玉米脱水应答元件结合因子靶基因的全基因组分析
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 1. 绪论 | 第10-24页 |
| ·转录因子DREB的研究进展 | 第10-14页 |
| ·DREB的结构 | 第10页 |
| ·植物中的DREB | 第10-14页 |
| ·转录因子DREB与非生物逆境胁迫下的信号转导 | 第14-18页 |
| ·转录因子靶基因的研究方法 | 第18-23页 |
| ·转录因子靶基因的实验验证 | 第18-21页 |
| ·生物信息学在转录因子靶基因识别上的应用 | 第21-23页 |
| ·研究目的与意义 | 第23-24页 |
| 2. 材料与方法 | 第24-43页 |
| ·生物信息学预测 | 第24-30页 |
| ·数据来源 | 第24-27页 |
| ·数据处理 | 第27-28页 |
| ·DREB靶基因的预测 | 第28-29页 |
| ·靶基因在非生物胁迫下的表达 | 第29页 |
| ·靶基因在其他植物基因组的同源分析 | 第29页 |
| ·靶基因的本体分析 | 第29-30页 |
| ·DREB的原核表达 | 第30-39页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·试剂配制 | 第30-31页 |
| ·原核表达载体的构建 | 第31-35页 |
| ·目的蛋白的表达与纯化 | 第35-39页 |
| ·硝酸纤维素膜透过实验 | 第39-43页 |
| ·探针合成 | 第39页 |
| ·链核酸探针的标记 | 第39-40页 |
| ·生物素探针标记效率的检查 | 第40-41页 |
| ·硝酸纤维素膜透过实验 | 第41-43页 |
| 3. 结果与分析 | 第43-62页 |
| ·DREB靶基因的生物信息学预测 | 第43-48页 |
| ·玉米全长cDNA的物理定位 | 第43页 |
| ·新预测的DREB靶基因 | 第43页 |
| ·靶基因在非生物逆境下的表达分析 | 第43-45页 |
| ·靶基因与其他植物编码基因的同源性分析 | 第45-47页 |
| ·靶基因的本元分析 | 第47-48页 |
| ·玉米DREB基因的原核表达 | 第48-55页 |
| ·密码子优化 | 第48页 |
| ·阳性表达载体的鉴定 | 第48页 |
| ·目的片段的测序比对 | 第48-49页 |
| ·大肠杆菌BL21重组子的鉴定 | 第49页 |
| ·目的蛋白的试表达 | 第49-50页 |
| ·目的蛋白在宿主菌中的表达分布 | 第50-51页 |
| ·目的蛋白的纯化 | 第51-54页 |
| ·目的蛋白的浓度检查 | 第54-55页 |
| ·核酸蛋白的体外结合鉴定 | 第55-62页 |
| ·探针标记效率检测 | 第55-56页 |
| ·蛋白核酸结合效率 | 第56-59页 |
| ·化学发光反应的光信号转化 | 第59页 |
| ·不同DREB对DRE元件的结合差异 | 第59-61页 |
| ·不同DREB对基因的表达调控 | 第61-62页 |
| 4. 讨论 | 第62-65页 |
| ·DREB靶基因的高通量预测 | 第62-63页 |
| ·影响原核表达的几个重要因素 | 第63-65页 |
| ·玉米DREB识别顺式元件的异同 | 第65页 |
| 小结 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 附录1 比值大于3.0的HEXAMERS | 第75-76页 |
| 附录2 探针合成 | 第76-79页 |
| 附录3 玉米DREB靶基因的定位及表达分析 | 第79-93页 |
| 附录4 密码子优化 | 第93-97页 |
| 附录5 化学发光反应的统计结果 | 第97-98页 |
