| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 缩略词表 | 第9-11页 |
| 目录 | 第11-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-42页 |
| 1 植物RNA沉默途径与功能 | 第15-27页 |
| ·植物RNA沉默途径的多样性 | 第15-20页 |
| ·植物RNA沉默途径中的核心蛋白 | 第20-23页 |
| ·sRNA的生物学功能 | 第23-24页 |
| ·植物RNA沉默的系统性 | 第24-27页 |
| 2 植物病毒与抗病毒反应 | 第27-34页 |
| ·植物病毒 | 第27-29页 |
| ·抗性基因介导的植物抗病反应 | 第29-30页 |
| ·RNA介导的病毒免疫 | 第30-34页 |
| 3 RNA沉默技术在植物改良上的应用 | 第34-39页 |
| ·植物RNA沉默的应用方式 | 第34-37页 |
| ·应用前景与问题 | 第37-39页 |
| 4 研究的意义与内容 | 第39-42页 |
| ·研究意义 | 第39-41页 |
| ·研究内容与目标 | 第41-42页 |
| 第二章 番茄RNA沉默核心基因的鉴定及其表达分析 | 第42-62页 |
| 1 材料与方法 | 第43-46页 |
| ·供试材料 | 第43页 |
| ·候选基因的预测鉴定 | 第43页 |
| ·植物材料与胁迫处理 | 第43-45页 |
| ·RNA提取与RT-PCR分析 | 第45-46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-59页 |
| ·番茄DCL、AGO和RDR基因的鉴定及其结构分析 | 第46-53页 |
| ·DCL、AGO和RDR基因的进化树分析 | 第53页 |
| ·DCL、AGO和RDR基因的染色体定位与序列相似性分析 | 第53-54页 |
| ·不同组织和器官中的基因表达模式 | 第54-56页 |
| ·TYLCV侵染和非生物胁迫下DCL、AGO和RDR的表达分析 | 第56-59页 |
| 3 讨论 | 第59-61页 |
| ·番茄Dicer-like蛋白及其功能多样性 | 第59-60页 |
| ·番茄的Argonaute基因 | 第60页 |
| ·番茄RDR基因功能 | 第60-61页 |
| 4 小结 | 第61-62页 |
| 第三章 番茄内源sRNA与降解组学特征 | 第62-86页 |
| 1 材料与方法 | 第63-69页 |
| ·供试材料 | 第63页 |
| ·试验设计方案 | 第63页 |
| ·植物材料病毒接种与样本采集 | 第63页 |
| ·核酸的提取 | 第63-64页 |
| ·sRNA组和降解组建库 | 第64-65页 |
| ·数据的生物信息学分析 | 第65-69页 |
| 2 | 第69-84页 |
| ·番茄miRNA的分析 | 第69-77页 |
| ·番茄siRNA的分析 | 第77-78页 |
| ·降解组数据分析 | 第78-84页 |
| 3 讨论 | 第84-85页 |
| ·sRNA与病毒诱导的症状关系 | 第84页 |
| ·sRNA参与的抗性调控 | 第84-85页 |
| ·降解组数据分析 | 第85页 |
| 4 小结 | 第85-86页 |
| 第四章 番茄TYLCV耐感品种中病毒源小分子RNA特征与功能分析 | 第86-107页 |
| 1 材料与方法 | 第87-89页 |
| ·供试材料 | 第87页 |
| ·荧光定量PCR | 第87页 |
| ·重亚硫酸盐测序 | 第87-88页 |
| ·数据的生物信息学分析 | 第88-89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-100页 |
| ·vsRNA的统计特征 | 第89-92页 |
| ·vsRNA的发生与功能 | 第92-98页 |
| ·耐感品种间的一致性与差异 | 第98-100页 |
| 3 讨论 | 第100-104页 |
| ·寄主RNA沉默途径核心蛋白的作用 | 第100-101页 |
| ·vsRNA的热点 | 第101页 |
| ·vsRNA的功能 | 第101-102页 |
| ·RNA沉默与病毒抗性基因 | 第102-103页 |
| ·指导抗病毒应用 | 第103-104页 |
| 4 小结 | 第104-107页 |
| 第五章 利用系统性基因沉默提高嫁接番茄病毒抗性的研究 | 第107-127页 |
| 1 材料与方法 | 第108-113页 |
| ·供试材料 | 第108页 |
| ·载体构建 | 第108-110页 |
| ·番茄的遗传转化与繁殖 | 第110-111页 |
| ·转基因植株的分子鉴定 | 第111页 |
| ·RNA提取与RT-PCR分析 | 第111-112页 |
| ·转基因株系的营养扩繁 | 第112页 |
| ·转基因植株的CMV抗性鉴定 | 第112-113页 |
| ·嫁接 | 第113页 |
| ·砧木和接穗中IR源sRNA的检测 | 第113页 |
| ·CMV的DAS-ELISA鉴定 | 第113页 |
| 2 结果与分析 | 第113-123页 |
| ·植物表达载体构建与遗传转化 | 第113-115页 |
| ·转基因植株的检测 | 第115-118页 |
| ·转基因植株的CMV抗性检测 | 第118-120页 |
| ·嫁接植株CMV抗性的鉴定 | 第120-123页 |
| ·砧穗中NptⅡ转录本的检测 | 第123页 |
| 3 讨论 | 第123-126页 |
| ·不同靶标间病毒抗性差异 | 第123-124页 |
| ·转基因RNA沉默植株病毒抗性差异 | 第124页 |
| ·RNA沉默效应的传递与应用意义 | 第124-126页 |
| 4 小结 | 第126-127页 |
| 结论 | 第127-129页 |
| 论文创新点 | 第129页 |
| 下一步工作设想 | 第129-130页 |
| 参考文献 | 第130-146页 |
| 作者简历 | 第146-147页 |
| 致谢 | 第147-149页 |
| 附录 | 第149-155页 |
| 附录A：试剂与仪器 | 第149-151页 |
| 附A.1 常规试验试剂 | 第149页 |
| 附A.2 试验试剂配方 | 第149-151页 |
| 附A.3 试验用到的仪器 | 第151页 |
| 附件B：部分试验方法与步骤 | 第151-155页 |
| 附B.1 TYLCV病毒接种与检测 | 第151页 |
| 附B.2 sRNA高通量测序分析 | 第151-153页 |
| 附B.3 降解组测序分析 | 第153-154页 |
| 附B.4 DNA甲基化检测 | 第154-155页 |
