| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第17-40页 |
| 1.1 细菌冷激反应的研究进展 | 第17-29页 |
| 1.1.1 冷激反应的定义 | 第17页 |
| 1.1.2 冷信号的感应和传导 | 第17-22页 |
| 1.1.3 冷激反应的功能 | 第22-24页 |
| 1.1.4 冷激蛋白Csp的广泛分布 | 第24-25页 |
| 1.1.5 冷激蛋白Csp的结构特点 | 第25-26页 |
| 1.1.6 冷激蛋白Csp的表达与功能 | 第26-28页 |
| 1.1.7 细胞对冷激反应的调控 | 第28页 |
| 1.1.8 冷激反应中的重要功能蛋白 | 第28-29页 |
| 1.2 耐辐射异常球菌研究进展 | 第29-36页 |
| 1.2.1 耐辐射异常球菌的分离及进化地位 | 第29-30页 |
| 1.2.2 耐辐射异常球菌的特殊结构特征 | 第30页 |
| 1.2.3 耐辐射异常球菌的极端抗性 | 第30-32页 |
| 1.2.4 耐辐射异常球菌的损伤修复机制 | 第32-33页 |
| 1.2.5 耐辐射异常球菌胁迫应答蛋白 | 第33-36页 |
| 1.2.6 耐辐射细菌中的冷激蛋白 | 第36页 |
| 1.3 转录组学关键技术及其在细菌功能基因组学研究中的应用 | 第36-38页 |
| 1.3.1 RNA-seq是利用高通量对转录本进行测序分析的技术 | 第36-37页 |
| 1.3.2 转录组学在细菌冷激反应全局调控研究中的应用 | 第37-38页 |
| 1.4 立题依据和技术路线 | 第38-40页 |
| 1.4.1 立题依据 | 第38-39页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第39-40页 |
| 第二章 耐辐射异常球菌冷激反应的转录组分析 | 第40-60页 |
| 2.1 材料与方法 | 第40-46页 |
| 2.1.1 菌株、质粒来源 | 第40页 |
| 2.1.2 培养基、酶类及生化试剂 | 第40-43页 |
| 2.1.3 主要仪器设备和软件 | 第43页 |
| 2.1.4 培养条件 | 第43页 |
| 2.1.5 生长柱状图的绘制 | 第43页 |
| 2.1.6 转录组学分析样品的RNA制备 | 第43-44页 |
| 2.1.7 转录组测序方法 | 第44页 |
| 2.1.8 转录组学数据分析方法 | 第44-45页 |
| 2.1.9 实时定量PCR验证 | 第45页 |
| 2.1.10 Western Blot检测 | 第45-46页 |
| 2.2 结果 | 第46-54页 |
| 2.2.1 耐辐射异常球菌的低温生长分析 | 第46-47页 |
| 2.2.2 实时定量PCR检测耐辐射异常球菌冷激条件下csp的表达 | 第47-48页 |
| 2.2.3 Western Blot检测耐辐射异常球菌冷激条件下Csp蛋白的表达 | 第48页 |
| 2.2.4 耐辐射异常球菌冷激反应转录组概况 | 第48-49页 |
| 2.2.5 耐辐射异常球菌冷激反应时高表达的基因 | 第49-50页 |
| 2.2.6 耐辐射异常球菌冷激反应时表达上调的基因 | 第50-51页 |
| 2.2.7 耐辐射异常球菌冷激反应时表达下调的基因 | 第51-54页 |
| 2.3 讨论 | 第54-60页 |
| 2.3.1 耐辐射异常球菌具有典型的冷激反应 | 第54页 |
| 2.3.2 耐辐射异常球菌冷激反应关键基因的分析 | 第54-55页 |
| 2.3.3 耐辐射异常球菌冷激反应激活UvrABC途径 | 第55-56页 |
| 2.3.4 耐辐射异常球菌冷激反应时维持细胞膜的结构 | 第56页 |
| 2.3.5 耐辐射异常球菌冷激反应时抗氧化酶被激活 | 第56-58页 |
| 2.3.6 耐辐射异常球菌冷激反应过程 | 第58-60页 |
| 第三章 耐辐射异常球菌突变株△csp及回补株△cspC的表型分析 | 第60-78页 |
| 3.1 材料与方法 | 第60-67页 |
| 3.1.1 菌株、质粒来源 | 第60页 |
| 3.1.2 培养基、酶类及生化试剂 | 第60-62页 |
| 3.1.3 培养条件 | 第62页 |
| 3.1.4 细菌基因组及质粒的提取 | 第62-63页 |
| 3.1.5 PCR反应 | 第63-65页 |
| 3.1.6 DNA目的片段的切胶回收 | 第65页 |
| 3.1.7 DNA片段的酶切与连接 | 第65-66页 |
| 3.1.8 大肠杆菌感受态细胞的化学转化法 | 第66页 |
| 3.1.9 生长曲线的测定 | 第66-67页 |
| 3.1.10过氧化氢冲击后存活率的分析 | 第67页 |
| 3.1.11 Western Blot实验 | 第67页 |
| 3.2 结果 | 第67-74页 |
| 3.2.1 Csp的生物信息学分析 | 第67-69页 |
| 3.2.2 耐辐射异常球菌突变株 Δcsp特征及回补株 ΔcspC的构建 | 第69-71页 |
| 3.2.3 实时定量PCR检测耐辐射异常球菌不同生长时期csp的表达 | 第71页 |
| 3.2.4 Western Blot检测耐辐射异常球菌不同生长时期Csp蛋白的表达 | 第71-72页 |
| 3.2.5 耐辐射异常球菌野生型及其突变株和回补株的生长曲线分析 | 第72页 |
| 3.2.6 耐辐射异常球菌野生型及其突变株和回补株的过氧化氢抗性分析 . 563.3 讨论 | 第72-74页 |
| 3.3 讨论 | 第74-78页 |
| 3.3.1 耐辐射异常球菌Csp在稳定期的积累 | 第74-75页 |
| 3.3.2 耐辐射异常球菌冷激蛋白Csp参与稳定期胁迫反应 | 第75页 |
| 3.3.3 耐辐射异常球菌冷激蛋白Csp参与氧化冲击的响应 | 第75-76页 |
| 3.3.4 耐辐射异常球菌冷激蛋白Csp参与磷酸戊糖途径的调节 | 第76-78页 |
| 第四章 耐辐射异常球菌Csp介导的冷胁迫调控机制 | 第78-91页 |
| 4.1 材料与方法 | 第78-81页 |
| 4.1.1 菌株、质粒来源 | 第78页 |
| 4.1.2 培养基、酶类及生化试剂 | 第78-79页 |
| 4.1.3 培养条件 | 第79页 |
| 4.1.4 PCR反应 | 第79-80页 |
| 4.1.5 蛋白三维结构的模拟 | 第80页 |
| 4.1.6 启动子的预测 | 第80页 |
| 4.1.7 KEGG数据库对代谢途径的定位 | 第80页 |
| 4.1.8 过氧化氢酶活性分析 | 第80-81页 |
| 4.2 结果 | 第81-86页 |
| 4.2.1 耐辐射异常球菌缺失csp对低温存活的影响 | 第81-82页 |
| 4.2.2 耐辐射异常球菌冷激反应中冷激蛋白Csp调控基因的预测 | 第82-83页 |
| 4.2.3 冷胁迫条件下，Csp调控途径的预测 | 第83-84页 |
| 4.2.4 冷胁迫条件下，Csp增强麦芽糖转运基因的表达 | 第84页 |
| 4.2.5 冷胁迫条件下，Csp增强抗氧化酶相关基因的表达 | 第84-85页 |
| 4.2.6 冷胁迫条件下过氧化氢酶活性的变化 | 第85-86页 |
| 4.3 讨论 | 第86-91页 |
| 4.3.1 csp缺失对细胞低温存活的影响 | 第86页 |
| 4.3.2 Csp对麦芽糖转运的调控作用 | 第86-87页 |
| 4.3.3 Csp对AsnC家族转录调节因子的调控作用 | 第87-88页 |
| 4.3.4 Csp对过氧化氢酶基因katA的调控模型 | 第88-89页 |
| 4.3.5 Csp对耐辐射异常球菌冷激反应的调控 | 第89-91页 |
| 第五章 结论 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
| 作者简历 | 第107-108页 |
