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东方粘虫微卫星富集文库的构建与遗传标记筛选

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
第一章 文献综述第15-51页
 1 东方粘虫及其基本迁飞规律第15-17页
   ·东方粘虫分布与危害第15页
   ·东方粘虫研究现状第15-17页
 2 遗传标记及其在昆虫学研究中的应用第17-33页
   ·遗传标记概述第17-22页
     ·遗传标记分类第17页
     ·分子遗传标记简况第17-19页
     ·分子遗传标记在昆虫生态学研究中的作用第19-20页
     ·其它迁飞昆虫遗传标记应用情况第20-22页
   ·微卫星标记及其克隆方法第22-33页
     ·微卫星种类、分布和功能第22-23页
     ·微卫星变异第23-25页
     ·微卫星标记分离方法第25-28页
     ·微卫星基因座的多态性检测第28-31页
     ·微卫星标记克隆和检测中的问题第31-32页
     ·昆虫微卫星标记分离情况第32-33页
 3 本课题的提出和研究思路第33-35页
 参考文献第35-51页
第二章 基因组DNA提取第51-67页
 1 材料与方法第52-55页
   ·实验材料第52-53页
   ·CTAB+传统方法提取基因组DNA第53-54页
     ·虫体处理第53页
     ·组织裂解第53页
     ·苯酚抽提第53页
     ·乙醇沉淀第53-54页
     ·对比实验方案第54页
     ·精胺纯化DNA样品方法第54页
     ·DNA样品质量检测第54页
   ·用热NaOH溶液提取基因组DNA第54-55页
   ·DNA样品应用第55页
     ·微卫星富集文库的构建第55页
     ·扩增微卫星等位基因第55页
 2 结果与分析第55-61页
   ·传统方法与CTAB+传统方法提取DNA结果比较第55-56页
   ·CTAB+传统方法和热NaOH溶液法提取的DNA样品比较第56-58页
   ·不同组织用CTAB+传统方法提取DNA结果比较第58-59页
   ·CTAB+传统方法DNA提取量与样品用量的关系第59页
   ·在2 mL离心管中用CTAB+传统方法提取DNA的适宜组织用量第59页
   ·在0.2 mL离心管中用热NaOH法提取DNA的适宜处理时间第59-61页
   ·精胺纯化DNA样品的效果第61页
 3 讨论第61-63页
 参考文献第63-67页
第三章 东方粘虫微卫星富集文库的建立和抽样测序第67-77页
 1 材料和方法第67-69页
   ·实验材料第67页
   ·接头、引物和探针第67页
     ·接头和引物第67页
     ·生物素标记的探针第67页
   ·载体和菌株第67页
   ·主要试剂第67-68页
   ·微卫星富集文库的构建第68-69页
     ·基因组DNA提取和酶切第68页
     ·酶切片断加接头第68页
     ·磁珠亲和捕捉及扩增第68-69页
     ·微卫星富集DNA片断的克隆第69页
   ·连接转化效率的抽样鉴定第69页
   ·文库抽样测序和微卫星鉴别第69页
 2 结果与分析第69-73页
   ·基因组DNA酶切第69-70页
   ·酶切片断胶回收与连接头第70-71页
   ·磁珠捕捉和PCR扩增第71-72页
   ·微卫星富集片断的克隆第72页
   ·连接转化效率的检测第72页
   ·微卫星富集文库的抽样检测和微卫星鉴别第72-73页
 3 结论与讨论第73-75页
 参考文献第75-77页
第四章 粘虫基因组微卫星的主要特征和变异第77-91页
 1 材料和方法第77页
 2 结果与分析第77-86页
   ·粘虫基因组微卫星分布的基本特征第77-79页
   ·粘虫微卫星核心序列的变异第79-85页
     ·粘虫微卫星核心序列替换/缺失/插入基本特征第79-81页
     ·粘虫微卫星核心序列变异与其长度和基序的关系第81-84页
     ·粘虫微卫星核心序列变异的位置效应第84-85页
   ·粘虫微卫星家族和多拷贝微卫星基因座分析第85-86页
 3 结论与讨论第86-89页
 参考文献第89-91页
第五章 粘虫微卫星单拷贝基因座的筛选和基本特征第91-105页
 1 材料和方法第91-94页
   ·实验材料第91页
   ·主要仪器和试剂第91-92页
     ·仪器设备第91页
     ·化学试剂第91-92页
   ·筛选过程第92-94页
 2 结果与分析第94-99页
 3 结论与讨论第99-102页
 参考文献第102-105页
第六章 全文总结第105-109页
 1 主要结论第105-108页
   ·通过对比研究,发现CTAB方法提取DNA效果明显优于传统方法,而NaOH方法所得DNA样品可用于基因分型第105页
   ·利用磁珠富集法成功构建6个东方粘虫微卫星富集文库,抽样检测微卫星阳性克隆率较高第105-106页
   ·东方粘虫基因组三核苷酸基序微卫星占据优势,重复序列变异丰富且以替换发生频率最高第106-107页
   ·筛选出8个东方粘虫微卫星遗传标记,证明东方粘虫基因组中多态性微卫星基因座比例很低第107-108页
   ·8个微卫星标记具有较高多态性,适合作为分子遗传标记第108页
 2 讨论第108-109页
附录:前期研究中所用其它物种微卫星引物第109-111页
攻读学位期间发表论文第111-113页
致谢第113页

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