| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1 梨黑星病研究现状 | 第12-16页 |
| ·梨黑星菌病原 | 第12-13页 |
| ·类型 | 第12页 |
| ·区别 | 第12页 |
| ·生理分化 | 第12-13页 |
| ·梨黑星菌的产孢及传播 | 第13页 |
| ·梨黑星菌产孢 | 第13页 |
| ·梨黑星菌的传播 | 第13页 |
| ·入侵机制、发病条件和预测预报 | 第13-14页 |
| ·入侵机制和发病条件 | 第13-14页 |
| ·预测预报 | 第14页 |
| ·梨黑星病抗性机理的研究 | 第14-16页 |
| ·龄期与抗性 | 第14-15页 |
| ·品种与抗性 | 第15页 |
| ·抗性遗传 | 第15页 |
| ·抗性生理机理 | 第15-16页 |
| ·抗性分子机制 | 第16页 |
| 2 植物启动子研究进展 | 第16-21页 |
| ·植物基因启动子的结构特征 | 第16-18页 |
| ·转录起始位点 | 第17页 |
| ·TATA-BOX | 第17页 |
| ·CAAT-BOX | 第17-18页 |
| ·GC-BOX | 第18页 |
| ·其它顺式作用元件 | 第18页 |
| ·启动子的类型 | 第18-19页 |
| ·组成型启动子 | 第18-19页 |
| ·诱导型启动子 | 第19页 |
| ·组织特异型启动子 | 第19页 |
| ·启动子的研究方法 | 第19-21页 |
| ·生物信息学预测分析 | 第20页 |
| ·功能分析 | 第20-21页 |
| 3 类受体蛋白(receptor-like protein,RLP) | 第21-22页 |
| ·类受体蛋白的结构 | 第21页 |
| ·类受体蛋白的功能 | 第21-22页 |
| 4 生物信息学在植物抗病研究中的应用 | 第22页 |
| ·核酸结构和功能预测 | 第22页 |
| ·蛋白质结构和功能预测 | 第22页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 第二章 梨抗黑星病基因Hcrp克隆和生物信息学分析 | 第24-41页 |
| 1 前言 | 第24页 |
| 2 材料与试剂 | 第24页 |
| ·材料 | 第24页 |
| ·试验试剂 | 第24页 |
| ·主要仪器 | 第24页 |
| 3 试验方法 | 第24-31页 |
| ·DNA提取及检测 | 第24-25页 |
| ·CTAB大量发提取梨叶片DNA | 第24-25页 |
| ·DNA检测 | 第25页 |
| ·RNA提取(CTAB法) | 第25-26页 |
| ·cDNA第一条链合成 | 第26页 |
| ·引物设计 | 第26页 |
| ·Hcrp基因同源克隆 | 第26页 |
| ·产物回收、克隆及测序 | 第26-29页 |
| ·目的片段回收 | 第26-27页 |
| ·目的片段与pEASY-T1载体连接 | 第27-28页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞制备 | 第28页 |
| ·转化及蓝白斑筛选 | 第28-29页 |
| ·菌液PCR检测 | 第29页 |
| ·测序 | 第29页 |
| ·生物信息学分析 | 第29-31页 |
| ·核苷酸分析 | 第30页 |
| ·蛋白质聚类分析 | 第30页 |
| ·蛋白质预测分析 | 第30-31页 |
| 4 结果分析 | 第31-39页 |
| ·Hcrp基因PCR扩增 | 第31-32页 |
| ·ORF预测和系统树分析 | 第32-33页 |
| ·LRR分析 | 第33页 |
| ·编码区域预测结果 | 第33-39页 |
| ·氨基酸组成分析 | 第33-34页 |
| ·跨膜区分析 | 第34页 |
| ·信号肽预测 | 第34-35页 |
| ·糖基化位点预测 | 第35页 |
| ·α螺旋和β折叠分析 | 第35-37页 |
| ·模体预测 | 第37页 |
| ·亚细胞定位 | 第37-38页 |
| ·三级结构预测 | 第38-39页 |
| 5 讨论 | 第39-41页 |
| ·Hcrp基因结构分析 | 第39页 |
| ·Hcrp基因抗病性分析 | 第39-40页 |
| ·同源序列克隆抗病基因 | 第40-41页 |
| 第三章 Hcrp启动子克隆和生物信息学分析 | 第41-49页 |
| 1 前言 | 第41页 |
| 2 材料与试剂 | 第41页 |
| ·材料 | 第41页 |
| ·试验试剂 | 第41页 |
| 3 试验方法 | 第41-44页 |
| ·DNA提取及检测 | 第41页 |
| ·Hcrp启动子克隆 | 第41-42页 |
| ·引物设计 | 第41-42页 |
| ·同源PCR扩增Hcrp启动子序列 | 第42页 |
| ·PCR验证所克隆的启动子 | 第42页 |
| ·产物回收、克隆及测序 | 第42-43页 |
| ·目的片段回收 | 第42-43页 |
| ·目的片段与pEASY-T1载体连接 | 第43页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞制备 | 第43页 |
| ·转化及蓝白斑筛选 | 第43页 |
| ·菌液PCR检测 | 第43页 |
| ·测序 | 第43页 |
| ·生物信息学分析 | 第43-44页 |
| 4 结果分析 | 第44-47页 |
| ·同源PCR扩增Hcrp基因启动子 | 第44页 |
| ·PCR验证所克隆的启动子 | 第44-45页 |
| ·生物信息学分析所克隆的启动子序列 | 第45-47页 |
| ·比对与转录起始位点预测 | 第45-46页 |
| ·顺式作用元件预测 | 第46-47页 |
| 5 讨论 | 第47-49页 |
| 第四章 类受体蛋白分析 | 第49-59页 |
| 1 前言 | 第49页 |
| 2 材料与试剂 | 第49页 |
| ·材料 | 第49页 |
| ·试验试剂 | 第49页 |
| 3 试验方法 | 第49-52页 |
| ·DNA提取及检测 | 第49-50页 |
| ·引物设计 | 第50页 |
| ·RLP序列克隆 | 第50页 |
| ·产物回收、克隆及测序 | 第50-51页 |
| ·目的片段回收 | 第50页 |
| ·目的片段与pEASY-T1载体连接 | 第50页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞制备 | 第50页 |
| ·转化及蓝白斑筛选 | 第50-51页 |
| ·菌液PCR检测 | 第51页 |
| ·测序 | 第51页 |
| ·生物信息学分析 | 第51-52页 |
| ·系统进化分析 | 第51-52页 |
| ·序列比对分析和Ka/Ks分析 | 第52页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第52页 |
| 4 结果分析 | 第52-57页 |
| ·RLP扩增 | 第52-53页 |
| ·系统进化分析 | 第53页 |
| ·序列比对 | 第53-55页 |
| ·组内和组间Ka/Ks(异义替换/同义替换)分析 | 第55页 |
| ·核苷酸多样性和Ka/Ks分析 | 第55-56页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第56-57页 |
| 5 讨论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-70页 |
| 致谢 | 第70页 |