DNA序列中串联重复体查找算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·引言 | 第7-8页 |
| ·重复体查找的生物意义及研究现状 | 第8-11页 |
| ·重复体查找的生物意义 | 第8-9页 |
| ·重复体查找的研究现状 | 第9-11页 |
| ·本文的研究工作 | 第11页 |
| ·本文的章节安排 | 第11-13页 |
| 第二章 重复体查找方法 | 第13-19页 |
| ·重复体查找的数据结构 | 第13-16页 |
| ·后缀树 | 第13-14页 |
| ·改进的后缀树 | 第14-16页 |
| ·重复体查找算法介绍 | 第16-18页 |
| ·Tandem repeat finder | 第16-17页 |
| ·REPuter | 第17页 |
| ·ML算法 | 第17-18页 |
| ·本章小结 | 第18-19页 |
| 第三章 基于LZ分解的串联重复体查找方法 | 第19-31页 |
| ·基本概念 | 第19-20页 |
| ·基于LZ分解的串联重复体查找方法 | 第20-26页 |
| ·LZ分解及串联重复体在LZ分解块上的性质 | 第20-22页 |
| ·查找最左覆盖集 | 第22-24页 |
| ·标注串联重复体 | 第24页 |
| ·得到Occurrence集 | 第24-26页 |
| ·算法描述 | 第26-28页 |
| ·算法分析 | 第28-29页 |
| ·实验结果分析 | 第29-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第四章 基于海明距离查找进化串联重复体的算法 | 第31-45页 |
| ·基本概念 | 第31-33页 |
| ·基于海明距离查找进化串联重复体的算法 | 第33-38页 |
| ·计算等价类 | 第33页 |
| ·构造等价类图 | 第33-35页 |
| ·构造位置图 | 第35-37页 |
| ·求最大进化串联重复体 | 第37-38页 |
| ·HDETR算法描述 | 第38-41页 |
| ·算法分析 | 第41页 |
| ·实验结果分析 | 第41-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第五章 结束语 | 第45-47页 |
| 致谢 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 研究成果 | 第53页 |
