| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| Abbreviations | 第13-14页 |
| Chapter 1 Introduction | 第14-28页 |
| 1.1 Molecular Genetics and its significance | 第14-15页 |
| 1.2 Hormones and their role | 第15页 |
| 1.3 Evolutionary context of reproductive hormones | 第15-16页 |
| 1.4 Follicle-Stimulating Hormone (FSH) | 第16-22页 |
| 1.4.1 Follicle-stimulating hormone β-subunit coding gene | 第18-19页 |
| 1.4.2 Regulation of FSH | 第19-20页 |
| 1.4.3 Basal Regulation of FSH | 第20-21页 |
| 1.4.4 GnRH Regulation of FSHβ Expression | 第21-22页 |
| 1.5 Follicle Stimulating Hormone Receptor (FSHR) | 第22页 |
| 1.6 Search for genes underlying phenotypic variation | 第22-23页 |
| 1.7 Signatures of the positive selection | 第23-24页 |
| 1.8 Population differentiation index (FST) | 第24-25页 |
| 1.9 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) | 第25页 |
| 1.10 SNP Based Association Studies | 第25-26页 |
| 1.11 Conclusion and hypothesis | 第26-28页 |
| Chapter 2 Genetic Signature of Strong Recent Positive Selection at FSHβ Gene in Goat | 第28-44页 |
| 2.1 Materials and Methods | 第28-36页 |
| 2.1.1 Ethics Statement | 第28页 |
| 2.1.2 Experimental Animal and Blood Collection | 第28-29页 |
| 2.1.3 Experimental Equipments and Sources | 第29页 |
| 2.1.4 Reagents and Sources | 第29页 |
| 2.1.5 Commonly Used Reagents Preparation | 第29-31页 |
| 2.1.6 Genomic DNA Extraction | 第31-32页 |
| 2.1.7 DNA quantification | 第32-33页 |
| 2.1.8 Primer Designing | 第33-34页 |
| 2.1.9 PCR Reaction | 第34页 |
| 2.1.10 Sequencing | 第34-35页 |
| 2.1.11 Genotyping | 第35页 |
| 2.1.12 FDIST2 Analysis | 第35页 |
| 2.1.13 Sequence analysis | 第35-36页 |
| 2.1.14 Phylogenetic analysis | 第36页 |
| 2.1.15 Statistical Analysis | 第36页 |
| 2.2 Results | 第36-42页 |
| 2.2.1 Positive selection of FSHβ gene by FDIST analysis | 第37-38页 |
| 2.2.2 Evolutionary analysis of positive selection | 第38-39页 |
| 2.2.3 Phylogenetic relationship of FSHβ gene among species | 第39-40页 |
| 2.2.4 Heterozygosity and inbreeding analysis: | 第40-42页 |
| 2.3 Discussion | 第42-44页 |
| Chapter 3 Positive selection of FSHR Gene, Identification, Characterization ofPolymorphisms of FSHR Gene and its effects on Litter size in Hu Sheep | 第44-64页 |
| 3.1 Materials and Methods | 第44-51页 |
| 3.1.1 Ethics Statement | 第44页 |
| 3.1.2 Experimental Animal and Blood Collection | 第44-45页 |
| 3.1.3 Phenotypic data collection | 第45页 |
| 3.1.4 Genomic DNA Extraction | 第45-47页 |
| 3.1.5 DNA quantification | 第47页 |
| 3.1.6 Primer Designing | 第47-48页 |
| 3.1.7 PCR Reaction | 第48页 |
| 3.1.8 DNA Sequencing | 第48-49页 |
| 3.1.9 Genotyping | 第49页 |
| 3.1.10 FDIST2 Analysis | 第49页 |
| 3.1.11 Sequence analysis | 第49-50页 |
| 3.1.12 Phylogenetic analysis | 第50-51页 |
| 3.1.13 Protein structure prediction and SNPs | 第51页 |
| 3.1.14 Statistical Analysis | 第51页 |
| 3.2 Results | 第51-60页 |
| 3.2.1 Positive selection of FSHR gene by FDIST analysis | 第51-52页 |
| 3.2.2 Evolutionary analysis of positive selection | 第52-53页 |
| 3.2.3 Phylogenetic relationship of FSHR gene among species | 第53-55页 |
| 3.2.4 Association analysis of SNPs with litter size | 第55-57页 |
| 3.2.5 Influence of fixed effects on litter size in Hu sheep | 第57-58页 |
| 3.2.6 Protein structure prediction and locating SNPs sites | 第58-60页 |
| 3.3 Discussion | 第60-64页 |
| Chapter 4 Conclusion and Future Prospects | 第64-66页 |
| Study I | 第64页 |
| Study II | 第64-65页 |
| The future experiments are needed | 第65-66页 |
| Chapter 5 References | 第66-77页 |
| Chapter 6 Keywords index | 第77-78页 |
| Chapter 7 Publication list | 第78-79页 |
| Chapter 8 Acknowledgement | 第79-81页 |
