PAP1和PAP2基因的克隆及其相关生物信息学研究
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 缩写词简表 | 第17-18页 |
| 前言 | 第18-21页 |
| 1 p53基因上游激活信号网络 | 第18页 |
| 2 细胞内P53蛋白表达水平的维持和调节 | 第18-19页 |
| 3 p53基因的下游功能网络 | 第19-21页 |
| 技术线路(一) | 第21-22页 |
| 技术线路(二) | 第22-23页 |
| 第一章 p53基因诱导表达可调控细胞系的建立 | 第23-49页 |
| 1 材料与方法 | 第23-34页 |
| ·材料 | 第23-25页 |
| ·方法 | 第25-34页 |
| 2 结果 | 第34-46页 |
| ·pTRE-p53质粒的构建 | 第34-39页 |
| ·p53基因诱导表达可调控细胞系的建立 | 第39-41页 |
| ·U251-pTet-p53细胞基因表达分析 | 第41-42页 |
| ·差异片段的亚克隆及序列测定 | 第42-46页 |
| 3 讨论 | 第46-48页 |
| ·生物信息学技术在基因克隆中的应用 | 第46页 |
| ·p53下游基因的克隆策略 | 第46-48页 |
| 4 结论 | 第48-49页 |
| 第二章 p53过度表达的cDNA文库的构建及筛选 | 第49-71页 |
| 1 材料与方法 | 第49-62页 |
| ·材料 | 第49-50页 |
| ·方法 | 第50-62页 |
| 2 结果 | 第62-68页 |
| ·RNA的提取及质量检测 | 第62-63页 |
| ·cDNA的合成、均一化及分级分离 | 第63-64页 |
| ·cDNA文库的质量评价 | 第64页 |
| ·文库筛选 | 第64-68页 |
| 3 讨论 | 第68-70页 |
| ·cDNA文库的构建质量 | 第68-69页 |
| ·均一化cDNA文库 | 第69-70页 |
| 4 结论 | 第70-71页 |
| 第三章 PAP1基因生物信息学分析及功能初步研究 | 第71-125页 |
| 1 材料与方法 | 第71-81页 |
| ·材料 | 第71-72页 |
| ·方法 | 第72-81页 |
| 2 结果 | 第81-120页 |
| ·PAP1基因生物信息学分析 | 第81-99页 |
| ·PAP1基因功能初步研究 | 第99-120页 |
| 3 讨论 | 第120-124页 |
| ·生物信息学技术在基因功能研究中的应用 | 第120-121页 |
| ·PAP1基因结构与功能 | 第121-123页 |
| ·尚需继续深入研究的课题 | 第123-124页 |
| 4 结论 | 第124-125页 |
| 第四章 PAP2基因生物信息学分析 | 第125-137页 |
| 1 材料与方法 | 第125页 |
| ·材料 | 第125页 |
| ·方法 | 第125页 |
| 2 结果 | 第125-135页 |
| 3 讨论 | 第135-136页 |
| 4 结论 | 第136-137页 |
| 第五章 p53下游基因的生物信息学研究 | 第137-176页 |
| 1 理论基础 | 第138-145页 |
| ·串模型 | 第138-139页 |
| ·PWM | 第139-140页 |
| ·词频分析法 | 第140-141页 |
| ·逻辑回归分析 | 第141-145页 |
| 2 数据与方法 | 第145-157页 |
| ·数据准备 | 第145-147页 |
| ·已报道的P53结合位点统计分析 | 第147-148页 |
| ·串模型特征计算 | 第148-150页 |
| ·PWM特征计算 | 第150-154页 |
| ·词频法 | 第154-156页 |
| ·logistic回归模型的建立 | 第156页 |
| ·基因组中p53下游基因的预测 | 第156页 |
| ·p53下游基因聚类分析 | 第156-157页 |
| 3 结果与讨论 | 第157-175页 |
| ·已报道的p53下游基因一致性调控序列统计分析 | 第157-164页 |
| ·串模型计算结果 | 第164-165页 |
| ·PWM模型计算结果 | 第165页 |
| ·词频模型计算结果 | 第165-166页 |
| ·logistic回归模型建立 | 第166-171页 |
| ·p53下游基因预测及分类 | 第171-175页 |
| 4 结论 | 第175-176页 |
| 参考文献 | 第176-189页 |
| p53基因调控网络研究进展 | 第189-209页 |
| 附录 | 第209-219页 |
| 致谢 | 第219-220页 |
| 攻读学位期间主要研究成果 | 第220页 |
