| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 中英文对照表 | 第13-14页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 第一篇 文献综述 | 第16-32页 |
| 1 DNA 甲基化和去甲基化的分子机制 | 第16-18页 |
| ·DNA 甲基化的分子机制 | 第16-17页 |
| ·DNA 去甲基化的分子机制 | 第17-18页 |
| 2 DNA 甲基化转移酶的分类 | 第18-20页 |
| ·维持DNA 甲基化转移酶 | 第18-19页 |
| ·甲基化转移酶2（DNMT2） | 第19页 |
| ·从头甲基化酶 | 第19页 |
| ·CMT | 第19-20页 |
| 3 DNA 甲基化的检测方法 | 第20-26页 |
| ·基因组整体水平的甲基化检测 | 第20-22页 |
| ·特异性位点的DNA 甲基化的检测 | 第22-26页 |
| ·甲基化新位点的寻找 | 第26页 |
| 4 DNA 甲基化的生物学作用 | 第26-29页 |
| ·DNA 甲基化对基因表达的影响 | 第27页 |
| ·DNA 甲基化与细胞分化 | 第27页 |
| ·DNA 甲基化与胚胎发育调节 | 第27-28页 |
| ·X 染色体失活 | 第28页 |
| ·基因印记 | 第28页 |
| ·肿瘤发生 | 第28-29页 |
| 5 影响 DNA 甲基化因素 | 第29-30页 |
| ·DNA 甲基转移酶 | 第29页 |
| ·组蛋白甲基化 | 第29页 |
| ·RNA 干扰 | 第29页 |
| ·药物 | 第29-30页 |
| ·环境因素 | 第30页 |
| 6 展望 | 第30-32页 |
| 第二篇 研究内容 | 第32-82页 |
| 第一章 F-MSAP方法的建立及汶上芦花鸡不同组织甲基化检测 | 第32-46页 |
| 1 试验材料 | 第32-33页 |
| ·试验动物样品采集 | 第32页 |
| ·主要试剂的配制 | 第32-33页 |
| 2 方法 | 第33-37页 |
| ·不同组织基因组DNA 提取 | 第33-34页 |
| ·酶切 | 第34-35页 |
| ·酶切产物与接头引物连接 | 第35页 |
| ·预扩增 | 第35-36页 |
| ·选择性扩增 | 第36-37页 |
| ·选择性扩增DNA 甲基化多态性的检测 | 第37页 |
| 3 结果 | 第37-44页 |
| ·不同组织基因组DNA 提取结果 | 第37页 |
| ·不同组织基因组DNA 酶切结果 | 第37-38页 |
| ·预扩增结果 | 第38-39页 |
| ·选择性扩增结果 | 第39页 |
| ·F-MSAP 结果 | 第39-40页 |
| ·数据输出结果 | 第40-41页 |
| ·各个组织基因组DNA 甲基化水平分析结果 | 第41-44页 |
| 4 讨论 | 第44页 |
| 5 小结 | 第44-46页 |
| 第二章 DNA 甲基化与肉质性状相关性分析 | 第46-72页 |
| 1 材料 | 第46-48页 |
| ·样品的采集 | 第46页 |
| ·主要试剂的配制 | 第46-48页 |
| 2 方法 | 第48-54页 |
| ·基因组DNA 的提取、酶切、连接、预扩增、选择性扩增 | 第48页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第48页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶银染程序 | 第48-49页 |
| ·特异性甲基化片段的回收 | 第49页 |
| ·特异性甲基化片段的二次PCR | 第49页 |
| ·二次PCR 产物的回收 | 第49-50页 |
| ·特异性甲基化片段的克隆测序 | 第50页 |
| ·特异性甲基化片段southern blot 检测 | 第50-53页 |
| ·数据统计分析 | 第53-54页 |
| 3 结果 | 第54-68页 |
| ·肉质性状测定结果 | 第54页 |
| ·不同品种胸肌基因组DNA 提取结果 | 第54-55页 |
| ·不同品种胸肌基因组DNA 酶切结果 | 第55页 |
| ·预扩增结果 | 第55-56页 |
| ·选择性扩增结果 | 第56页 |
| ·F-MSAP 结果 | 第56-57页 |
| ·数据输出及统计分析结果 | 第57-60页 |
| ·汶上芦花鸡、仙居三黄鸡和淮北麻鸡肌肉组织基因组DNA 甲基化差异分析结果 | 第60-61页 |
| ·不同个体胸肌组织部分特异性甲基化片段变性聚丙烯酰胺凝胶结果 | 第61-62页 |
| ·特异性甲基化片段的二次PCR 及测序结果 | 第62页 |
| ·探针制备结果 | 第62-63页 |
| ·特异性甲基化片段的Southern 杂交验证 | 第63页 |
| ·三个品种不同个体间特异性甲基化片段的序列分析结果 | 第63-67页 |
| ·甲基化水平与肉质性状的相关性分析 | 第67-68页 |
| 4 讨论 | 第68-70页 |
| 5 小结 | 第70-72页 |
| 第三章 甲基化差异基因FABP4mRNA 表达水平与肉质性状相关性分析 | 第72-80页 |
| 1 材料 | 第72页 |
| 2 方法 | 第72-74页 |
| ·组织样品总RNA 的提取 | 第72页 |
| ·cDNA 合成 | 第72-73页 |
| ·荧光定量PCR | 第73-74页 |
| ·数据统计分析 | 第74页 |
| 3 结果 | 第74-77页 |
| ·胸肌组织总RNA 提取结果 | 第74页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第74-75页 |
| ·目的片段和看家基因融解曲线和扩增曲线 | 第75-76页 |
| ·荧光定量结果 | 第76-77页 |
| ·FABP4 mRNA 表达水平与肉质性状的相关性分析 | 第77页 |
| 4 讨论 | 第77-78页 |
| 5 小结 | 第78-80页 |
| 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-94页 |
| 附录 | 第94-105页 |
| 导师简介 | 第105-106页 |
| 作者简介 | 第106-107页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文及科研成果 | 第107-109页 |
| 致谢 | 第109页 |
