致谢 | 第4-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
1 文献综述 | 第9-19页 |
1.1 国内外研究进展 | 第9-13页 |
1.1.1 模式植物拟南芥相关表皮毛的研究进展 | 第9-11页 |
1.1.2 黄瓜表皮毛相关基因的研究进展 | 第11-12页 |
1.1.3 其他作物表皮毛相关基因的研究进展 | 第12-13页 |
1.1.4 甜瓜表皮毛研究进展 | 第13页 |
1.2 甜瓜基因的图位克隆 | 第13-16页 |
1.2.1 图位克隆基本思路 | 第14页 |
1.2.2 图位克隆使用的DNA分子标记 | 第14-16页 |
1.3 转录组测序技术 | 第16-19页 |
1.3.1 转录组概念 | 第16页 |
1.3.2 RNA-Seq原理及基本步骤 | 第16-17页 |
1.3.3 转录组测序与数字基因表达谱的关系 | 第17页 |
1.3.4 转录组测序技术研究基因的表达差异 | 第17-19页 |
2 引言 | 第19-20页 |
3 材料与方法 | 第20-30页 |
3.1 试材与试剂 | 第20-21页 |
3.1.1 植物材料 | 第20页 |
3.1.2 试剂 | 第20页 |
3.1.3 仪器 | 第20-21页 |
3.2 试验方法 | 第21-30页 |
3.2.1 材料种植 | 第21页 |
3.2.2 表型观察和表皮毛扫描电镜观察 | 第21页 |
3.2.3 遗传分析 | 第21页 |
3.2.4 甜瓜表皮毛基因初步定位 | 第21-24页 |
3.2.5 甜瓜表皮毛基因精细定位 | 第24-25页 |
3.2.6 候选基因序列分析 | 第25页 |
3.2.7 候选基因的表达模式分析 | 第25-26页 |
3.2.8 转录组测序与分析 | 第26-30页 |
4 结果与分析 | 第30-41页 |
4.1 基因定位 | 第30-35页 |
4.1.1 无毛突变体的表型特征 | 第30页 |
4.1.2 扫描电镜观察 | 第30-31页 |
4.1.3 遗传分析 | 第31页 |
4.1.4 甜瓜无毛突变体gl基因初定位 | 第31-32页 |
4.1.5 gl基因精细定位 | 第32页 |
4.1.6 gl基因候选区段的注释 | 第32-33页 |
4.1.7 与gl基因共分离dCAPS标记在自然群体中的关联分析 | 第33-34页 |
4.1.8 gl候选基因时空表达模式分析 | 第34-35页 |
4.2 转录组分析 | 第35-41页 |
4.2.1 转录组测序产量统计 | 第35页 |
4.2.2 碱基分布检查 | 第35-36页 |
4.2.3 与参考基因组的比对结果与深度分布统计 | 第36-37页 |
4.2.4 差异表达分析 | 第37-38页 |
4.2.5 ED关联分析 | 第38-39页 |
4.2.6 基因功能注释 | 第39-41页 |
4.2.6.1 DEG的GO分类 | 第39-40页 |
4.2.6.2 DEG的KEGG富集分析 | 第40-41页 |
5 讨论 | 第41-44页 |
5.1 无毛基因定位 | 第41-43页 |
5.2 转录组分析 | 第43-44页 |
6 结论 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-50页 |
附录 | 第50-51页 |
英文摘要 | 第51-52页 |