| 中文摘要 | 第1-4页 |
| 英文摘要 | 第4-12页 |
| Ⅰ 前言 | 第12-47页 |
| 1 海洋生物多样性 | 第12-15页 |
| ·海洋生物的分类 | 第12-14页 |
| ·海洋生物的系统分类 | 第13页 |
| ·依据生态类群进行分类 | 第13-14页 |
| ·海洋生物多样性的重要意义 | 第14-15页 |
| ·海洋生物是人类重要的食物和蛋白质资源 | 第14页 |
| ·海洋生物是生物活性物质的重要来源 | 第14-15页 |
| 2 海洋微生物多样性 | 第15-32页 |
| ·海洋微生物种类的多样性 | 第15-21页 |
| ·海洋细菌 | 第16-18页 |
| ·海洋放线菌 | 第18页 |
| ·海洋蓝细菌 | 第18页 |
| ·海洋古菌 | 第18-19页 |
| ·海洋真菌 | 第19-21页 |
| ·海洋微生物多样性的研究 | 第21-28页 |
| ·16S rDNA结构特征及其在海洋微生物多样性研究中的应用 | 第22-25页 |
| ·16S rDNA序列的结构特征 | 第22-23页 |
| ·16S rDNA海洋微生物多样性研究中的应用 | 第23页 |
| ·微生物16S rRNA基因序列分析 | 第23-24页 |
| ·荧光原位杂交 | 第24-25页 |
| ·核糖体基因间隔区自动化分析 | 第25-26页 |
| ·核酸杂交分析技术 | 第26-28页 |
| ·海洋微生物多样性的研究现状 | 第28页 |
| ·海洋微生物是海洋天然活性物质的重要来源 | 第28-32页 |
| ·来源于海洋细菌等原核微生物的天然活性物质 | 第28-31页 |
| ·来源于海洋真菌的天然活性物质 | 第31页 |
| ·其他 | 第31-32页 |
| ·海洋生物资源的开发前景 | 第32页 |
| 3 海洋共附生微生物 | 第32-35页 |
| ·共附生微生物及其宿主 | 第32-33页 |
| ·共生微生物与宿主的关系 | 第33-34页 |
| ·活性物质来源假说 | 第34-35页 |
| 4 海绵动物 | 第35-45页 |
| ·海绵动物的种类及其分类 | 第35-38页 |
| ·海绵动物的重要特征 | 第38-41页 |
| ·海绵动物与其它海洋生物的共生 | 第38页 |
| ·海绵共附生微生物 | 第38-41页 |
| ·海绵体内微生物对海绵动物的重要意义 | 第39-40页 |
| ·微生物在天然活性物质生成过程中的重要作用 | 第40-41页 |
| ·海绵及其体内微生物是海洋天然活性物质的宝贵资源 | 第41-45页 |
| ·海绵体内的抗真菌、抗病毒活性物质 | 第41-42页 |
| ·海绵体内的抗心血管活性物质 | 第42-43页 |
| ·海绵共附生微生物产生的天然活性物质 | 第43-44页 |
| ·我海绵资源开发研究 | 第44-45页 |
| 5 本课题的研究背景和意义 | 第45-47页 |
| Ⅱ 厚指海绵Pachychalina sp.和皮海绵Suberites sp.体内真细菌多样性研究 | 第47-72页 |
| 1 实验仪器与药品 | 第47-48页 |
| ·实验仪器 | 第47页 |
| ·实验药品 | 第47-48页 |
| ·引物合成和测序 | 第48页 |
| 2 实验材料和方法 | 第48-58页 |
| ·实验材料 | 第48页 |
| ·材料的采集 | 第48页 |
| ·材料的处理 | 第48页 |
| ·海绵体内细菌基因组DNA制备 | 第48-50页 |
| ·海绵体内细菌基因组DNA的提取 | 第48-49页 |
| ·细菌基因组DNA的回收、纯化 | 第49-50页 |
| ·海绵体内真细菌16S rRNA编码基因的克隆 | 第50页 |
| ·转化 | 第50-53页 |
| ·PCR产物的连接 | 第50-51页 |
| ·XL1感受态细胞的制备 | 第51页 |
| ·连接产物的转化 | 第51-52页 |
| ·质粒的微量提取 | 第52-53页 |
| ·目的基因片段的再克隆和克隆产物的回收 | 第53-54页 |
| ·目的基因片段的再克隆 | 第53页 |
| ·克隆产物的回收 | 第53-54页 |
| ·真细菌16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(ARDRA)银染分析 | 第54-57页 |
| ·真细菌16S rDNA的限制性酶切 | 第54页 |
| ·限制性酶切片段长度多态性(ARDRA)银染分析 | 第54-57页 |
| ·电泳 | 第54-56页 |
| ·银染分析 | 第56页 |
| ·聚类分析 | 第56-57页 |
| ·真细菌16S rDNA序列分析 | 第57-58页 |
| ·真细菌16S rDNA的测序 | 第57页 |
| ·真细菌16S rDNA序列相似性分析 | 第57页 |
| ·根据16S rDNA序列构建海绵体内真细菌的系统发育树 | 第57-58页 |
| 3 结果与分析 | 第58-72页 |
| ·海绵体内真细菌基因组DNA提取结果 | 第58-59页 |
| ·海绵体内真细菌16S rRNA编码基因的克隆和再克隆 | 第59-60页 |
| ·海绵体内真细菌16S rRNA编码基因的克隆结果 | 第59页 |
| ·海绵体内真细菌16S rRNA编码基因的再克隆结果 | 第59-60页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内真细菌的多样性 | 第60-69页 |
| ·16S rDNA的ARDRA银染方法对厚指海绵Pachychalina sp.体内真细菌多样性研究的结果 | 第60-65页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.真细菌16S rDNA的BLAST分析结果 | 第65页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内真细菌16S rDNA的Alignment分析结果 | 第65-67页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.真细菌的系统发育树 | 第67-69页 |
| ·皮海绵Suberites sp.体内真细菌的多样性 | 第69-72页 |
| Ⅲ 厚指海绵Pachychalina sp.和皮海绵Suberites sp.体内古菌多样性研究 | 第72-91页 |
| 1 实验仪器与药品 | 第73页 |
| ·实验仪器 | 第73页 |
| ·实验药品 | 第73页 |
| ·PCR扩增反应引物 | 第73页 |
| 2 实验材料和方法 | 第73-77页 |
| ·实验材料 | 第73-74页 |
| ·材料的采集 | 第73页 |
| ·材料的处理 | 第73-74页 |
| ·海绵体内古细菌基因组DNA的制备 | 第74页 |
| ·海绵体内古细菌基因组DNA的提取 | 第74页 |
| ·古细菌基因组DNA的回收、纯化 | 第74页 |
| ·古细菌16S rRNA编码基因的克隆 | 第74页 |
| ·转化 | 第74-75页 |
| ·PCR产物的连接 | 第74-75页 |
| ·XL1感受态细胞的制备 | 第75页 |
| ·连接产物的转化 | 第75页 |
| ·菌落筛选 | 第75页 |
| ·目的基因片段的再克隆和克隆产物的回收 | 第75页 |
| ·目的基因的再克隆 | 第75页 |
| ·克隆产物的回收 | 第75页 |
| ·古细菌16S rDNA的限制性酶切片段长度多态性银染分析 | 第75-76页 |
| ·古细菌16S rDNA的限制性酶切 | 第75页 |
| ·限制性酶切片段长度多态性银染分析 | 第75-76页 |
| ·电泳 | 第75页 |
| ·银染分析 | 第75-76页 |
| ·聚类分析 | 第76页 |
| ·古细菌16SrDNA的序列分析 | 第76-77页 |
| ·古细菌16SrDNA测序 | 第76页 |
| ·古细菌16SrDNA序列相似性分析 | 第76页 |
| ·根据16S rDNA构建海绵体内古细菌的系统发育树 | 第76-77页 |
| 3 结果与分析 | 第77-91页 |
| ·海绵体内古细菌基因组DNA提取结果 | 第77页 |
| ·海绵体内古细菌16S rRNA编码基因的克隆、再克隆 | 第77-78页 |
| ·海绵体内古细菌16S rRNA编码基因的克隆结果 | 第77页 |
| ·海绵体内古细菌16S rRNA编码基因的再克隆结果 | 第77-78页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内古细菌的多样性 | 第78-88页 |
| ·16S rDNA的ARDRA银染方法对厚指海绵Pachychalina sp.体内古细菌多样性研究的结果 | 第78-83页 |
| ·古细菌16S rDNA的BLAST分析 | 第83页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内古细菌16S rDNA与数据库中收录古细菌16S rDNAs的Alignment分析结果 | 第83-84页 |
| ·3月份厚指海绵Pachychalina sp.古细菌16S rDNA的Alignment分析结果 | 第84-85页 |
| ·3月份和7月份厚指海绵Pachychalinasp.古细菌16S rDNA的Alignment分析的结果 | 第85-86页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内古细菌无根系统发育树 | 第86-87页 |
| ·厚指海绵Pachychalina sp.体内古细菌有根系统发育树 | 第87-88页 |
| ·皮海绵Suberites sp.体内古细菌多样性 | 第88-91页 |
| Ⅳ 讨论 | 第91-97页 |
| 1 16S rDNA在海洋微生物多样性研究中的地位 | 第91-92页 |
| 2 厚指海绵Pachychalina sp.古细菌、真细菌多样性 | 第92-94页 |
| 3 海水环境温度可能对海绵体内真细菌、古细菌组成的影响 | 第94-95页 |
| 4 皮海绵Suberites sp.体内古细菌、真细菌多样性 | 第95页 |
| 5 不同海绵物种体内真细菌、古细菌组成上的异同 | 第95-97页 |
| Ⅴ 结论 | 第97-99页 |
| Ⅵ 研究成果 | 第99-100页 |
| 参考文献 | 第100-113页 |
| 致谢 | 第113页 |
