| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 符号表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-14页 |
| 1.2 沼气发酵过程 | 第14-15页 |
| 1.3 沼气发酵微生物研究现状 | 第15-19页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第21-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-25页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第21-25页 |
| 2.1.1.1 江苏和上海样品的采集 | 第21-22页 |
| 2.1.1.2 全国沼气发酵样品的采集 | 第22-25页 |
| 2.1.2 主要试剂和试剂盒 | 第25页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第25页 |
| 2.2 研究方法 | 第25-36页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第25-30页 |
| 2.2.1.1 PowerSoil试剂盒提取DNA | 第26-28页 |
| 2.2.1.2 FastDNA试剂盒提取DNA | 第28-30页 |
| 2.2.2 Illumina PCR-Free文库构建 | 第30-35页 |
| 2.2.3 Illumina测序 | 第35页 |
| 2.2.4 生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 第三章 不同实验条件及发酵底物对沼气发酵微生物的影响 | 第36-56页 |
| 3.1 引言 | 第36-37页 |
| 3.2 结果与分析 | 第37-54页 |
| 3.2.1 样品总DNA的提取 | 第37-38页 |
| 3.2.2 测序数据组装与注释 | 第38-43页 |
| 3.2.2.1 测序数据统计 | 第38-40页 |
| 3.2.2.2 测序数据预处理 | 第40-41页 |
| 3.2.2.3 测序数据组装 | 第41-42页 |
| 3.2.2.4 基因预测和注释 | 第42-43页 |
| 3.2.3 不同样品起始量对沼气发酵微生物的影响 | 第43-48页 |
| 3.2.3.1 不同样品起始量对DNA得率和纯度的影响 | 第44-45页 |
| 3.2.3.2 不同样品起始量对微生物的影响 | 第45-48页 |
| 3.2.4 不同细胞破碎方法对沼气发酵微生物的影响 | 第48-50页 |
| 3.2.5 不同试剂盒对沼气发酵微生物的影响 | 第50-53页 |
| 3.2.5.1 不同DNA提取试剂盒对DNA得率和纯度的影响 | 第50-51页 |
| 3.2.5.2 不同DNA提取试剂盒对微生物的影响 | 第51-53页 |
| 3.2.6 不同底物发酵液体中沼气发酵微生物的差异 | 第53-54页 |
| 3.3 本章小结 | 第54-56页 |
| 第四章 沼气发酵微生物基因集的构建 | 第56-62页 |
| 4.1 引言 | 第56-57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-61页 |
| 4.2.1 沼气发酵工程在全国的分布 | 第57-58页 |
| 4.2.2 沼气发酵底物的种类 | 第58-59页 |
| 4.2.3 测序数据预处理 | 第59-61页 |
| 4.2.4 下一步研究计划 | 第61页 |
| 4.3 本章小结 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 个人简历 | 第70-71页 |
| 博士期间主要学术成果 | 第71-73页 |
| 博士后期间主要学术成果 | 第73-74页 |
| 永久通信地址 | 第74页 |
