摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-24页 |
·抗菌药物的发展 | 第10-11页 |
·抗生素 | 第10页 |
·化学合成药 | 第10-11页 |
·细菌耐药性 | 第11-12页 |
·细菌耐药性现状 | 第11页 |
·细菌耐药性机制 | 第11-12页 |
·细菌分裂途径 | 第12-17页 |
·细菌分裂 | 第12-13页 |
·FtsZ抑制剂的研究进展 | 第13-16页 |
·FtsZ蛋白结构和结合位点 | 第16-17页 |
·计算机辅助药物设计 | 第17-22页 |
·简介 | 第17-18页 |
·分子对接 | 第18-20页 |
·分子动力学模拟 | 第20-22页 |
·小结 | 第22-24页 |
·研究目的及意义 | 第22页 |
·主要研究内容 | 第22-23页 |
·研究的创新点 | 第23-24页 |
第二章 3MBA类FtsZ蛋白抑制剂的抗菌机制研究 | 第24-34页 |
·实验部分 | 第24-25页 |
·蛋白质结构准备 | 第24页 |
·分子动力学模拟 | 第24-25页 |
·T7Loop区活性口袋体积测定 | 第25页 |
·结合自由能计算 | 第25页 |
·结果分析与讨论 | 第25-33页 |
·MjFtsZ二聚体和SaFtsZ二聚体结合模式 | 第25-26页 |
·四种体系的稳定性与残基波动情况 | 第26-27页 |
·四种体系中蛋白二级结构变化情况 | 第27-29页 |
·T7Loop区活性口袋与配体的结合模式 | 第29页 |
·T7Loop区活性口袋关键残基质心距离 | 第29-31页 |
·T7Loop区活性口袋体积分析 | 第31-32页 |
·MM-PBSA相对结合自由能分析 | 第32-33页 |
·小结 | 第33-34页 |
第三章 基于细菌分裂蛋白FtsZ靶点的全新药物设计 | 第34-45页 |
·理论与方法 | 第34-37页 |
·结构文件准备 | 第34页 |
·全新药物设计与ADME/T预测 | 第34-35页 |
·分子对接 | 第35-36页 |
·分子动力学模拟 | 第36页 |
·活性体积计算 | 第36页 |
·MM-PBSA相对结合自由能计算 | 第36-37页 |
·结果与讨论 | 第37-44页 |
·结合位点探测 | 第37页 |
·全新药物设计与分子对接 | 第37-40页 |
·体系稳定性情况 | 第40-41页 |
·活性口袋体积变化情况 | 第41页 |
·结合模式情况 | 第41-43页 |
·相对结合自由能与能量分解 | 第43-44页 |
·小结 | 第44-45页 |
第四章 虚拟筛选及抗菌活性研究 | 第45-59页 |
·实验内容 | 第45-47页 |
·实验药品及仪器 | 第45页 |
·蛋白模型与配体结构准备 | 第45-46页 |
·ADME/T预测和分子对接 | 第46页 |
·抗菌活性测试 | 第46-47页 |
·结果与讨论 | 第47-58页 |
·ADME/T预测与分子对接 | 第47-52页 |
·结合模式分析 | 第52-57页 |
·抗菌活性分析 | 第57-58页 |
·小结 | 第58-59页 |
第五章 结论 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-67页 |
发表论文和科研情况说明 | 第67-68页 |
致谢 | 第68-69页 |