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玉米单倍体诱导效应分析与机器学习在DH技术中的应用

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
缩略词表第9-10页
第一章 文献综述第10-28页
    1.1 玉米母本单倍体诱导研究进展第10-15页
        1.1.1 玉米诱导系选育及诱导率相关研究第10-14页
        1.1.2 母本可诱导性的研究第14-15页
        1.1.3 通过改造CENH3诱导母本单倍体第15页
    1.2 单倍体鉴别方法综述第15-18页
    1.3 单倍体自然加倍综述第18-19页
    1.4 数量性状遗传研究概述第19-20页
        1.4.1 连锁分析定位QTL第19-20页
        1.4.2 全基因组关联分析第20页
    1.5 近红外光谱分析研究进展第20-22页
    1.6 机器学习及其常用算法第22-26页
        1.6.1 线性判别方法第22-24页
        1.6.2 非线性判别方法第24-26页
    1.7 研究目的及意义第26-28页
第二章 母本单倍体可诱导性定位第28-49页
    2.1 引言第28页
    2.2 材料与方法第28-32页
        2.2.1 实验材料第28页
        2.2.2 实验设计第28-29页
        2.2.3 表型测量与数据分析第29-30页
        2.2.4 DNA提取与基因分型第30-31页
        2.2.5 遗传连锁图谱构建第31页
        2.2.6 QTL定位第31-32页
    2.3 结果第32-42页
        2.3.1 亲本选择及DH群体的构建第32-34页
        2.3.2 表型数据校正第34-36页
        2.3.3 DH群体在四个环境下的表现第36-39页
        2.3.4 DH群体基因型分析第39-41页
        2.3.5 QTL定位结果分析第41-42页
    2.4 讨论第42-49页
        2.4.1 母本可诱导性的遗传特点第42-43页
        2.4.2 环境对母本可诱导性的影响第43页
        2.4.3 群体大小和分子标记密度对定位结果的影响第43-44页
        2.4.4 母本可诱导性QTL定位的应用第44-49页
第三章 父母本遗传距离与单倍体诱导率的关系第49-57页
    3.1 引言第49页
    3.2 材料与方法第49-50页
        3.2.1 实验材料第49页
        3.2.2 表型与基因型第49页
        3.2.3 基因型数据的分析第49-50页
    3.3 结果第50-55页
        3.3.1 三个诱导系的诱导率第50-53页
        3.3.2 全基因组遗传距离分析第53-54页
        3.3.3 遗传距离与诱导率的关系第54-55页
    3.4 结论与讨论第55-57页
第四章 诱导率QTL qhir8的效应分析第57-64页
    4.1 引言第57页
    4.2 材料与方法第57-59页
        4.2.1 实验材料第57-58页
        4.2.2 基因分型第58-59页
    4.3 结果分析第59-62页
        4.3.1 染色体片段代换系的筛选第59-60页
        4.3.2 qhir8的效应分析第60-62页
    4.4 讨论第62-64页
第五章 利用机器学习鉴别单倍体第64-85页
    5.1 引言第64页
    5.2 材料与方法第64-67页
        5.2.1 实验材料第64-65页
        5.2.2 近红外光谱数据的采集与光谱预处理第65页
        5.2.3 单倍体的田间鉴定第65-66页
        5.2.4 运用机器学习算法构建单倍体预测模型第66-67页
    5.3 结果第67-82页
        5.3.1 单倍体田间鉴定结果第67-68页
        5.3.2 单倍体与杂合二倍体近红外光谱特征第68-70页
        5.3.3 利用不同算法构建单倍体鉴别模型第70-77页
        5.3.4 模型效果对比第77-79页
        5.3.5 几种模型在测试数据中的表现第79-80页
        5.3.6 不同光谱预处理方法对模型准确率的影响第80页
        5.3.7 不同数据集模型预测效果比较第80-81页
        5.3.8 近红外鉴别单倍体的优势第81-82页
    5.4 讨论第82-85页
        5.4.1 单倍体鉴定方法的比较第82-83页
        5.4.2 机器学习近红外鉴定单倍体的优势第83页
        5.4.3 机器学习鉴定单倍体的影响因素第83-84页
        5.4.4 机器学习鉴别单倍体的应用第84-85页
第六章 机器学习在单倍体雄穗自然加倍和DH选择中的应用第85-94页
    6.1 引言第85页
    6.2 实验材料与方法第85-86页
        6.2.1 单倍体自然加倍预测第85-86页
        6.2.2 DH系粒重的选择第86页
    6.3 实验结果第86-92页
        6.3.1 单倍体自然加倍田间调查结果第87页
        6.3.2 机器学习预测单倍体自然加倍第87-88页
        6.3.3 DH系粒重分布第88页
        6.3.4 DH系光谱预测可行性分析第88-91页
        6.3.5 DH系基因型预测粒重第91页
        6.3.6 机器学习DH系籽粒近红外光谱预测粒重第91-92页
    6.4 讨论第92-94页
第七章 全文结论与讨论第94-96页
参考文献第96-106页
致谢第106-107页
作者简历第107-108页
附录第108-117页

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