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甜瓜属主要物种比较染色体图谱的初步构建及染色体进化分析

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-14页
引言第14-16页
上篇 文献综述第16-27页
    第一章 甜瓜属物种染色体核型分析及进化研究进展第17-27页
        1 甜瓜属物种染色体核型分析的研究进展第17-20页
            1.1 核型分析的方法与改进第17-19页
                1.1.1 染色体形态分析第17页
                1.1.2 染色体显带分析第17-18页
                1.1.3 原位杂交分析第18-19页
            1.2 植物核型分析中探针的发展与改进第19-20页
                1.2.1 基因组序列探针第19页
                1.2.2 染色体特异重复序列探针第19-20页
        2 甜瓜属物种染色体进化研究进展第20-25页
            2.1 染色体进化研究中方法的发展与改进第21-23页
                2.1.1 种间比较基因组学研究第21-22页
                    2.1.1.1 分子标记遗传图谱第21页
                    2.1.1.2 单核苷酸多态性第21-22页
                2.1.2 种内比较基因组学研究第22-23页
            2.2 染色体进化研究中探针的发展与改进第23-25页
                2.2.1 基于重复序列的比较染色体研究第23-24页
                2.2.2 基于染色体特异探针的比较染色体研究第24-25页
                2.2.3 基于染色体涂染的比较染色体研究第25页
        3 展望第25-27页
下篇 研究内容第27-71页
    第二章 利用基因组原位杂交快速构建黄瓜变种间核型第29-41页
        1 材料与方法第31-33页
            1.1 试验材料第31页
            1.2 试验方法第31-33页
                1.2.1 染色体制片第32页
                1.2.2 基因组探针的制备第32页
                1.2.3 原位杂交及检测第32页
                1.2.4 图像检测及分析第32-33页
        2 结果与分析第33-37页
            2.1 黄瓜基因组原位杂交揭示的栽培黄瓜和野生变种染色体核型特征第33-35页
                2.1.1 栽培黄瓜'9930'染色体核型特征分析第33-34页
                2.1.2 黄瓜野生变种C.sativus var hardwickii染色体核型特征分析第34-35页
            2.2 黄瓜核型模式图的构建第35-37页
        3 讨论第37-41页
            3.1 栽培黄瓜基因组构建的黄瓜种内两个变种染色体核型方法第37-38页
            3.2 GISH为植物种内变种间的核型分析提供了可行的方法第38页
            3.3 GISH为分析特定重复序列提供参考第38-41页
    第三章 基于比较细胞遗传图谱初步揭示甜瓜属主要物种间的进化关系第41-55页
        1 材料与方法第43-44页
            1.1 植物材料第43-44页
            1.2 染色体制片第44页
            1.3 DNA探针的制备第44页
            1.4 原位杂交及检测第44页
            1.5 基因密度分析第44页
        2 结果与分析第44-52页
            2.1 通过sGISH与FISH表明甜瓜属物种染色体上TRS的分布第44-47页
                2.1.1 黄瓜sGISH的信号分布模式第46页
                2.1.2 酸黄瓜中sGISH的信号分布模式第46-47页
                2.1.3 甜瓜上sGISH的信号分布模式第47页
                2.1.4 非洲角中sGISH的信号分布模式第47页
                2.1.5 西印度黄瓜上sGISH的信号分布模式第47页
            2.2 基于cGISH分析甜瓜属物种中TRS的同源性第47-49页
            2.3 特定序列的比较作图揭示了甜瓜属物种间的进化第49-50页
            2.4 GISH分布模式与基因密度分布之间的关系第50-52页
        3 讨论第52-55页
            3.1 甜瓜属物种染色体进化的两种假说第52页
            3.2 相互cGISH可以揭示物种之间TRS的同源性第52页
            3.3 重复序列的分化是物种进化的驱动力第52-55页
    第四章 黄瓜单拷贝基因的染色体涂染及其在甜瓜属物种间染色体重排研究中的应用第55-71页
        1 材料与方法第57-59页
            1.1 植物材料和染色体制片第57页
            1.2 染色体制片第57-58页
            1.3 单拷贝基因探针分离与探针的制备第58页
            1.4 封阻DNA的制备第58页
            1.5 FISH及检测第58-59页
        2 结果与分析第59-70页
            2.1 单拷贝基因的分离与探针纯化第59页
            2.2 利用单拷贝基因池构建黄瓜中期染色体核型第59-60页
            2.3 单拷贝基因FISH的灵敏度与可靠性第60-62页
            2.4 不同密度单拷贝基因池的涂染模式第62-64页
            2.5 黄瓜的染色体涂染第64-66页
            2.6 利用ScgCP技术评价基因组序列的拼接质量第66-68页
            2.7 甜瓜属物种间的比较染色体涂染第68-70页
        3 讨论第70-71页
            3.1 单拷贝基因探针能够提高FISH分辨率与实验效率第70页
            3.2 ScgCP技术为物种染色体重排研究提供新的方法第70-71页
参考文献第71-81页
全文结论第81-83页
全文创新点第83-85页
工作展望第85-87页
附录第87-117页
攻读硕士期间发表的论文第117-119页
致谢第119页

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