基于特征筛选方法的原核生物细胞壁裂解酶预测
| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 生物信息学 | 第10页 |
| 1.2 细胞壁裂解酶简介 | 第10-11页 |
| 1.3 细胞壁裂解酶的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.4 本论文主要内容 | 第12-14页 |
| 第二章 数据集与方法 | 第14-33页 |
| 2.1 数据集的构建 | 第14-17页 |
| 2.1.1 细胞壁裂解酶数据集的构建 | 第14-16页 |
| 2.1.2 细胞壁裂解酶数据集的优化 | 第16-17页 |
| 2.2 特征提取 | 第17-23页 |
| 2.2.1 二肽特征 | 第18-19页 |
| 2.2.2 基于g-间隔二肽的伪氨基酸特征 | 第19-23页 |
| 2.3 特征筛选 | 第23-26页 |
| 2.4 分类算法 | 第26-30页 |
| 2.4.1 支持向量机简介 | 第26-27页 |
| 2.4.2 LIBSVM软件包简介 | 第27-29页 |
| 2.4.3 其他算法简介 | 第29-30页 |
| 2.5 分类结果评价指标 | 第30-32页 |
| 2.5.1 数值指标 | 第30-31页 |
| 2.5.2 ROC曲线 | 第31-32页 |
| 2.6 小结 | 第32-33页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第33-42页 |
| 3.1 分类结果 | 第33-38页 |
| 3.1.1 交叉验证 | 第33-34页 |
| 3.1.2 优化参数 | 第34-36页 |
| 3.1.3 预测精度 | 第36-37页 |
| 3.1.4 多种分类算法结果比较 | 第37-38页 |
| 3.2 在线服务软件介绍 | 第38-40页 |
| 3.3 小结 | 第40-42页 |
| 第四章 内溶素与自溶素蛋白探究 | 第42-48页 |
| 4.1 研究现状 | 第42页 |
| 4.2 数据集 | 第42页 |
| 4.3 三肽特征 | 第42-43页 |
| 4.4 二项分布 | 第43-44页 |
| 4.5 最优特征子集 | 第44-46页 |
| 4.6 分类结果与分析 | 第46-47页 |
| 4.7 小结 | 第47-48页 |
| 第五章 总结与展望 | 第48-50页 |
| 5.1 本文工作总结 | 第48-49页 |
| 5.2 未来工作展望 | 第49-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-58页 |
| 攻读硕士期间取得的研究成果 | 第58-59页 |
