| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第13-17页 |
| 1.1 概述 | 第13页 |
| 1.2 纳米TiO_2简介 | 第13-14页 |
| 1.3 多头绒泡菌简介 | 第14页 |
| 1.4 转录组学简介 | 第14-15页 |
| 1.5 代谢组学简介 | 第15页 |
| 1.6 研究内容和意义 | 第15-17页 |
| 第二章 多头绒泡菌的培养及对纳米TiO_2耐受性初步研究 | 第17-23页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第17-19页 |
| 2.1.1 纳米TiO_2 | 第17页 |
| 2.1.2 多头绒泡菌 | 第17页 |
| 2.1.3 其它菌种 | 第17页 |
| 2.1.4 培养基 | 第17-19页 |
| 2.1.5 实验仪器 | 第19页 |
| 2.2 方法 | 第19-20页 |
| 2.2.1 多头绒泡菌的培养 | 第19页 |
| 2.2.2 nTiO_2的特性 | 第19-20页 |
| 2.2.3 nTiO_2胁迫培养 | 第20页 |
| 2.3 结果 | 第20-21页 |
| 2.3.1 三种微生物对n TiO_2的耐受性 | 第20-21页 |
| 2.4 讨论 | 第21页 |
| 2.5 结论 | 第21-23页 |
| 第三章 纳米TiO_2胁迫对多头绒泡菌生理生化水平的影响 | 第23-33页 |
| 3.1 材料与仪器 | 第23-24页 |
| 3.1.1 菌种 | 第23页 |
| 3.1.2 试剂 | 第23-24页 |
| 3.1.3 仪器 | 第24页 |
| 3.1.4 培养基 | 第24页 |
| 3.2 方法 | 第24-26页 |
| 3.2.1 nTiO_2胁迫培养多头绒泡菌 | 第24页 |
| 3.2.2 活性氧（ROS）水平的检测 | 第24页 |
| 3.2.3 过氧化氢酶的检测 | 第24-25页 |
| 3.2.4 8-羟基脱氧鸟苷的检测 | 第25页 |
| 3.2.5 多头绒泡菌总RNA的提取 | 第25-26页 |
| 3.2.6 将总RNA反转录成c DNA | 第26页 |
| 3.2.7 qPCR检测CAT基因的转录水平 | 第26页 |
| 3.2.8 统计分析 | 第26页 |
| 3.3 结果 | 第26-30页 |
| 3.3.1 nTiO_2对多头绒泡菌的胁迫作用 | 第26-27页 |
| 3.3.2 nTiO_2短期胁迫后多头绒泡菌的ROS和CAT水平 | 第27-28页 |
| 3.3.3 nTiO_2长期胁迫后多头绒泡菌的CAT和 8-OHd G水平 | 第28-30页 |
| 3.4 讨论 | 第30-31页 |
| 3.5 结论 | 第31-33页 |
| 第四章 纳米TiO_2胁迫对多头绒泡菌代谢水平的影响 | 第33-51页 |
| 4.1 材料与仪器 | 第33-34页 |
| 4.1.1 菌种 | 第33页 |
| 4.1.2 试剂 | 第33页 |
| 4.1.3 仪器 | 第33-34页 |
| 4.2 方法 | 第34-38页 |
| 4.2.1 GC-MS代谢组学分析样品的制备 | 第34页 |
| 4.2.2 GC-MS代谢组学分析样本前处理 | 第34页 |
| 4.2.3 GC-MS质控样本的选择 | 第34页 |
| 4.2.4 GC-MS的条件和数据采集 | 第34-35页 |
| 4.2.5 GC-MS数据预处理 | 第35页 |
| 4.2.6 GC-MS多元统计分析 | 第35-36页 |
| 4.2.7 GC-MS差异代谢物的筛选 | 第36-37页 |
| 4.2.8 LC-MS代谢组学分析样品的制备 | 第37页 |
| 4.2.9 LC-MS代谢组学分析样品的制备 | 第37页 |
| 4.2.10 液相色谱-质谱分析条件 | 第37页 |
| 4.2.11 LC-MS数据预处理 | 第37-38页 |
| 4.2.12 LC-MS多元统计分析 | 第38页 |
| 4.2.13 LC-MS差异代谢物的筛选 | 第38页 |
| 4.3 结果 | 第38-47页 |
| 4.3.1 GC-MS色谱图 | 第38-41页 |
| 4.3.2 GC-MS样品PCA和OPLSD-DA评分图 | 第41-42页 |
| 4.3.3 GC-MS差异代谢物的筛选 | 第42-45页 |
| 4.3.4 LC-MS样品PCA和OPLSD-DA评分图 | 第45页 |
| 4.3.5 LC-MS差异代谢物的筛选 | 第45-46页 |
| 4.3.6 简易代谢网络图的绘制 | 第46-47页 |
| 4.4 讨论 | 第47-50页 |
| 4.5 结论 | 第50-51页 |
| 第五章 纳米TiO_2胁迫对多头绒泡菌转录水平的影响 | 第51-89页 |
| 5.1 材料与仪器 | 第51-52页 |
| 5.1.1 菌种 | 第51页 |
| 5.1.2 试剂 | 第51页 |
| 5.1.3 仪器 | 第51-52页 |
| 5.2 方法 | 第52-63页 |
| 5.2.1 nTiO_2胁迫培养多头绒泡菌 | 第52页 |
| 5.2.2 多头绒泡菌总RNA的提取 | 第52页 |
| 5.2.3 总RNA质量检测 | 第52页 |
| 5.2.4 样品RNA测序 | 第52-53页 |
| 5.2.5 标准信息分析流程图 | 第53-54页 |
| 5.2.6 测序结果评估 | 第54页 |
| 5.2.7 基因统计 | 第54页 |
| 5.2.8 样品间差异mRNA分析 | 第54-55页 |
| 5.2.9 GO富集分析 | 第55页 |
| 5.2.10 KEGG Pathway分析 | 第55-56页 |
| 5.2.11 样品间差异lnc RNA分析 | 第56页 |
| 5.2.12 Real-Time PCR验证转录组测序 | 第56-58页 |
| 5.2.13 样品miRNA测序 | 第58-59页 |
| 5.2.14 信息分析概述 | 第59-60页 |
| 5.2.15 数据处理 | 第60页 |
| 5.2.16 标准数据分析 | 第60-62页 |
| 5.2.17 miRNA表达分析 | 第62-63页 |
| 5.2.18 miRNA靶基因预测 | 第63页 |
| 5.2.19 样品间差异表达miRNA靶基因富集分析 | 第63页 |
| 5.3 结果 | 第63-86页 |
| 5.3.1 样品总RNA提取结果 | 第63-64页 |
| 5.3.2 测序质量评估 | 第64-67页 |
| 5.3.3 基因表达统计 | 第67页 |
| 5.3.4 基因覆盖度统计 | 第67-69页 |
| 5.3.5 样品间差异mRNA统计 | 第69-71页 |
| 5.3.6 样品间差异基因GO功能显著性富集分析 | 第71-72页 |
| 5.3.7 样品间差异基因KEGG Pathway显著性富集分析 | 第72-74页 |
| 5.3.8 样品间差异lnc RNA统计 | 第74-76页 |
| 5.3.9 Real-Time PCR验证结果 | 第76-77页 |
| 5.3.10 小RNA测序质量评估 | 第77页 |
| 5.3.11 比对Gen Bank | 第77-80页 |
| 5.3.12 已知miRNA鉴定 | 第80页 |
| 5.3.13 新miRNA鉴定 | 第80-81页 |
| 5.3.14 tag分类注释 | 第81-82页 |
| 5.3.15 miRNA差异表达分析 | 第82-83页 |
| 5.3.16 miRN靶基因预测 | 第83页 |
| 5.3.17 样品间差异表达miRNA靶基因GO富集分析 | 第83-85页 |
| 5.3.18 样品间差异表达miRNA靶基因KEGG富集分析 | 第85-86页 |
| 5.4 讨论 | 第86-88页 |
| 5.5 结论 | 第88-89页 |
| 总结 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-99页 |
| 附录 | 第99-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第103页 |
