| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 缩略语表 | 第16-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-28页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第18-19页 |
| 1.2 池塘氮循环研究进展 | 第19-22页 |
| 1.2.1 微生物氮固定作用 | 第19-20页 |
| 1.2.2 微生物硝化作用 | 第20-21页 |
| 1.2.3 微生物厌氧氨氧化作用 | 第21页 |
| 1.2.4 微生物反硝化作用 | 第21-22页 |
| 1.2.5 微生物硝酸盐异化还原成铵作用 | 第22页 |
| 1.3 生物絮团技术研究进展 | 第22-25页 |
| 1.3.1 生物絮团技术提高养殖水质 | 第23-24页 |
| 1.3.2 生物絮团技术提高鱼产量 | 第24-25页 |
| 1.3.3 生物絮团技术提高鱼类免疫力 | 第25页 |
| 1.4 生物絮团反应器研究进展 | 第25-27页 |
| 1.4.1 生物絮团反应器处理养殖废水 | 第26页 |
| 1.4.2 生物絮团反应器处理养殖固体废物 | 第26-27页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 第二章 养殖池塘氮循环特征 | 第28-50页 |
| 2.1 前言 | 第28-29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-37页 |
| 2.2.1 池塘环境 | 第29-30页 |
| 2.2.2 样本采集 | 第30-31页 |
| 2.2.3 碳、氮化合物测定 | 第31页 |
| 2.2.4 DNA提取、文库构建和宏基因组测序分析 | 第31-32页 |
| 2.2.5 DNA序列分析 | 第32-35页 |
| 2.2.6 物种分类学注释、COG和KEGG功能注释 | 第35-36页 |
| 2.2.7 N循环功能分析 | 第36页 |
| 2.2.8 数据评估和统计分析方法 | 第36-37页 |
| 2.3 实验结果 | 第37-47页 |
| 2.3.1 采样池塘环境 | 第37-38页 |
| 2.3.2 微生物群落的分层 | 第38-42页 |
| 2.3.3 微生物过程(COG)的分层 | 第42页 |
| 2.3.4 氮营养循环的分层 | 第42-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-49页 |
| 2.5 结论 | 第49-50页 |
| 第三章 养殖池塘碳循环特征 | 第50-63页 |
| 3.1 前言 | 第50-51页 |
| 3.2 材料与方法 | 第51-52页 |
| 3.2.1 池塘环境 | 第51页 |
| 3.2.2 样本采集 | 第51页 |
| 3.2.3 DNA提取、文库构建和宏基因组测序分析 | 第51页 |
| 3.2.4 DNA序列分析 | 第51页 |
| 3.2.5 KEGG功能注释 | 第51页 |
| 3.2.6 C循环功能分析 | 第51-52页 |
| 3.2.7 数据评估和统计分析 | 第52页 |
| 3.3 实验结果 | 第52-57页 |
| 3.3.1 微生物过程(KEGG)的分层 | 第52-53页 |
| 3.3.2 碳营养循环的分层 | 第53-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-62页 |
| 3.5 结论 | 第62-63页 |
| 第四章 不同有机碳源对生物絮团系统水质、微生物群落和结构的影响 | 第63-87页 |
| 4.1 前言 | 第63-64页 |
| 4.2 材料和方法 | 第64-70页 |
| 4.2.1 实验设计 | 第64-65页 |
| 4.2.2 水质参数评估 | 第65-66页 |
| 4.2.3 生长参数评估 | 第66页 |
| 4.2.4 生物絮团参数和形态结构 | 第66页 |
| 4.2.5 DNA提取和Illumina MiSeq测序 | 第66-68页 |
| 4.2.6 生物多样性分析和系统发育分类 | 第68-69页 |
| 4.2.7 统计分析 | 第69-70页 |
| 4.3 实验结果 | 第70-82页 |
| 4.3.1 水质特征 | 第70-73页 |
| 4.3.2 生长性能 | 第73-74页 |
| 4.3.3 生物絮团调查 | 第74-75页 |
| 4.3.4 丰度和多样性指数 | 第75-78页 |
| 4.3.5 添加不同有机碳的生物絮团系统细菌差异 | 第78-82页 |
| 4.4 讨论 | 第82-86页 |
| 4.5 结论 | 第86-87页 |
| 第五章 生物絮团反应器中的微生物群落结构及氮移除机制 | 第87-110页 |
| 5.1 前言 | 第87-88页 |
| 5.2 材料与方法 | 第88-93页 |
| 5.2.1 反应器设计和运行 | 第88-90页 |
| 5.2.2 潜在氨氧化速率测定 | 第90页 |
| 5.2.3 采样,DNA提取和Illumina MiSeq测序 | 第90-92页 |
| 5.2.4 生物多样性分析和系统发育分类 | 第92-93页 |
| 5.2.5 其它的分析方法 | 第93页 |
| 5.3 实验结果 | 第93-106页 |
| 5.3.1 生物絮团反应器系统处理合成污水的性能 | 第93-95页 |
| 5.3.2 潜在氨氧化速率 | 第95-96页 |
| 5.3.3 细菌群落多样性 | 第96-98页 |
| 5.3.4 细菌群落结构的演化 | 第98-106页 |
| 5.4 讨论 | 第106-109页 |
| 5.5 结论 | 第109-110页 |
| 第六章 全文小结及展望 | 第110-113页 |
| 6.1 全文小结 | 第110-112页 |
| 6.2 展望 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-138页 |
| 附录Ⅰ 实验筛选的碳氮功能基因 | 第138-141页 |
| 附录Ⅱ 在读期间研究成果 | 第141-142页 |
| 致谢 | 第142-144页 |
