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里氏木霉纤维素酶诱导表达过程中碳源感应机制的研究

摘要第7-11页
Abstract第11-15页
缩略词第16-17页
第一章 绪论第17-34页
    1.1 纤维素的结构与性质第17页
    1.2 纤维素降解微生物第17-19页
        1.2.1 纤维素降解细菌第18页
        1.2.2 纤维素降解古菌第18页
        1.2.3 纤维素降解真菌第18-19页
    1.3 里氏木霉纤维素酶诱导表达第19-22页
        1.3.1 里氏木霉纤维素酶系组成第19-20页
        1.3.2 里氏木霉纤维素酶的表达调控第20-22页
    1.4 真核生物碳源感应受体蛋白分类第22-28页
        1.4.1 转运蛋白介导的碳源感应第23-24页
        1.4.2 无转运活性的类转运蛋白介导的碳源感应第24-25页
        1.4.3 G-蛋白偶联受体介导的碳源感应第25-26页
        1.4.4 碳源感受器之间的关系第26-28页
    1.5 碳源感应在里氏木霉纤维素酶诱导过程中的作用第28-32页
        1.5.1 纤维素酶诱导型碳源第28-29页
        1.5.2 纤维素酶诱导假说第29页
        1.5.3 参与纤维素酶表达的碳源感应系统的研究第29-32页
    1.6 立题依据及研究内容第32-34页
第二章 里氏木霉纤维二糖和乳糖转运蛋白的筛选第34-52页
    2.1 材料和方法第35-41页
        2.1.1 菌种和质粒第35页
        2.1.2 引物第35-37页
        2.1.3 培养基和培养条件第37页
        2.1.4 菌种保藏第37-38页
        2.1.5 实验步骤第38-41页
    2.2 结果与讨论第41-50页
        2.2.1 纤维二糖/乳糖转运蛋白筛选系统受体菌的构建第41-43页
        2.2.2 纤维二糖/乳糖转运蛋白筛选系统阳性对照菌株构建第43-44页
        2.2.3 候选转运蛋白纤维二糖/乳糖转运活性测定第44-48页
        2.2.4 Tr_47710生物信息学分析第48-50页
    2.3 本章小结第50-52页
第三章 里氏木霉糖转运蛋白Stp1基因缺失菌性质测定及机理探究第52-98页
    3.1 材料和方法第52-66页
        3.1.1 菌种和质粒第52页
        3.1.2 本章引物第52-54页
        3.1.3 培养基和培养条件第54页
        3.1.4 实验步骤第54-66页
    3.2 结果与讨论第66-95页
        3.2.1 里氏木霉糖转运蛋白编码基因stp1敲除质粒的构建第66-67页
        3.2.2 糖转运蛋白基因stp1的敲除第67-69页
        3.2.3 糖转运蛋白Stp1基因缺失菌生长测定第69-70页
        3.2.4 △stp1菌株纤维素酶活及Cbh Ⅰ表达测定第70-72页
        3.2.5 △stp1菌株纤维素酶相关编码基因转录检测第72-73页
        3.2.6 Stp1缺失对纤维二糖诱导纤维素酶的影响第73-75页
        3.2.7 Stp1缺失对纤维二糖代谢和转运的影响第75-78页
        3.2.8 Bgl1对△stp1菌株响应纤维二糖的影响第78-82页
        3.2.9 Bgl1对△stp1菌株纤维素降解的影响第82-84页
        3.2.10 Stp1对纤维素酶诱导过程中葡萄糖阻遏的影响第84-86页
        3.2.11 与Stp1相互作用蛋白的筛选第86-95页
    3.3 本章小结第95-98页
第四章 里氏木霉Stp1缺失突变株表达谱分析第98-112页
    4.1 材料和方法第98-101页
        4.1.1 菌种第98-99页
        4.1.2 本章引物第99页
        4.1.3 培养基和培养条件第99页
        4.1.4 实验方法第99-100页
        4.1.5 基因表达水平研究第100-101页
    4.2 结果与讨论第101-110页
        4.2.1 送测RNA样品的纯度和浓度检测结果第101-102页
        4.2.2 表达谱测序质量分析第102-103页
        4.2.3 差异表达基因统计第103-108页
        4.2.4 Tr_3405转录上调验证第108-109页
        4.2.5 Tr_3405生物信息学分析第109-110页
    4.3 本章小结第110-112页
第五章 Tr_3405的基因敲除及其对纤维素酶表达的影响第112-136页
    5.1 材料和方法第112-116页
        5.1.1 菌种和质粒第112-113页
        5.1.2 本章引物第113-114页
        5.1.3 培养基及培养条件第114页
        5.1.4 实验方法第114-116页
    5.2 结果与讨论第116-133页
        5.2.1 里氏木霉中Tr_3405的过表达第116-118页
        5.2.2 Tr_3405在里氏木霉中的敲除第118-120页
        5.2.3 Tr_3405缺失突变株表型测定第120-127页
        5.2.4 △crt1菌株中Xyr1的表达分析第127-128页
        5.2.5 Crt1相互作用蛋白pull-down钓取第128-133页
    5.3 纤维素酶诱导表达过程中碳源感应模型第133-135页
    5.4 本章小结第135-136页
第六章 一种新型纤维素酶诱导碳源—葡萄糖酸内酯第136-147页
    6.1 材料和方法第136-138页
        6.1.1 菌种第136-137页
        6.1.2 引物第137页
        6.1.3 培养基和培养条件第137-138页
        6.1.4 实验方法第138页
    6.2 结果和讨论第138-145页
        6.2.1 葡萄糖酸内酯能够诱导里氏木霉纤维素酶表达第138-139页
        6.2.2 葡萄糖酸内酯可以作为碳源供里氏木霉生长第139-140页
        6.2.3 葡萄糖酸内酯诱导纤维素酶表达需要Xyr1和Crt1的存在第140-142页
        6.2.4 Cel1a在葡萄糖酸内酯诱导纤维素酶表达过程起到至关重要的作用第142-143页
        6.2.5 葡萄糖酸内酯诱导纤维素酶表达受糖转运蛋白Stp1影响第143-145页
        6.2.6 葡萄糖酸内醋诱导纤维素酶表达模型第145页
    6.3 本章小结第145-147页
全文总结及展望第147-149页
参考文献第149-160页
致谢第160-161页
攻读博士学位期间发表的学术论文第161-162页
附件第162-181页
学位论文评阅及答辩情况表第181页

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