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镉胁迫下MAPKs对通道蛋白的调控机理

中文摘要第3-5页
abstract第5-6页
第1章 文献综述第10-26页
    1.1 重金属镉第10-12页
        1.1.1 镉的理化性质第10页
        1.1.2 镉的应用及危害第10-11页
        1.1.3 镉毒性机理的研究现状第11-12页
    1.2 镉对MAPK信号转导途径的影响第12-15页
    1.3 不同物种中镉的通道蛋白第15-23页
        1.3.1 金属硫蛋白第15-16页
        1.3.2 Zn~(2+)通道蛋白第16-17页
        1.3.3 Fe~(2+)通道蛋白第17-19页
        1.3.4 Ca~(2+)通道蛋白第19-23页
    1.4 酿酒酵母作为模式生物第23页
    1.5 本课题的研究目的和意义第23-26页
第2章 镉胁迫下hog1,slt2菌株差异基因表达谱的构建第26-54页
    2.1 引言第26页
    2.2 实验材料第26-28页
        2.2.1 实验用酵母菌株第26-27页
        2.2.2 实验用主要试剂第27页
        2.2.3 培养基的配制第27-28页
    2.3 实验方法第28-33页
        2.3.1 酵母菌株保存及培养第28页
        2.3.2 酿酒酵母细胞RNA提取第28页
        2.3.3 转录组测序流程第28-29页
        2.3.4 转录组数据生物信息学分析第29-31页
        2.3.5 实时荧光定量PCR第31-33页
    2.4 实验结果第33-50页
        2.4.1 总RNA提取及质量检测第33-34页
        2.4.2 测序数据质量评估第34-36页
        2.4.3 差异表达基因筛选第36-37页
        2.4.4 RT-qPCR验证差异表达基因第37页
        2.4.5 野生型BY4741在镉胁迫下的转录应答第37-40页
        2.4.6 镉胁迫下酵母MAPKs缺失细胞的转录应答第40-45页
        2.4.7 MAPKs下游调控基因的挖掘第45-50页
    2.5 分析与讨论第50-52页
        2.5.1 菌株基因型和表型验证第50页
        2.5.2 镉胁迫下野生型酵母细胞的基因表达谱第50-51页
        2.5.3 蛋白互作研究第51-52页
    2.6 本章小结第52-54页
第3章 Hog1p和 Sltp2调控通道蛋白的筛选第54-68页
    3.1 引言第54页
    3.2 实验材料第54-58页
        3.2.1 实验用酵母菌株、质粒和引物第54-56页
        3.2.2 实验用主要试剂第56-57页
        3.2.3 主要溶液和培养基配制第57-58页
    3.3 实验方法第58-61页
        3.3.1 酵母基因组提取第58页
        3.3.2 PCR反应体系第58-60页
        3.3.3 酶切反应体系第60页
        3.3.4 酵母转化第60页
        3.3.5 倍比稀释表型分析第60-61页
        3.3.6 原子吸收测定第61页
    3.4 实验结果第61-66页
        3.4.1 单基因缺失菌株的表型验证第61-63页
        3.4.2 双基因缺失菌株构建第63-64页
        3.4.3 双基因缺失菌株的表型分析第64-66页
    3.5 分析与讨论第66-67页
        3.5.1 多个基因的作用仍待探究第66页
        3.5.2 细胞内镉含量在一定范围内随外界镉浓度增加而增加第66-67页
        3.5.3 半胱氨酸转运蛋白可能参与镉胁迫应答第67页
    3.6 本章小结第67-68页
第4章 通道蛋白Yct1p和Smf1p/2p的表达分析第68-90页
    4.1 引言第68页
    4.2 实验材料第68-72页
        4.2.1 实验用菌株和质粒第68-69页
        4.2.2 本部分实验试剂及酶制剂第69-70页
        4.2.3 主要溶液和培养基配制第70-72页
    4.3 实验方法第72-79页
        4.3.1 基因克隆第72-75页
        4.3.2 酵母质粒转化第75页
        4.3.3 β-半乳糖苷酶活力测定第75-76页
        4.3.4 酵母蛋白提取第76页
        4.3.5 Western Blot检测蛋白表达第76-77页
        4.3.6 荧光显微观察蛋白定位第77页
        4.3.7 GST beads使用方法第77-78页
        4.3.8 染色质免疫共沉淀第78-79页
    4.4 实验结果第79-86页
        4.4.1 重组质粒构建第79-82页
        4.4.2 转录因子Msn2p、Msn4p和Hot1p负调控Yct1p第82-83页
        4.4.3 Hog1p对 Yct1p具有正调控作用第83-84页
        4.4.4 镉处理前后Yct1p均在细胞质表达第84-85页
        4.4.5 染色质免疫沉淀验证Swi6p对Smf1p/2p的调控位点第85-86页
    4.5 分析与讨论第86-88页
        4.5.1 YCT1启动子上具有Msn2p/4p的结合序列第86-87页
        4.5.2 Yct1p定位仍待确定第87页
        4.5.3 难以获得Smp1p的纯化蛋白第87-88页
    4.6 本章小结第88-90页
第5章 结论与展望第90-92页
参考文献第92-102页
附录第102-106页
发表论文和参加科研情况说明第106-108页
致谢第108页

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