| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略语表 | 第10-20页 |
| 第1章 绪论 | 第20-42页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 1.2 肝癌及其研究进展 | 第21-23页 |
| 1.2.1 肝癌的现状 | 第21-22页 |
| 1.2.2 肝癌的诊断及生物标记物 | 第22-23页 |
| 1.3 代谢组学及其研究进展 | 第23-31页 |
| 1.3.1 基本概述 | 第23-25页 |
| 1.3.2 样本的采集及制备 | 第25-26页 |
| 1.3.3 分析技术 | 第26-28页 |
| 1.3.4 数据分析 | 第28-29页 |
| 1.3.5 数据库 | 第29-31页 |
| 1.4 肝癌代谢组学的研究进展 | 第31-39页 |
| 1.4.1 代谢生物标志物的研究现状 | 第31-34页 |
| 1.4.2 代谢通路研究现状 | 第34-39页 |
| 1.5 本课题的主要内容和技术路线 | 第39-42页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第39-41页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第41-42页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第42-49页 |
| 2.1 实验材料 | 第42-44页 |
| 2.1.1 临床样本 | 第42页 |
| 2.1.2 细胞系 | 第42-43页 |
| 2.1.3 引物及干扰序列 | 第43页 |
| 2.1.4 抗体 | 第43页 |
| 2.1.5 各类其它实验试剂 | 第43-44页 |
| 2.1.6 实验仪器 | 第44页 |
| 2.2 实验方法 | 第44-49页 |
| 2.2.1 血清样本的制备 | 第44-45页 |
| 2.2.2 组织样本的制备 | 第45页 |
| 2.2.3 细胞培养及制备 | 第45-46页 |
| 2.2.4 代谢组学数据采集 | 第46-47页 |
| 2.2.5 数据预处理 | 第47页 |
| 2.2.6 统计分析 | 第47页 |
| 2.2.7 化合物鉴定 | 第47-48页 |
| 2.2.8 实时定量PCR | 第48页 |
| 2.2.9 RNA干扰实验 | 第48页 |
| 2.2.10 Western blot | 第48-49页 |
| 第3章 肝癌血清代谢轮廓分析及生物标志物的筛选 | 第49-72页 |
| 3.1 引言 | 第49-50页 |
| 3.2 血清代谢组学技术平台的建立 | 第50-53页 |
| 3.2.1 样本前处理方法的建立 | 第50-51页 |
| 3.2.2 LC-Q/TOF-MS分析方法的建立 | 第51-53页 |
| 3.3 代谢轮廓分析 | 第53-56页 |
| 3.3.1 代谢轮廓LC-MS谱图获得及比较 | 第53-54页 |
| 3.3.2 主成分分析 | 第54-55页 |
| 3.3.3 偏最小二乘判别分析 | 第55-56页 |
| 3.4 差异性代谢产物的筛选及鉴定 | 第56-59页 |
| 3.4.1 显著性差异离子特征的筛选 | 第56页 |
| 3.4.2 差异性代谢产物的筛选 | 第56-59页 |
| 3.5 诊断代谢生物标记物的筛选及验证 | 第59-63页 |
| 3.5.1 诊断代谢生物标志物的筛选 | 第59-62页 |
| 3.5.2 联合诊断分析 | 第62-63页 |
| 3.6 病理分期相关代谢轮廓分析及其代谢产物的筛选 | 第63-65页 |
| 3.7 代谢通路分析 | 第65-67页 |
| 3.8 相关网络分析 | 第67-70页 |
| 3.9 本章小结 | 第70-72页 |
| 第4章 肝癌及癌旁组织代谢轮廓对比分析 | 第72-89页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 组织代谢组学技术平台的建立 | 第72-74页 |
| 4.2.1 样本前处理方法的建立 | 第72-73页 |
| 4.2.2 LC-Q/TOF-MS分析方法的建立 | 第73-74页 |
| 4.3 极性组分代谢轮廓分析 | 第74-77页 |
| 4.3.1 LC-MS谱图比较 | 第74-75页 |
| 4.3.2 偏最小二乘判别分析 | 第75-77页 |
| 4.4 极性差异性代谢产物的筛选及临床混杂因素的影响 | 第77-80页 |
| 4.4.1 极性差异性代谢产物的筛选 | 第77-79页 |
| 4.4.2 临床混杂因素的影响 | 第79-80页 |
| 4.5 组织极性与血清差异性代谢产物的对比 | 第80-85页 |
| 4.5.1 组织与血清共有差异性代谢产物的筛选及分析 | 第80-82页 |
| 4.5.2 血清差异性代谢产物在组织中的差异性分析 | 第82-85页 |
| 4.6 代谢拓扑及通路分析 | 第85-88页 |
| 4.6.1 代谢拓扑分析 | 第85-87页 |
| 4.6.2 代谢通路分析 | 第87-88页 |
| 4.7 本章小结 | 第88-89页 |
| 第5章 肝癌脂酰肉碱代谢轮廓变化及其机制研究 | 第89-106页 |
| 5.1 引言 | 第89页 |
| 5.2 组织脂酰肉碱代谢靶标分析及其对比研究 | 第89-93页 |
| 5.2.1 脂酰肉碱代谢靶标分析 | 第89-91页 |
| 5.2.2 脂酰肉碱对比研究 | 第91-93页 |
| 5.3 脂酰肉碱相关网络及相关热图分析 | 第93-96页 |
| 5.3.1 相关网络分析 | 第93-95页 |
| 5.3.2 相关热图分析 | 第95-96页 |
| 5.4 CPT酶表达对比分析 | 第96-99页 |
| 5.5 CPT2-knockdown肝癌细胞株脂酰肉碱代谢靶标分析 | 第99-103页 |
| 5.5.1 细胞系的筛选 | 第99-100页 |
| 5.5.2 siRNA的筛选 | 第100-101页 |
| 5.5.3 脂酰肉碱代谢靶标分析 | 第101-103页 |
| 5.6 组织脂肪酸代谢轮廓分析 | 第103-104页 |
| 5.7 本章小结 | 第104-106页 |
| 第6章 肝癌组织脂质组学研究 | 第106-133页 |
| 6.1 引言 | 第106页 |
| 6.2 脂质代谢轮廓分析 | 第106-113页 |
| 6.2.1 LC-MS谱图比较 | 第106-108页 |
| 6.2.2 潜在差异性脂质离子的筛选 | 第108-110页 |
| 6.2.3 偏最小二乘判别分析 | 第110-113页 |
| 6.3 差异性脂质的筛选及鉴定 | 第113-115页 |
| 6.4 脂质代谢拓扑分析 | 第115-117页 |
| 6.5 脂质代谢通路分析 | 第117-132页 |
| 6.5.1 甘油磷脂代谢 | 第117-124页 |
| 6.5.2 甘油脂质代谢 | 第124-129页 |
| 6.5.3 鞘脂代谢 | 第129-132页 |
| 6.6 本章小结 | 第132-133页 |
| 结论 | 第133-135页 |
| 参考文献 | 第135-150页 |
| 附录 | 第150-167页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文及其它成果 | 第167-169页 |
| 致谢 | 第169-170页 |
| 个人简历 | 第170页 |
