| 提要 | 第1-7页 |
| 第一章 项目介绍和背景 | 第7-11页 |
| ·水稻基因组研究状况 | 第7-9页 |
| ·水稻基因组的测序 | 第7-8页 |
| ·水稻基因组的特点 | 第8-9页 |
| ·杂种优势的概念、机理及应用 | 第9-10页 |
| ·杂种优势概念及机理 | 第9-10页 |
| ·超级杂交稻LYP9 | 第10页 |
| ·论文的主要内容 | 第10-11页 |
| 第二章 LYP9及其亲本SAGE转录组数据的分析和研究 | 第11-19页 |
| ·材料与方法 | 第11-13页 |
| ·分析数据来源 | 第11页 |
| ·SAGE标签定位策略的选择 | 第11-12页 |
| ·表达差异标签的统计和功能注释 | 第12页 |
| ·差异基因表达模式分析 | 第12-13页 |
| ·数据分析结果 | 第13-19页 |
| ·各文库SAGE标签的注释及分布 | 第13页 |
| ·杂种优势相关差异表达基因的表达模式 | 第13-15页 |
| ·杂种优势相关差异表达基因的功能分析 | 第15-19页 |
| 第三章 生物数据库和HRGD | 第19-25页 |
| ·生命科学中数据库的应用 | 第19-21页 |
| ·生物信息数据库简介 | 第19页 |
| ·生物信息数据库的特性 | 第19-20页 |
| ·生物信息数据库的发展现状 | 第20-21页 |
| ·HRGD数据库建立的背景及意义 | 第21-23页 |
| ·HRGD数据库数据的数据及整合 | 第23-25页 |
| 第四章 HRGD数据库的构建 | 第25-37页 |
| ·数据库的设计 | 第25-26页 |
| ·架构设计 | 第26-28页 |
| ·B/S的架构 | 第26页 |
| ·Hibernate的ORM技术 | 第26-27页 |
| ·系统架构方案 | 第27-28页 |
| ·HRGD数据库网站的功能设计 | 第28-30页 |
| ·数据库及网站开发平台硬件 | 第28-29页 |
| ·HRGD数据库功能模块的设计 | 第29-30页 |
| ·数据库的ORM层开发 | 第30-37页 |
| ·Hibernate 的架构 | 第30-32页 |
| ·HRGD中Hibernate的应用 | 第32-37页 |
| 第五章 数据库功能和发展方向 | 第37-47页 |
| ·数据库的功能 | 第37-44页 |
| ·查询模块功能的开发和实现 | 第37-38页 |
| ·BLAST比对工具的整合 | 第38-40页 |
| ·GO功能注释和分类工具的开发 | 第40页 |
| ·KEGG代谢途径注释工具 | 第40-42页 |
| ·基因表达模式分布图的开发 | 第42页 |
| ·染色体的分布 | 第42-44页 |
| ·HRGD数据库的发展方向 | 第44-47页 |
| ·HRGD数据统计 | 第44页 |
| ·数据的在线递交系统 | 第44页 |
| ·HRGD数据库的发展方向 | 第44-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 硕士期间完成论文 | 第52-53页 |
| 摘要 | 第53-56页 |
| Abstract | 第56-59页 |
| 致谢 | 第59页 |