| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 噻吩在分子筛中裂解机理的量子化学研究 | 第10-53页 |
| 第1章 文献综述及选题意义 | 第10-17页 |
| ·分子筛材料简介 | 第10-12页 |
| ·沸石与分子筛 | 第10页 |
| ·杂原子分子筛的结构 | 第10-11页 |
| ·杂原子分子筛的酸性 | 第11页 |
| ·杂原子分子筛的催化反应性能 | 第11-12页 |
| ·噻吩在酸性分子筛中的吸附和反应 | 第12-15页 |
| ·课题选择和研究方案 | 第15-17页 |
| ·课题选择 | 第15-16页 |
| ·研究方案 | 第16-17页 |
| 第2章 理论背景及计算方法 | 第17-28页 |
| ·理论背景 | 第17-24页 |
| ·从头计算法和Hartree-Fock理论 | 第17-20页 |
| ·密度泛函理论(Density Functional Theory，DFT) | 第20-22页 |
| ·势能面(PES)、反应通道(IRC)、活化能 | 第22-24页 |
| ·计算方法 | 第24页 |
| ·Cluster模型(Cluster approach) | 第24页 |
| ·平衡构型(minimum structure) | 第24页 |
| ·频率分析 | 第24页 |
| ·Mulliken布居分析 | 第24页 |
| ·计算工具 | 第24-28页 |
| ·Gaussian | 第24-25页 |
| ·GaussView | 第25页 |
| ·HyperChem | 第25页 |
| ·Ubuntu | 第25-26页 |
| ·自由软件R | 第26页 |
| ·Gaussian作业队列提交系统: qsubmit_gaussian.sh | 第26-27页 |
| ·Gaussian输出文件查看: gaussian_sum.pl | 第27页 |
| ·由过渡态抽取反应物、产物构型:fvib.pl | 第27-28页 |
| 第3章 噻吩裂解反应通道的理论模拟 | 第28-40页 |
| ·计算方案 | 第28-29页 |
| ·理论模型及计算参数的选择 | 第28页 |
| ·计算流程 | 第28-29页 |
| ·经验总结 | 第29页 |
| ·结果与讨论 | 第29-40页 |
| ·噻吩裂解反应通道 | 第29-35页 |
| ·消失的构型 | 第35-38页 |
| ·红外频率分析 | 第38-40页 |
| 第4章 分子筛骨架环境对反应活化能的影响 | 第40-51页 |
| ·计算方案及模型构造 | 第40-47页 |
| ·概述 | 第40-41页 |
| ·56T及34T骨架模型 | 第41-43页 |
| ·34T吸附模型 | 第43-46页 |
| ·56T吸附模型 | 第46-47页 |
| ·结果与讨论 | 第47-51页 |
| ·反应物分子在ZSM5模型中的吸附取向 | 第47-48页 |
| ·分子筛骨架环境对反应活化能的影响 | 第48-51页 |
| 第5章 总结与展望 | 第51-53页 |
| ·总结 | 第51页 |
| ·展望 | 第51-53页 |
| ·聚合与裂解 | 第51-52页 |
| ·氢的来源 | 第52-53页 |
| 第二部分 自由软件R及其在化学中的应用 | 第53-69页 |
| 第1章 自由软件 | 第53-54页 |
| 第2章 自由软件R | 第54-59页 |
| ·简介 | 第54页 |
| ·用户界面 | 第54-57页 |
| ·如何获得帮助 | 第57-59页 |
| 第3章 自由软件R在化学中的应用 | 第59-68页 |
| ·数据分析 | 第59-63页 |
| ·用于分子动力学数据的统计分析 | 第59-60页 |
| ·用于处理物理物学实验数据 | 第60-63页 |
| ·图形处理 | 第63-65页 |
| ·用于平滑谱图数据 | 第63-64页 |
| ·用于类氢原子径向波函数图的绘制 | 第64-65页 |
| ·开发平台 | 第65-68页 |
| ·用于碳纳米管分子模型的构造 | 第65-68页 |
| 第4章 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-73页 |
| 在学期间的研究成果 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 附录: 有用的小程序 | 第75-103页 |
| Gaussian作业循环提交系统: qsubmit_gauss.sh | 第76-79页 |
| Gaussian输出文件查看: gaussian_sum.pl | 第79-81页 |
| Gaussian输入文件修改: mod_gjf.pl | 第81-84页 |
| 由过渡态提取反应物、产物构型: fvib.pl | 第84-88页 |
| 冗余内坐标局部优化辅助工具: gen_fix_mod.pl | 第88-91页 |
| 文献代理验证工具: sdchecker.sh | 第91-97页 |
| 重要数据备份工具: backup.sh | 第97-99页 |
| 代理下载、验证工具: getproxy.sh、checkroxy.sh | 第99-103页 |
