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粗粒化分子动力学—力场开发与应用

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-8页
第一章 绪论第8-24页
   ·引言第8-12页
   ·分子动力学模拟方法第12-21页
     ·计算机分子模拟技术概述第12-13页
     ·分子动力学简介第13-14页
     ·分子动力学的基本原理和算法第14-20页
     ·分子动力学的新发展第20-21页
   ·粗粒化分子动力学的简介和研究进展第21-23页
   ·本课题的研究内容和意义第23-24页
第二章 磷脂分子小球在水中的演化机理和控制方法-粗粒化分子动力学研究第24-45页
   ·研究背景第24-26页
     ·计算机模拟两亲性分子自组装行为第24页
     ·膜弹性理论简介第24-26页
   ·研究体系的构建方法和相关的模拟参数的设定第26-29页
     ·研究体系设计的基本思想第26页
     ·粗粒化分子动力学模拟的力场的选取第26-28页
     ·小球体系的初始态的搭建及模拟条件参数的设置第28-29页
   ·模拟的结果分析与讨论第29-44页
     ·平衡态结构形貌分析第29-34页
     ·平衡态能量分析第34-36页
     ·磷脂小球演化规律数学模型的建立和求解第36-41页
     ·模拟结果与理论模型的讨论第41-44页
   ·本章小结第44-45页
第三章 PNIPAM高分子单链体系粗粒化力场的建立方法的研究第45-56页
   ·粗粒化力场建立的基本思想和策略第45页
   ·PNIPAM单链真空体系下的粗粒化力场的建立步骤第45-52页
     ·PNIPAM单链体系的全原子力场模拟第45-47页
     ·PNIPAM单链粗粒化力场的计算(IBI方法)第47-52页
   ·粗粒化力场的检验和问题的讨论第52-55页
     ·粗粒化力场的检验第52-53页
     ·温度重现性问题及IBI方法的评价第53-55页
   ·本章小结第55-56页
第四章 结论与展望第56-58页
   ·结论第56-57页
   ·展望第57-58页
参考文献第58-66页
发表论文和科研情况说明第66-67页
致谢第67页

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