| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 1 前言 | 第11-28页 |
| ·深海热液生态系统研究进展 | 第11-15页 |
| ·深海热液生态系统的发现 | 第11-12页 |
| ·深海热液在全球分布 | 第12页 |
| ·热液系统的分类 | 第12-14页 |
| ·瓜伊马斯热液口生态系统 | 第14-15页 |
| ·超嗜热古菌与早期生命 | 第15-18页 |
| ·热球菌目（Thermococcales）简介 | 第18-19页 |
| ·嗜压微生物 | 第19-22页 |
| ·Thermococcales 遗传操作系统 | 第22-27页 |
| ·营养缺陷性标记宿主的遗传操作系统 | 第23页 |
| ·抗生素选择标记宿主的遗传操作系统 | 第23-24页 |
| ·质粒及穿梭载体 | 第24-25页 |
| ·转化方法 | 第25-26页 |
| ·遗传操作系统的应用 | 第26-27页 |
| ·本研究的目的、思路、意义及困难 | 第27-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-39页 |
| ·材料来源 | 第28-29页 |
| ·培养基与试剂 | 第29-31页 |
| ·培养基的配制 | 第29-30页 |
| ·溶液与试剂 | 第30-31页 |
| ·引物与软件 | 第31-32页 |
| ·实验仪器 | 第32-33页 |
| ·实验方法 | 第33-39页 |
| ·DNA 提取 | 第33-34页 |
| ·PCR 及PCR 产物克隆 | 第34-35页 |
| ·转化 | 第35页 |
| ·菌落PCR 阳性克隆验证 | 第35-36页 |
| ·高压培养方法 | 第36-37页 |
| ·生理测试 | 第37-38页 |
| ·诱变 | 第38页 |
| ·Solexa 测序 | 第38-39页 |
| 3 结果与讨论 | 第39-79页 |
| ·超嗜热嗜压古菌 Thermococcus sp. LMO09A501 的培养与鉴定 | 第39-47页 |
| ·嗜热微生物Thermococcus sp. LM009A501 培养 | 第39-40页 |
| ·Thermococcus sp. LM009A501 的鉴定 | 第40-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| ·Thermococcus sp. LMO09A501 高温突变体诱变 | 第47-48页 |
| ·EMS 诱变最佳条件的确定 | 第47页 |
| ·突变体筛选 | 第47-48页 |
| ·突变体16SrDNA 分析 | 第48页 |
| ·小结 | 第48页 |
| ·Thermococcales 质粒的分离与纯化 | 第48-54页 |
| ·Themococcales 基因组DNA 提取 | 第48-51页 |
| ·Thermococcus sp. LM009A501 质粒分离与纯化 | 第51-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| ·Thermococcus LM009A501 基因组初步分析 | 第54-79页 |
| ·基因组测序 | 第54-55页 |
| ·基因组基本特征 | 第55-56页 |
| ·基因组注释 | 第56-57页 |
| ·近源Thermococcus 基因组比较 | 第57-61页 |
| ·近源Thermococcus 基因组比较 | 第61-66页 |
| ·LM009A501 代谢分析 | 第66-78页 |
| ·小结 | 第78-79页 |
| 4 展望 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 符号与标记（附录1） | 第91-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第94页 |
