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结球白菜结球期叶片的表达序列标签及基因表达分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
前言第11-13页
第一章 文献综述第13-30页
   ·EST技术概述第13-14页
   ·EST研究的主要步骤第14-18页
     ·cDNA文库的构建第15页
     ·cDNA文库中阳性克隆的单向测序第15页
     ·EST数据的分析处理第15-18页
   ·EST的主要应用第18-22页
     ·作为遗传标记第18页
     ·用于新基因的发现第18-20页
     ·基因表达谱分析第20-21页
     ·作为外显子标签用于基因组诠释第21页
     ·用于制备cDNA微阵列第21页
     ·研究基因表达的动态性第21-22页
     ·基因电子克隆(in silico cloning)第22页
   ·EST研究的局限性第22页
   ·芸薹属作物的EST研究进展第22-23页
   ·转录本等比例扩增技术概述第23-27页
     ·体外转录(IVT in vitro transcription)方法第23-24页
     ·全面RT-PCR扩增方法第24-27页
     ·几种方法的比较与展望第27页
   ·结球白菜结球机理研究进展第27-28页
   ·本课题实验设计及研究目的第28-30页
第二章 结球白菜结球前期叶片表达序列标签(EST)的获取与分析第30-44页
   ·材料与方法第30-34页
     ·实验材料第30-31页
     ·EST序列的获得第31-34页
     ·EST序列数据的分析处理第34页
   ·结果与分析第34-38页
     ·质粒提取结果第34-35页
     ·质粒测序结果第35页
     ·EST数据的前处理第35-36页
     ·片段重叠群(contig)分析第36页
     ·EST序列同源性比较分析及其推测编码产物的功能分类第36-38页
   ·讨论第38-44页
     ·质粒提取部分第38-39页
     ·质粒序列测定部分第39-40页
     ·EST序列数据分析处理部分第40-44页
第三章 结球白菜结球前期叶片的基因表达分析第44-71页
   ·材料与方法第44-55页
     ·实验材料第44页
     ·TE-3D法提取叶片总RNA和DNA第44-45页
     ·利用全面扩增技术(PloyAPCR)扩增cDNA第45-47页
     ·cDNA arrays的构建第47-49页
     ·cDNA arrays的杂交第49-50页
     ·Northern杂交第50-51页
     ·基因组Southern杂交第51-52页
     ·快速扩增cDNA末端(RACE)第52-55页
   ·结果与分析第55-63页
     ·cDNA扩增第55-56页
     ·cDNA插入片段的扩增第56-57页
     ·cDNA arrays的构建和杂交第57页
     ·部分候选基因的杂交验证及全长序列的获得第57-63页
   ·讨论第63-71页
     ·cDNA的全面扩增技术第63页
     ·cDNA阵列的制作和杂交第63-64页
     ·结球白菜结球期叶片基因表达网络预测第64-71页
第四章 结论第71-73页
参考文献第73-83页
致谢第83-84页
附表与图版第84-124页

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