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甜瓜无毛基因gl的图位克隆与转录组分析

致谢第4-7页
摘要第7-9页
1 文献综述第9-19页
    1.1 国内外研究进展第9-13页
        1.1.1 模式植物拟南芥相关表皮毛的研究进展第9-11页
        1.1.2 黄瓜表皮毛相关基因的研究进展第11-12页
        1.1.3 其他作物表皮毛相关基因的研究进展第12-13页
        1.1.4 甜瓜表皮毛研究进展第13页
    1.2 甜瓜基因的图位克隆第13-16页
        1.2.1 图位克隆基本思路第14页
        1.2.2 图位克隆使用的DNA分子标记第14-16页
    1.3 转录组测序技术第16-19页
        1.3.1 转录组概念第16页
        1.3.2 RNA-Seq原理及基本步骤第16-17页
        1.3.3 转录组测序与数字基因表达谱的关系第17页
        1.3.4 转录组测序技术研究基因的表达差异第17-19页
2 引言第19-20页
3 材料与方法第20-30页
    3.1 试材与试剂第20-21页
        3.1.1 植物材料第20页
        3.1.2 试剂第20页
        3.1.3 仪器第20-21页
    3.2 试验方法第21-30页
        3.2.1 材料种植第21页
        3.2.2 表型观察和表皮毛扫描电镜观察第21页
        3.2.3 遗传分析第21页
        3.2.4 甜瓜表皮毛基因初步定位第21-24页
        3.2.5 甜瓜表皮毛基因精细定位第24-25页
        3.2.6 候选基因序列分析第25页
        3.2.7 候选基因的表达模式分析第25-26页
        3.2.8 转录组测序与分析第26-30页
4 结果与分析第30-41页
    4.1 基因定位第30-35页
        4.1.1 无毛突变体的表型特征第30页
        4.1.2 扫描电镜观察第30-31页
        4.1.3 遗传分析第31页
        4.1.4 甜瓜无毛突变体gl基因初定位第31-32页
        4.1.5 gl基因精细定位第32页
        4.1.6 gl基因候选区段的注释第32-33页
        4.1.7 与gl基因共分离dCAPS标记在自然群体中的关联分析第33-34页
        4.1.8 gl候选基因时空表达模式分析第34-35页
    4.2 转录组分析第35-41页
        4.2.1 转录组测序产量统计第35页
        4.2.2 碱基分布检查第35-36页
        4.2.3 与参考基因组的比对结果与深度分布统计第36-37页
        4.2.4 差异表达分析第37-38页
        4.2.5 ED关联分析第38-39页
        4.2.6 基因功能注释第39-41页
            4.2.6.1 DEG的GO分类第39-40页
            4.2.6.2 DEG的KEGG富集分析第40-41页
5 讨论第41-44页
    5.1 无毛基因定位第41-43页
    5.2 转录组分析第43-44页
6 结论第44-45页
参考文献第45-50页
附录第50-51页
英文摘要第51-52页

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