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链霉菌噬菌体φBT1整合酶介导位点特异性重组系统的催化机理及其在合成生物学中的应用

部分缩略词表第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 位点特异性重组系统的机理及应用研究综述第13-55页
 引言第13页
 1 前言第13-14页
 2 位点特异性重组系统的来源和分类第14-16页
 3 位点特异性重组系统的反应机理研究第16-27页
   ·识别位点的结构与构象第17-19页
   ·重组反应的分子机理第19-23页
   ·重组酶的结构域与杂合酶改造第23-27页
 4 位点特异性重组系统的应用第27-38页
   ·位点特异性重组酶做为工具酶的体外应用第27-28页
   ·位点特异性重组酶在体内遗传操作中的应用第28-34页
   ·多重重组及多种重组酶的联合应用第34-36页
   ·位点特异性重组系统体内应用存在的一些问题第36-38页
 5 结语和展望第38-39页
 参考文献第39-55页
第二章 噬菌体φBT1整合酶介导体外位点特异性重组系统的建立第55-89页
 1 前言第55-57页
 2 材料和方法第57-74页
   ·实验材料第57-64页
   ·实验方法第64-74页
 3 实验结果第74-82页
   ·φBT1整合酶的表达与纯化第74-75页
   ·φBT1整合酶高效介导体外位点特异性重组第75-76页
   ·重组反应的优化条件第76-79页
   ·重组反应的方向性控制第79-80页
   ·反应所需的最小位点第80-82页
 4 小结与讨论第82-84页
 参考文献第84-89页
第三章 φBT1整合酶催化位点特异性重组的生化机理第89-129页
 1 前言第89-90页
 2 材料和方法第90-109页
   ·实验材料第90-98页
   ·实验方法第98-109页
 3 实验结果第109-122页
   ·DNA切割起始独立于联会复合体的形成第109-112页
   ·φBT1整合酶可催化单底物拓扑结构之改变第112-114页
   ·含有不同核心之底物之间的重组受到抑制第114-116页
   ·相同突变核心的底物参与反应效率与野生型相当第116-117页
   ·核心突变会导致底物反向平行配对并发生重组第117-119页
   ·整合酶四聚体可与attP先形成整合体随后捕获attB第119-122页
 4 小结与讨论第122-124页
 参考文献第124-129页
第四章 埃博霉素生物合成及异源表达研究综述第129-151页
 1 前言第129-130页
 2 埃博霉素的发现及基本特性第130-135页
   ·埃博霉素的发现与应用第130-132页
   ·埃博霉素的发酵分离及基本物理化学性质第132-135页
 3 埃博霉素的生物合成第135-138页
 4 埃博霉素的异源表达与遗传改造第138-141页
 5 埃博霉素的临床研究第141-142页
 致谢第142页
 参考文献第142-151页
第五章 埃博霉素生物合成基因簇的串联重组拼装第151-187页
 1 前言第151-153页
 2 材料和方法第153-172页
   ·实验材料第153-161页
   ·实验方法第161-172页
 3 实验结果第172-180页
   ·"入门载体"的设计和构建第172-174页
   ·"入门克隆"的构建第174页
   ·epoD的串联重组拼装第174-177页
   ·全长epothilones生物合成基因簇的拼装第177-180页
 4 小结与讨论第180-183页
 参考文献第183-187页
全文总结与展望第187-191页
学术论文、会议摘要及专利申请第191-193页
致谢第193-195页

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