| 摘要 | 第2-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 第一部分 山东地区啮齿类动物病毒宏基因组 | 第11-29页 |
| 1 实验材料 | 第11页 |
| 1.1 实验试剂 | 第11页 |
| 1.2 实验耗材与仪器 | 第11页 |
| 1.3 生物信息软件 | 第11页 |
| 2 实验方法 | 第11-16页 |
| 2.1 样品收集 | 第11-12页 |
| 2.2 肠道内容物和组织样品预处理 | 第12-13页 |
| 2.3 样品组合设计 | 第13页 |
| 2.4 样品核酸酶消化 | 第13页 |
| 2.5 病毒RNA提取(Trizol提取) | 第13-14页 |
| 2.6 病毒RNA提取(QLAampMinEluteVirusSpinKit试剂盒) | 第14页 |
| 2.7 Hiseq2500高通量测序 | 第14页 |
| 2.8 测序后的生物信息学分析 | 第14-16页 |
| 3 实验结果 | 第16-27页 |
| 3.1 样品检测结果 | 第16-17页 |
| 3.2 山东鼠病毒宏基因组分析结果 | 第17-27页 |
| 4 讨论 | 第27-29页 |
| 第二部分 山东地区啮齿类动物新病毒研究 | 第29-71页 |
| 1 实验材料 | 第30-32页 |
| 1.1 样品来源 | 第30-31页 |
| 1.2 试剂和耗材 | 第31-32页 |
| 1.3 溶液配制 | 第32页 |
| 1.4 实验仪器 | 第32页 |
| 1.5 实验细胞和动物 | 第32页 |
| 1.6 生物信息学软件 | 第32页 |
| 2 实验方法 | 第32-49页 |
| 2.1 潜在有意义新病毒的鉴定 | 第32-39页 |
| 2.2 病毒核酸提取 | 第39-40页 |
| 2.3 病毒RNA反转录 | 第40页 |
| 2.4 病毒全基因组扩增 | 第40-46页 |
| 2.5 细胞复苏 | 第46页 |
| 2.6 细胞传代 | 第46-47页 |
| 2.7 病毒接种和培养 | 第47页 |
| 2.8 病毒定量 | 第47-48页 |
| 2.9 构建进化树 | 第48-49页 |
| 3 实验结果 | 第49-68页 |
| 3.1 温州病毒变异株(G107) | 第49-56页 |
| 3.2 野生鼠诺如病毒变异株(SDHD46) | 第56-61页 |
| 3.3 札如病毒(S4-82) | 第61-63页 |
| 3.4 博卡病毒(S9-108) | 第63-68页 |
| 4 讨论 | 第68-71页 |
| 结论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 综述 | 第77-85页 |
| 综述参考文献 | 第82-85页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第85-86页 |
| 缩略词表(附录) | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |