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海洋环己酮降解菌及环己酮降解基因的研究

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-15页
1 前言第15-35页
   ·21 世纪将是手性技术和手性药物发展的世纪第15-16页
   ·手性技术的发展情况第16-17页
   ·Baeyer-Villiger 反应第17-18页
   ·环己酮单加氧酶(CHMO)第18-23页
   ·CHMO 催化机理第23-24页
   ·环己酮的代谢途径相关基因及CHMO 在其过程中的作用第24页
   ·环己酮利用菌的CHMO 基因及部分其他BVMO 基因的克隆第24-26页
   ·TYPE 1 型BVMO 的比较及底物范围的差异第26-27页
   ·环己酮加氧酶结构与功能的研究第27-28页
   ·利用环己酮单加氧酶的催化工艺改进第28-30页
   ·利用环己酮单加氧酶进行天然手性物质合成或生物制药的应用---第30-32页
   ·本论文的研究目的及意义第32-35页
2 材料和方法第35-54页
   ·材料第35-42页
   ·基本操作第42-45页
   ·方法第45-54页
3 结果与讨论第54-112页
   ·环己酮降解菌CN1 的筛选及功能研究第54-69页
     ·环己酮降解菌的筛选第54页
     ·pH,盐度,温度及环己酮浓度对CN1 生长的影响第54-56页
     ·抗生素抗性范围第56页
     ·CN1基因组GC含量测定第56页
     ·CN1的碳源利用范围第56-58页
     ·CN1对环己醇,环己酮,环戊酮的生物转化第58-59页
     ·厌氧情况下,CN1 对环己酮的降解第59-60页
     ·CN1 对药物中间体双环[3,2,0] -2-双键-6-酮的手性转化第60页
     ·CN1 环己酮的诱导表达分析第60-61页
     ·CN1 环己酮单加氧酶基因的克隆第61-62页
     ·环己酮降解过程中中间产物的研究第62-64页
     ·对环己酮代谢途径的推测第64-66页
     ·CN1 上表现的其他功能第66-69页
   ·环己酮单加氧酶基因及基因簇的克隆和功能研究第69-96页
     ·CN1 基因组酶切及杂交第69-70页
     ·含CHNB 的4.6k 的片段的克隆及鉴定第70页
     ·4.6K 核酸片段上的基因排布及特点第70-71页
     ·ChnB,ChnE,密码子使用的特点第71-72页
     ·ChnA,ChnB 的功能验证第72-74页
     ·CN1 基因组文库的构建第74页
     ·CN1 基因文库的筛选与鉴定第74-76页
     ·16C-9,16F-10 质粒的测序及整个环己酮降解基因簇的拼接第76-78页
     ·对所获基因簇的开放编码阅读框的分析第78-79页
     ·对所获基因簇上非编码区的分析第79-81页
     ·CN1 环己酮加氧酶系统发育分析第81-82页
     ·对CN1 环己酮加氧酶同源建模分析第82-83页
     ·CHNB 蛋白模型中氨基酸位置总体特征第83-85页
     ·九种环己酮加氧酶核心区域的建模分析第85-86页
     ·对一条重要多肽的分析第86-88页
     ·BVMO 反应机理的推测第88-90页
     ·ChnB 及其缺失突变在大肠杆菌中的表达第90-91页
     ·ChnB 与其他融合标签的共表达第91-92页
     ·His –ChnB 包涵体的复性第92-93页
     ·讨论第93-96页
   ·利用5 种碳源对印度洋热液口泥样的菌群富集和单菌分离第96-112页
     ·菌群分析第96-99页
     ·在属的水平上对筛选的手段及结果的分析第99-101页
     ·在富集筛选的过程中从表观发现的几株比较有特点的菌第101-102页
     ·用GC-MS 检测55 株菌对环己酮,环己醇,环戊酮,苯乙酮的转化第102-105页
     ·利用GC-MS 对其余61 株菌环己酮降解菌进行筛选第105页
     ·通过southern 杂交验证环己酮降解菌中环己酮加氧酶基因的存在第105页
     ·利用GC-MS 对19 株菌进行降解性能和降解范围的测定第105-107页
     ·相同165 的菌在GC-MS 分析的差异第107-108页
     ·部分菌alkB,p450 基因的克隆第108-109页
     ·讨论第109-112页
参考文献第112-118页
致谢第118页

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