| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 目录 | 第13-17页 |
| 文献综述 | 第17-50页 |
| 第一章 miRNA综述 | 第17-27页 |
| 1 RNA概述 | 第17-18页 |
| 2 miRNA研究历史 | 第18页 |
| 3 miRNA的特点 | 第18页 |
| 4 miRNA生成过程 | 第18-19页 |
| 5 miRNA调控基因表达的两种机制 | 第19-20页 |
| ·miRNA的负调控作用 | 第19-20页 |
| ·miRNA的正调控作用 | 第20页 |
| 6 miRNA与表观遗传学 | 第20-21页 |
| 7 miRNA靶基因预测 | 第21-22页 |
| 8 小结 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-27页 |
| 第二章 蜜蜂miRNA研究进展 | 第27-31页 |
| 参考文献 | 第30-31页 |
| 第三章 蜜蜂级型分化研究进展 | 第31-48页 |
| 1 蜜蜂级型分化 | 第31-32页 |
| 2 营养影响蜜蜂的级型分化 | 第32-33页 |
| ·蜂王浆 | 第32-33页 |
| ·蜂花粉 | 第33页 |
| 3 参与蜜蜂级型分化的激素类物质 | 第33-34页 |
| ·保幼激素(juvenile hormone,JH) | 第34页 |
| ·蜕化类固醇 | 第34页 |
| ·促前胸腺激素 | 第34页 |
| 4 蜜蜂级型分化转录水平基因差异表达 | 第34-36页 |
| 5 蜜蜂级型分化蛋白质组水平表达差异 | 第36页 |
| 6 参与蜜蜂级型分化的信号通路 | 第36-38页 |
| ·胰岛素信号通路 | 第36-37页 |
| ·蛋白激酶TOR信号通路 | 第37页 |
| ·MAPK和S6K信号通路 | 第37-38页 |
| 7 甲基化与蜜蜂级型分化 | 第38-40页 |
| 8 卵黄蛋白原(Vitellogenin,Vg)与蜜蜂级型分化 | 第40页 |
| 9 一个整合的调控网络 | 第40-41页 |
| 10 其他 | 第41页 |
| 11 小结 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-48页 |
| 第四章 本研究的目的意义与主要内容 | 第48-50页 |
| 1 研究目的意义 | 第48页 |
| 2 研究内容 | 第48-50页 |
| 试验研究 | 第50-118页 |
| 第五章 蜜蜂miRNA全基因组挖掘 | 第51-74页 |
| 摘要 | 第51页 |
| 1 前言 | 第51-53页 |
| 2 试验材料与方法 | 第53-61页 |
| ·蜜蜂材料 | 第53页 |
| ·总RNA的提取和质量检测 | 第53-55页 |
| ·sRNA的文库构建和高通量测序 | 第55-56页 |
| ·测序结果分析和已知蜜蜂miRNA的识别 | 第56页 |
| ·新miRNA预测、验证和物种间保守性分析 | 第56-61页 |
| 3 结果和讨论 | 第61-69页 |
| ·总RNA的提取和质量检测 | 第61-63页 |
| ·高通量测序原始数据的分析及蜜蜂保守miRNA的识别 | 第63-66页 |
| ·新的蜜蜂miRNA；预测、验证和跨物种分析 | 第66-69页 |
| 4 结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-74页 |
| 第六章 蜂王幼虫和工蜂幼虫转录组水平的差异比较 | 第74-100页 |
| 摘要 | 第74页 |
| 1 前言 | 第74-75页 |
| 2 试验材料与方法 | 第75-78页 |
| ·蜜蜂幼虫培养和取样 | 第75-76页 |
| ·RNA提取、文库构建和测序 | 第76页 |
| ·原始数据处理 | 第76-77页 |
| ·基因表达分析 | 第77页 |
| ·功能和通路分析 | 第77页 |
| ·qRT-PCR验证 | 第77-78页 |
| 3 结果和讨论 | 第78-96页 |
| ·RNA提取、文库构建和测序 | 第78-79页 |
| ·原始数据处理 | 第79-83页 |
| ·内含子表达分析 | 第83-84页 |
| ·库与库之间的DEGs | 第84-94页 |
| ·q RT-PCR分析 | 第94-96页 |
| 4 结论 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-100页 |
| 第七章 蜂王幼虫和工蜂幼虫miRNA表达的差异比较 | 第100-116页 |
| 摘要 | 第100页 |
| 1 前言 | 第100-101页 |
| 2 试验材料与方法 | 第101-102页 |
| ·蜜蜂幼虫培养和取样 | 第101页 |
| ·RNA提取、文库构建和测序 | 第101页 |
| ·miRNA识别和靶基因预测 | 第101-102页 |
| 3 结果和讨论 | 第102-113页 |
| ·原始数据处理 | 第102-103页 |
| ·已知的蜜蜂miRNA的识别和文库间比较 | 第103-107页 |
| ·新的miRNA的识别和样本间比较 | 第107-110页 |
| ·靶基因预测 | 第110-113页 |
| 4 小结 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-116页 |
| 研究总结与展望 | 第116-118页 |
| 1 研究总结 | 第116页 |
| 2 研究展望 | 第116-118页 |
| 附表 | 第118-225页 |
| 附表5-1 新蜜蜂miRNA前体信息 | 第118-125页 |
| 附表5-2 与蜜蜂新miRNA同源的其他昆虫候选miRNA | 第125-135页 |
| 附表6-1 特异性或偏好性表达的基因 | 第135-138页 |
| 附表6-2 本中内含子和外显子的RPKM值 | 第138-158页 |
| 附表6-3 文库间基因表达比较 | 第158-206页 |
| 附表6-4 qRT-PCR产物测序 | 第206-207页 |
| 附表7-1 知蜜蜂miRNA在样本中的表达 | 第207-208页 |
| 附表7-2 蜜蜂miRNA信息 | 第208-210页 |
| 附表7-3 已知miRNA的候选靶基因 | 第210-217页 |
| 附表7-4 预测蜜蜂miRNA的候选靶基因 | 第217-225页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第225-226页 |
| 致谢 | 第226页 |
