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橙色粘球菌type Ⅳ pilus蛋白间的相互作用暨Na~+/H~+ antiporter和外膜蛋白影响盐环境下多细胞行为的遗传分析

目录第4-9页
TABLE OF CONTENTS第9-13页
摘要第13-17页
Abstract第17-21页
第一章 前言第24-44页
    1.1 Myxococcus xanthus的多细胞行为综述第24-26页
    1.2 Myxococcus xanthus在固体界面的滑动运动第26-34页
        1.2.1 S运动系统第27-34页
        1.2.2 A运动系统第34页
    1.3 运动的调节系统第34-40页
        1.3.1 Dif化感系统第34-36页
        1.3.2 Frz化感系统第36-40页
    1.4 海洋耐盐粘细菌(Myxococcus fulvus HW-1)的生存模式简述第40-42页
        1.4.1 海洋耐盐粘细菌(Myxococcus fulvus HW-1)的社会性行为第40-41页
        1.4.2 HW-1环境适应性进化生活模式转换的机制研究第41-42页
    1.5 论文工作的开展思路以及研究内容第42-44页
第二章 橙色粘细菌遗传学方法检测type Ⅳ pilus PilM/N/O/P/Q复合物第44-66页
    2.1 实验材料第45-50页
        2.1.1 菌株及质粒第45-47页
        2.1.2 培养基第47页
        2.1.3 实验试剂及仪器耗材第47-50页
    2.2 试验方法第50-55页
        2.2.1 目的基因缺失载体的构建流程第50-51页
        2.2.2 M. xanthus DK1622的电转化及突变株的筛选纯化第51-52页
        2.2.3 目的基因的异源回补及示意图第52页
        2.2.4 敲除突变株中的点突变置换第52-54页
        2.2.5 运动能力分析第54页
        2.2.6 胞外多糖分析第54-55页
    2.3 结果与分析第55-64页
        2.3.1 Myxococcus xanthus中Type Ⅳ pilus系统的作用第55页
        2.3.2 pilM/N/O/P/Q敲除突变株回补表型第55-57页
        2.3.3 pilB~*能够抑制pilG/H/I敲除突变株EPS缺失但不抑制pilM/N/O/P/Q/C敲除突变株EPS的缺失第57-64页
    2.4 小章总结第64-66页
第三章 Type Ⅳ pili蛋白间的直接相互作用第66-102页
    3.1 实验材料第67-75页
        3.1.1 菌株及质粒第67-72页
        3.1.2 培养基第72-73页
        3.1.3 实验试剂第73-75页
        3.1.4 实验仪器及耗材第75页
    3.2 试验方法第75-81页
        3.2.1 酵母双杂和细菌双杂的质粒构建第75-76页
        3.2.2 酵母转化或者共转化实验第76-78页
        3.2.3 酵母mating方式获得二倍体细胞第78页
        3.2.4 酵母转化子β-半乳糖苷酶活性分析(ONPG作为底物)第78-79页
        3.2.5 酵母转化replica复制平板的方法第79页
        3.2.6 酵母三杂交系统检测三个蛋白间的相互作用第79-80页
        3.2.7 稀释点板试验第80页
        3.2.8 细菌双杂交检测蛋白相互作用的步骤第80-81页
    3.3 实验结果第81-100页
        3.3.1 酵母双杂交检测M. xanthus Type Ⅳ pili蛋白间相互作用第81-89页
        3.3.2 酵母三杂交检测M. xanthus Type Ⅳ pili蛋白可能相互作用第89-90页
        3.3.3 M. xanthus PilC蛋白的相互作用检测第90-93页
        3.3.4 细菌双杂交系统检测M. xanthus PilM,PilN,PilT和PilB蛋白相互作用第93-95页
        3.3.5 Thermus thermophilus PilN/O/P/Q蛋白相互作用的发现和验证第95-100页
    3.4 本章小结第100-102页
第四章 Myxococcus fulvus HW-1和Myxococcus xanthus预测的Na~+/H~+ antiportercluster的功能分析第102-130页
    4.1 实验材料第103-108页
        4.1.1 菌株及质粒第103-104页
        4.1.2 培养基第104-105页
        4.1.3 实验试剂及仪器第105-108页
    4.2 试验方法第108-113页
        4.2.1 运动能力分析第108-109页
        4.2.2 胞外多糖分析第109页
        4.2.3 发育能力的分析第109-110页
        4.2.4 细胞胞外多糖染料结合实验第110页
        4.2.5 Southern杂交插入位点的验证第110-111页
        4.2.6 RT-PCR实验第111页
        4.2.7 Q-PCR实验第111-112页
        4.2.8 敲除突变株的获得第112-113页
        4.2.9 生长曲线的测定方法第113页
        4.2.10 死活孢子染色实验第113页
    4.3 实验结果和分析第113-127页
        4.3.1 HW-1突变株社会学行为能力分析第113-116页
        4.3.2 HW-1突变株插入位点的确定以及插入单一性的验证第116-117页
        4.3.3 YLH0402插入转座子对插入基因以及上下游基因的影响第117-118页
        4.3.4 YLH0402突变株发育阶段的LILAB_27425表达水平的初步分析第118-119页
        4.3.5 DK1622中与HW-1的LILAB_27425同源基因的比较第119-120页
        4.3.6 DK1622中MXAN_3848基因的插入失活突变株性质分析第120-121页
        4.3.7 YL1001应答盐调控和社会学行为的分析第121-122页
        4.3.8 YL1011社会学行为的变化第122-126页
        4.3.9 MXAN_3844-MXAN_3850基因簇中单个基因敲除突变株社会学行为分析第126-127页
    4.4 本章小结第127-130页
第五章 M.fulvus HW-1中在淡水和海水条件下差异表达的外膜蛋白功能的初步探索第130-148页
    5.1 实验材料第131-133页
        5.1.1 菌株及质粒第131-133页
        5.1.2 培养基第133页
        5.1.3 实验试剂第133页
        5.1.4 仪器设备及耗材第133页
    5.2 实验方法第133-134页
        5.2.1 目的基因缺失载体的构建流程第134页
        5.2.2 DK1622黄色粘球菌的电转化和突变株筛选以及纯化第134页
        5.2.3 子实体发育及生孢能力的分析第134页
        5.2.4 运动能力的分析第134页
    5.3 实验结果与分析第134-145页
        5.3.1 芯片获得差异表达外膜蛋白的详细信息第134-135页
        5.3.2 编码差异表达的外膜蛋白基因敲除载体构建以及验证第135-137页
        5.3.3 敲除突变株的筛选,纯化与获得第137-138页
        5.3.4 目的敲除突变株在不同盐浓度下子实体的发育和生孢能力分析第138-143页
        5.3.5 目的敲除突变株在不同盐浓度条件下运动能力分析第143-144页
        5.3.6 未成功获得敲除突变株的基因的插入失活分析第144-145页
    5.4 本章小结第145-148页
总结与展望第148-150页
攻读博士期间发表的论文第150-152页
致谢第152-154页
参考文献第154-164页
发表论文第164-174页
学位论文评阅及答辩情况表第174页

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