的表达和纯化第97-98页
   ·人TyrRS-His6的氨酰化反应动力学参数第98-100页
 4 讨论第100-102页
 参考文献第102-106页
发表文章目录第106-107页
致谢第107页

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