| Abbreviation (缩略词） | 第6-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一部分: 中国幽门螺杆菌比较基因组分析 | 第14-48页 |
| 前言 | 第14-18页 |
| 材料与方法 | 第18-26页 |
| 结果 | 第26-42页 |
| 讨论 | 第42-47页 |
| 小结 | 第47-48页 |
| 第二部分: 中国幽门螺杆菌种群结构分析 | 第48-72页 |
| 前言 | 第48-51页 |
| 材料与方法 | 第51-54页 |
| 结果 | 第54-62页 |
| 讨论 | 第62-71页 |
| 小结 | 第71-72页 |
| 第三部分 中国幽门螺杆菌前噬菌体遗传特征分析 | 第72-106页 |
| 前言 | 第72-75页 |
| 材料与方法 | 第75-78页 |
| 结果 | 第78-99页 |
| 讨论 | 第99-105页 |
| 小结 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-113页 |
| 综述 幽门螺杆菌基因组学研宄进展 | 第113-120页 |
| 参考文献 | 第117-120页 |
| 论文发表情况 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121页 |