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基于转录组测序的地黄毛蕊花糖苷生物合成相关酶基因的发掘与鉴定

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略语表第12-13页
1 前言第13-25页
    1.1 地黄概述第13-14页
        1.1.1 地黄的药用和保健作用第13页
        1.1.2 地黄化学成分研究第13-14页
    1.2 毛蕊花糖苷概述第14-20页
        1.2.1 毛蕊花糖苷的药理作用第15-18页
        1.2.2 毛蕊花糖苷生物合成途径研究第18-20页
        1.2.3 毛蕊花糖苷生物合成相关酶基因研究第20页
    1.3 转录组及其在药用植物研究中的应用第20-23页
        1.3.1 转录组测序及其研究进展第20-21页
        1.3.2 转录组测序在药用植物方面的应用第21-22页
        1.3.3 转录组测序在地黄研究中的应用第22-23页
    1.4 本课题研究目的及意义第23-25页
2 材料与方法第25-37页
    2.1 材料第25-27页
        2.1.1 植物材料第25页
        2.1.2 菌株和载体第25页
        2.1.3 引物第25页
        2.1.4 实验仪器设备第25页
        2.1.5 实验试剂及药品第25-26页
        2.1.6 主要试剂配方第26-27页
    2.2 转录组测序方法第27-28页
        2.2.1 RNA的提取和质检第27页
        2.2.2 转录组文库的构建、质检第27-28页
        2.2.3 测序数据分析第28页
    2.3 毛蕊花糖苷生物合成途径的建立第28-29页
    2.4 候选基因RT-PCR及同源比对分析第29-30页
    2.5 候选基因荧光定量PCR第30-33页
        2.5.1 总RNA的提取与检测第30页
        2.5.2 cDNA的合成第30-31页
        2.5.3 荧光定量PCR内参基因的选择第31-32页
        2.5.4 荧光定量PCR反应第32-33页
    2.6 毛蕊花糖苷生物合成途径关键酶RgC4H的克隆和表达载体构建第33-37页
        2.6.1 RgC4H基因克隆及蛋白分析第33-35页
        2.6.2 RgC4H基因植物表达载体的构建第35-37页
3 结果与分析第37-65页
    3.1 转录组测序第37-44页
        3.1.1 RNA的提取和质检第37页
        3.1.2 转录组文库的构建、质检第37-38页
        3.1.3 原始数据的统计第38-39页
        3.1.4 转录本的组装第39-40页
        3.1.5 基因功能的注释及分类第40-44页
    3.2 毛蕊花糖苷生物合成途径的建立第44-48页
    3.3 毛蕊花糖苷生物合成候选关键酶基因的挖掘第48-49页
    3.4 毛蕊花糖苷生物合成候选关键酶基因的验证第49-55页
        3.4.1 毛蕊花糖苷生物合成候选关键酶基因的RT-PCR第49页
        3.4.2 毛蕊花糖苷生物合成候选关键酶基因的序列分析第49-55页
    3.5 毛花糖苷生物合成候选关键酶基因的鉴定第55-65页
        3.5.1 总RNA的提取与检测第55-56页
        3.5.2 毛花糖苷生物合成候选关键酶基因的空间特异性表达第56页
        3.5.3 毛花糖苷生物合成候选关键酶基因的时间和基因型特异性表达第56-58页
        3.5.4 毛花糖苷生物合成途径RgC4H基因的克隆和表达载体构建第58-65页
4 讨论第65-71页
    4.1 转录组测序及功能注释结果评价第65-66页
    4.2 毛蕊花糖苷生物合成途径构建及相关酶基因的发掘与验证第66-67页
    4.3 毛蕊花糖苷生物合成途径中关键酶基因的鉴定第67-71页
5 结论第71-73页
参考文献第73-80页
致谢第80-81页
攻读学位期间发表的学术论文目录第81-82页

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