| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-33页 |
| 1.1 拟南芥的研究价值 | 第13-21页 |
| 1.1.1 拟南芥生物学特性 | 第13-14页 |
| 1.1.2 拟南芥作为模式植物的优势 | 第14-15页 |
| 1.1.3 拟南芥突变体的遗传筛选 | 第15-16页 |
| 1.1.4 拟南芥基因的图位克隆 | 第16-19页 |
| 1.1.5 研究拟南芥的意义 | 第19-21页 |
| 1.2 植物的免疫系统 | 第21-27页 |
| 1.2.1 PAMP 激活免疫 | 第22-23页 |
| 1.2.2 Effector 激活免疫 | 第23-26页 |
| 1.2.3 过敏性坏死反应和系统获得性抗性 | 第26页 |
| 1.2.4 线粒体与植物免疫系统 | 第26-27页 |
| 1.3 生物信息学分析 | 第27-30页 |
| 1.3.1 拟南芥和番茄基因组数据库 | 第27-28页 |
| 1.3.2 序列比对及系统发生分析 | 第28页 |
| 1.3.3 DNA 微阵列基因表达谱数据库 | 第28-29页 |
| 1.3.4 蛋白质的分析 | 第29-30页 |
| 1.4 本研究的背景、目的和意义 | 第30-33页 |
| 第二章 MUSE5/TXR1/AtPAM16 的图位克隆及功能研究 | 第33-50页 |
| 2.1 试验材料 | 第33页 |
| 2.2 试验方法 | 第33-37页 |
| 2.2.1 muse 突变体遗传筛选 | 第33页 |
| 2.2.2 基因表达分析 | 第33-34页 |
| 2.2.3 病原菌感染试验 | 第34页 |
| 2.2.4 图位克隆及 Illumina 全基因组重测序 | 第34页 |
| 2.2.5 转基因互补试验 | 第34-35页 |
| 2.2.6 酵母互补试验 | 第35页 |
| 2.2.7 激光共聚焦显微照相 | 第35页 |
| 2.2.8 线粒体分离及蛋白酶 K 消化 | 第35页 |
| 2.2.9 冷冻固定及免疫金标记 | 第35-36页 |
| 2.2.10 Allelism 检测及突变体的构建 | 第36页 |
| 2.2.11 GUS 染色 | 第36页 |
| 2.2.12 DAB 染色 | 第36页 |
| 2.2.13 ROS 的测定 | 第36-37页 |
| 2.3 试验结果 | 第37-47页 |
| 2.3.1 三突变体 muse5-1 mos4 snc1 的抗病特性 | 第37-38页 |
| 2.3.2 muse5-1 的图位克隆 | 第38-39页 |
| 2.3.3 MUSE5 是 At3g59280 的验证 | 第39-40页 |
| 2.3.4 MUSE5 与酵母 PAM16 同源 | 第40-42页 |
| 2.3.5 MUSE5/AtPAM16 定位于线粒体内膜 | 第42-45页 |
| 2.3.6 单突变体 AtPam16 的免疫反应特性 | 第45页 |
| 2.3.7 AtPam16-1 和 AtPam16-2 可以增强 snc1 介导的免疫反应 | 第45-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-50页 |
| 第三章 MUSE10 的图位克隆及初步功能研究 | 第50-60页 |
| 3.1 试验材料 | 第50页 |
| 3.2 试验方法 | 第50-53页 |
| 3.2.1 muse 突变体遗传筛选 | 第50页 |
| 3.2.2 拟南芥的种植 | 第50-51页 |
| 3.2.3 病原菌感染试验 | 第51页 |
| 3.2.4 DNA 提取、PCR 及琼脂糖凝胶电泳 | 第51页 |
| 3.2.5 GUS 染色 | 第51页 |
| 3.2.6 分子标记及引物设计 | 第51-52页 |
| 3.2.7 拟南芥转基因 | 第52-53页 |
| 3.2.8 突变体的构建 | 第53页 |
| 3.3 试验结果 | 第53-59页 |
| 3.3.1 三突变体 muse10-1 mos2 snc1 的抗病反应 | 第53-54页 |
| 3.3.2 MUSE10 的图位克隆及全基因重测序 | 第54-56页 |
| 3.3.3 Allelism test 验证 MUSE10 | 第56-57页 |
| 3.3.4 单突变体筛选及其抗病性检测 | 第57-58页 |
| 3.3.5 muse10-2 snc1 双突变体的构建及其抗病性鉴定 | 第58页 |
| 3.3.6 转基因 MUSE10-GFP 到 Col、muse10-2 和 snc1 | 第58-59页 |
| 3.4 讨论 | 第59-60页 |
| 第四章 番茄及其他植物中 Pam18 和 Pam16 同源蛋白分析 | 第60-74页 |
| 4.1 材料与方法 | 第60-62页 |
| 4.1.1 植物中 Pam18 和 Pam16 同源蛋白的鉴定 | 第60页 |
| 4.1.2 多重序列比对和系统发生树 | 第60页 |
| 4.1.3 氨基酸组成和蛋白疏水性分析 | 第60页 |
| 4.1.4 跨膜结构域预测和功能位点分析 | 第60-61页 |
| 4.1.5 亚细胞定位预测 | 第61页 |
| 4.1.6 DNA 微距阵基因表达数据分析 | 第61页 |
| 4.1.7 植物材料及试验描述 | 第61-62页 |
| 4.2 试验结果 | 第62-73页 |
| 4.2.1 植物中 Pam18 和 Pam16 同源蛋白的筛选 | 第62页 |
| 4.2.2 植物中 Pam18 和 Pam16 的系统进化树 | 第62-64页 |
| 4.2.3 Pam18 和 Pam16 的氨基酸序列多重比对 | 第64页 |
| 4.2.4 氨基酸组成和功能位点分析 | 第64-66页 |
| 4.2.5 疏水性分析 | 第66页 |
| 4.2.6 跨膜结构域预测 | 第66-67页 |
| 4.2.7 亚细胞定位预测 | 第67-70页 |
| 4.2.8 AtPam18 和 AtPam16 基因表达分析 | 第70-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-74页 |
| 第五章 番茄 PHD 锌指基因家族及蛋白分析 | 第74-87页 |
| 5.1 材料与方法 | 第75-76页 |
| 5.1.1 搜索编码 PHD 锌指蛋白的基因 | 第75页 |
| 5.1.2 基因注释和蛋白结构域组成 | 第75页 |
| 5.1.3 PHD 锌指结构域的多重序列比对 | 第75页 |
| 5.1.4 番茄 PHD 锌指蛋白家族的进化分析 | 第75页 |
| 5.1.5 番茄 PHD 锌指蛋白家族细胞核定位预测 | 第75页 |
| 5.1.6 植物材料及基因表达 | 第75-76页 |
| 5.2 试验结果 | 第76-85页 |
| 5.2.1 番茄中编码 PHD 锌指蛋白的基因及其染色体分布 | 第76-78页 |
| 5.2.2 番茄 PHD 锌指蛋白氨基酸序列多重比对 | 第78-79页 |
| 5.2.3 番茄 PHD 锌指蛋白保守结构域的组成 | 第79-81页 |
| 5.2.4 番茄 PHD 锌指基因的进化 | 第81-82页 |
| 5.2.5 番茄 PHD 锌指蛋白的细胞核定位预测 | 第82页 |
| 5.2.6 不同器官组织及不同发育时期 PHD 锌指基因的表达 | 第82-83页 |
| 5.2.7 不同胁迫下 PHD 锌指基因的表达 | 第83-84页 |
| 5.2.8 番茄 Micro-Tom PHD 锌指基因的表达 | 第84-85页 |
| 5.3 讨论 | 第85-87页 |
| 第六章 结论 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-97页 |
| 附录 | 第97-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 作者简介 | 第100页 |
