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基因组、转录组技术在云南地区地中海贫血防控及重楼育种的应用

中文摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 基于高通量测序技术的地中海贫血携带者的筛查方法的建立与应用第7-28页
    一、前言第7-13页
        1、地中海贫血临床诊断标准第10-11页
            1.1 α地中海贫血第10页
            1.2 β地中海贫血第10-11页
        2、常规地贫检测方法第11-13页
            2.1 细胞分析第11-12页
            2.2 蛋白分析第12页
            2.3 基因分析第12-13页
            2.4 NGS第13页
    二、实验内容第13-22页
        1、研究对象第13-14页
        2、研究路线第14页
        3、诊断标准第14-15页
        4、研究内容第15-22页
            4.1 传统筛查第15-17页
                4.1.1 血红蛋白电泳第15-17页
                4.2.2 血常规检测第17页
            4.2 NGS筛查第17-22页
    三、实验结果第22-26页
    四、讨论分析第26-27页
    五、研究成果第27-28页
第二章 基于miRNA转录组测序技术对滇重楼种子休眠调控分子机制中的初步分析第28-50页
    一、前言第28-32页
        1、microRNA概述第28-29页
        2、滇重楼概述第29-31页
        3、转录组测序(RNA-seq)概述第31-32页
    二、材料与方法第32-40页
        1、实验平台第32-33页
        2、实验方法第33-40页
            2.1 RNA的制备、文库建立和Illumina测序第33-34页
            2.2 转录组组装及注释第34-36页
                2.2.1 测序数据过滤第34页
                2.2.2 De novo组装第34页
                2.2.3 注释第34-36页
            2.3 Small RNA的生物信息学分析第36-40页
                2.3.1 数据处理第37-38页
                2.3.2 标准信息分析第38页
                2.3.3 已知miRNA分析第38-39页
                2.3.4 新miRNA分析第39-40页
    三、实验结果第40-47页
        1、转录组测序、组装和注释第40-41页
        2、 SmallRNA测序及注释的概述第41-43页
        3、滇重楼的保守miRNA第43-44页
        4、滇重楼的异常miRNA第44页
        5、新发现的保守miRNA的靶向预测第44-47页
    四、讨论分析第47-49页
    五、研究成果第49-50页
第三章 展望第50-51页
参考文献第51-60页
附录一第60-62页
附录二第62-63页
硕士研究生期间论文发表和项目参与情况第63-65页
致谢第65页

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