| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-40页 |
| ·概述 | 第20-21页 |
| ·果蝇免疫系统的研究进展 | 第21-29页 |
| ·果蝇的研究模式 | 第21-22页 |
| ·体液免疫 | 第22-27页 |
| ·细胞免疫 | 第27-28页 |
| ·上皮免疫防御 | 第28-29页 |
| ·昆虫免疫基因组学 | 第29-34页 |
| ·昆虫免疫相关基因的鉴定 | 第29-31页 |
| ·免疫相关基因的进化 | 第31-32页 |
| ·果蝇先天免疫系统的动态进化 | 第32-34页 |
| ·家蚕的免疫防御 | 第34-40页 |
| ·物理屏障抵御感染 | 第34-35页 |
| ·家蚕的细胞性免疫 | 第35页 |
| ·家蚕的抗菌肽 | 第35-37页 |
| ·主要疾病抗性的遗传规律 | 第37-40页 |
| 第二章 引言 | 第40-44页 |
| ·家蚕的重要地位 | 第40页 |
| ·家蚕免疫学研究的重要意义 | 第40页 |
| ·家蚕基因组计划与基金课题的推进 | 第40-41页 |
| ·科学问题和主要研究内容 | 第41-42页 |
| ·研究思路与技术路线 | 第42-44页 |
| 第三章 家蚕全基因组免疫系统相关基因的生物信息学分析 | 第44-58页 |
| ·材料和方法 | 第44-45页 |
| ·数据库和基因组序列 | 第44页 |
| ·序列比对 | 第44页 |
| ·进化分析 | 第44-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-55页 |
| ·家蚕免疫系统相关基因的鉴定 | 第45页 |
| ·染色定位和进化分析 | 第45-49页 |
| ·免疫效应因子 | 第49-50页 |
| ·免疫应答信号传导途径 | 第50-52页 |
| ·模式识别受体 | 第52-53页 |
| ·氧化防御 | 第53-55页 |
| ·结论与讨论 | 第55-58页 |
| ·家蚕免疫相关基因的进化 | 第55页 |
| ·家蚕的免疫信号途径 | 第55-56页 |
| ·家蚕的抗病相关基因 | 第56-58页 |
| 第四章 基于全基因组芯片的免疫相关基因的转录组分析 | 第58-78页 |
| ·材料和方法 | 第58-63页 |
| ·家蚕全基因组芯片 | 第58-59页 |
| ·脂肪体RNA抽提和纯化 | 第59-62页 |
| ·芯片杂交 | 第62-63页 |
| ·数据处理 | 第63页 |
| ·结果与分析 | 第63-74页 |
| ·杂交实验 | 第63-64页 |
| ·结果的重复性分析 | 第64页 |
| ·脂肪体表达基因分析 | 第64-66页 |
| ·差异表达基因分析 | 第66-68页 |
| ·免疫相关基因的表达分析 | 第68-73页 |
| ·其它诱导表达基因 | 第73页 |
| ·抑制表达的基因 | 第73-74页 |
| ·结论与讨论 | 第74-78页 |
| ·家蚕脂肪体诱导表达模式 | 第74-75页 |
| ·与果蝇免疫诱导芯片的比较 | 第75-76页 |
| ·家蚕免疫应答机制的初步探讨 | 第76-78页 |
| 第五章 家蚕的Toll相关受体基因家族的鉴定和分析 | 第78-88页 |
| ·材料和方法 | 第78-79页 |
| ·家蚕Toll相关受体基因的鉴定 | 第78页 |
| ·多序列比对和进化分析 | 第78-79页 |
| ·样品制备 | 第79页 |
| ·RNA抽提和RT-PCR | 第79页 |
| ·基于基因芯片的时空表达谱分析 | 第79页 |
| ·结果与分析 | 第79-85页 |
| ·家蚕Toll相关受体基因家族 | 第79-81页 |
| ·保守结构域分析 | 第81-82页 |
| ·进化分析 | 第82-83页 |
| ·时空表达谱 | 第83-85页 |
| ·诱导表达谱 | 第85页 |
| ·结论与讨论 | 第85-88页 |
| ·家蚕Toll相关基因的表达谱 | 第86页 |
| ·家蚕的Toll信号传导途径 | 第86-88页 |
| 第六章 家蚕抗菌肽基因的结构、调控以及诱导表达模式 | 第88-100页 |
| ·材料和方法 | 第88-89页 |
| ·抗菌肽基因的鉴定 | 第88页 |
| ·序列分析 | 第88页 |
| ·实验样品 | 第88-89页 |
| ·RNA抽提和纯化 | 第89页 |
| ·反转录PCR | 第89页 |
| ·结果与分析 | 第89-98页 |
| ·家蚕的抗菌肽基因家族 | 第89-90页 |
| ·Cecropin基因家族 | 第90-91页 |
| ·Moricin基因家族 | 第91-93页 |
| ·Gloverin基因家族 | 第93-94页 |
| ·抗菌肽基因上游调控元件 | 第94-96页 |
| ·抗菌肽基因诱导表达 | 第96-98页 |
| ·结论与讨论 | 第98-100页 |
| ·家蚕抗菌肽基因特异性扩增复制 | 第98页 |
| ·家蚕抗菌肽基因的表达调控 | 第98-100页 |
| 第七章 家蚕抗菌肽基因家族功能分化与进化分析 | 第100-112页 |
| ·材料和方法 | 第100-101页 |
| ·实验数据 | 第100-101页 |
| ·序列分析 | 第101页 |
| ·进化比较 | 第101页 |
| ·三维结构预测 | 第101页 |
| ·结果与分析 | 第101-108页 |
| ·家蚕抗菌肽的抗菌谱及活性分析 | 第101-102页 |
| ·家蚕抗菌肽的诱导表达模式 | 第102-104页 |
| ·序列分析 | 第104-106页 |
| ·碱基替代模式 | 第106页 |
| ·二级结构预测 | 第106-107页 |
| ·三维结构预测 | 第107-108页 |
| ·结论与讨论 | 第108-112页 |
| ·抗菌肽进化与功能分化 | 第108-109页 |
| ·调控序列差异与诱导表达模式 | 第109页 |
| ·家蚕抗菌肽的免疫诱导模式 | 第109-112页 |
| 第八章 综合与结论 | 第112-116页 |
| ·家蚕的免疫系统相关基因 | 第112页 |
| ·基于全基因组芯片的免疫诱导表达谱分析 | 第112页 |
| ·家蚕的Toll相关受体基因家族 | 第112-113页 |
| ·家蚕的抗菌肽基因家族及其进化和免疫诱导模式 | 第113-114页 |
| ·家蚕抗菌肽基因表达调控机制 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-124页 |
| 附录 | 第124-130页 |
| 博士在读期间发表文章、申请专利和参研课题情况 | 第130-132页 |
| 致谢 | 第132页 |
