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秀丽隐杆线虫MEX-3串联KH结构域、拟南芥APUM5 PUF结构域及精氨酸甲基转移酶PRMT9的结构和功能研究

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 秀丽隐杆线虫MEX-3串联KH结构域的结构和功能研究第11-49页
    1.1 引言第11-16页
        1.1.1 线虫的生殖细胞系第11-12页
        1.1.2 germ granule第12-13页
        1.1.3 germ granule的形成第13-14页
        1.1.4 germ granule的功能第14-15页
        1.1.5 p granule的一般介绍第15-16页
    1.2 MEX-3蛋白质第16-22页
        1.2.1 KH结构域第16-17页
        1.2.2 MEX-3家族简介第17-20页
        1.2.3 秀丽隐杆线虫MEX-3蛋白质第20-22页
    1.3 材料与方法第22-33页
        1.3.1 ceMEX-3蛋白质边界选取及克隆第22页
        1.3.2 ceMEX3蛋白质目的片段的扩增第22页
        1.3.3 ceMEX-3蛋白质目的片段的获得第22-23页
        1.3.4 ceMEX-3蛋白质DNA目的片段的酶切第23-24页
        1.3.5 载体的制备第24-25页
        1.3.6 DNA目的片段与载体的连接第25页
        1.3.7 将连接产物转化至感受态细胞第25-26页
        1.3.8 菌液PCR进行单克隆鉴定第26页
        1.3.9 突变体的构建第26-27页
        1.3.10 融合蛋白质试表达第27-28页
        1.3.11 融合蛋白质的表达第28页
        1.3.12 His_6-tag融合蛋白质的纯化第28-30页
        1.3.13 GST-tag融合蛋白质的纯化第30页
        1.3.14 ~(15)N标记融合蛋白质的表达纯化第30-31页
        1.3.15 ~(15)N-~1H HSQC谱图第31页
        1.3.16 ITC进行相互作用的验证第31-32页
        1.3.17 晶体生长第32-33页
    1.4 实验结果第33-47页
        1.4.1 ceMEX-3蛋白质的边界选取第33-35页
        1.4.2 ceMEX-3蛋白质中串联KH结构域的克隆第35-36页
        1.4.3 ceMEX-3蛋白质边界64-235基因序列的突变缺失第36-37页
        1.4.4 ceMEX-3蛋白质其他边界的克隆第37页
        1.4.5 ceMEX-3蛋白质边界64-235,77-235的表达纯化第37-40页
        1.4.6 ceMEX-3蛋白质其他边界的表达纯化第40-44页
        1.4.7 ceMEX-3蛋白质边界159-235及边界77-235的~(15)N-~1H HSQC谱图第44-46页
        1.4.8 ceMEX-3蛋白质与RNA相互作用的验证第46页
        1.4.9 ceMEX-3蛋白质晶体筛选第46-47页
    1.5 讨论第47-49页
第2章 拟南芥APUM5 PUF结构域的结构和功能研究第49-63页
    2.1 研究背景第49-54页
        2.1.1 PUF类蛋白质的一般介绍第49-50页
        2.1.2 PUF类蛋白质特异性识别RNA序列第50-51页
        2.1.3 PUF类蛋白质的功能第51-53页
        2.1.4 APUM5的功能第53-54页
    2.2 材料与方法第54-55页
        2.2.1 拟南芥APUM5 PUF结构域的克隆第54页
        2.2.2 拟南芥APUM5 PUF结构域的表达和纯化第54-55页
        2.2.3 动态光散射实验第55页
        2.2.4 拟南芥APUM5 PUF结构域与CMV 3'UTR相互作用的验证第55页
        2.2.5 晶体生长第55页
    2.3 实验结果第55-61页
        2.3.1 拟南芥APUM5 PUF结构域的克隆第55-56页
        2.3.2 拟南芥APUM5 PUF结构域的表达纯化第56-57页
        2.3.3 拟南芥APUM5 PUF结构域稳定性实验第57-58页
        2.3.4 拟南芥APUM5 PUF结构域与CMV 3'UTR相互作用的验证第58-59页
        2.3.5 拟南芥APUM5 PUF结构域的晶体筛选及优化第59-61页
    2.4 讨论第61-63页
第3章 精氨酸甲基转移酶PRMT9的结构和功能研究第63-79页
    3.1 研究背景第63-67页
        3.1.1 精氨酸的甲基化第63-64页
        3.1.2 PRMT家族简介第64-66页
        3.1.3 PRMT9的一般介绍第66-67页
    3.2 材料方法第67-73页
        3.2.1 重组pFastBac~(TM)质粒的构建第67-68页
        3.2.2 重组Bacmid的构建第68页
        3.2.3 重组Bacmid的鉴定第68-69页
        3.2.4 重组Bacmid的提取第69页
        3.2.5 昆虫细胞的培养第69-70页
        3.2.6 重组杆状病毒的获得第70-71页
        3.2.7 目的蛋白质的表达纯化第71-72页
        3.2.8 GST pull down验证相互作用第72-73页
    3.3 实验结果第73-79页
        3.3.1 人源PRMT9及斑马鱼PRMT9大肠杆菌体外表达第73-74页
        3.3.2 斑马鱼PRMT9蛋白质昆虫细胞表达第74-77页
        3.3.3 斑马鱼PRMT9蛋白质与SF3B2蛋白质相互作用的验证第77-78页
        3.3.4 斑马鱼PRMT9蛋白质晶体的筛选第78-79页
    3.4 讨论第79页
4 总结与展望第79-81页
参考文献第81-89页
致谢第89-90页

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