| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 引言 | 第10-18页 |
| 1.1 香蕉枯萎病菌简介 | 第10-12页 |
| 1.1.1 香蕉生产和香蕉枯萎病的危害 | 第10页 |
| 1.1.2 香蕉枯萎病菌的病原学和生物学性状 | 第10-11页 |
| 1.1.3 香蕉枯萎病菌的侵染过程 | 第11页 |
| 1.1.4 香蕉枯萎病的病害症状 | 第11页 |
| 1.1.5 香蕉枯萎病的致病机理 | 第11-12页 |
| 1.2 真菌小RNA(MicroRNA-like RNA) | 第12-17页 |
| 1.2.1 真菌小RNA简介 | 第12-13页 |
| 1.2.2 真菌milRNA的特点、生物合成、作用机制及应用 | 第13-15页 |
| 1.2.3 真菌milRNA的研究方法 | 第15-17页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-30页 |
| 2.1 供试材料与主要仪器 | 第18-19页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第18页 |
| 2.1.2 克隆载体及表达载体 | 第18页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第19页 |
| 2.2 Foc1与Foc4的菌丝、孢子样品的测序及分析 | 第19-21页 |
| 2.2.1 测序样品的处理 | 第19-20页 |
| 2.2.2 Solexa测序实验流程 | 第20-21页 |
| 2.3 Novel milRNA的鉴定 | 第21-30页 |
| 2.3.1 高丰度表达milRNAs的鉴定 | 第21-23页 |
| 2.3.2 低丰度表达milRNAs的鉴定 | 第23-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-47页 |
| 3.1 香蕉枯萎病菌milRNAs的深度测序结果分析 | 第30-42页 |
| 3.1.1 Solexa测序原始数据的统计与分析 | 第30页 |
| 3.1.2 样品间小分子RNAs公共及特有序列的统计、分析 | 第30-34页 |
| 3.1.3 样品中各类小分子RNAs的分布 | 第34-36页 |
| 3.1.4 样品中候选小RNAs的预测 | 第36页 |
| 3.1.5 milRNA序列的长度分布图 | 第36-38页 |
| 3.1.6 milRNA成熟序列的碱基偏好性分析 | 第38页 |
| 3.1.7 miRNA靶基因的预测 | 第38-39页 |
| 3.1.8 GO功能分类 | 第39页 |
| 3.1.9 milRNA靶基因的KEGG路径富集图 | 第39-42页 |
| 3.2 高丰度milRNA的鉴定 | 第42页 |
| 3.3 低丰度milRNA的鉴定 | 第42-47页 |
| 3.3.1 克隆载体pMD-milRNA的双酶切验证 | 第42-43页 |
| 3.3.2 植物表达载体pS-milRNA的构建 | 第43-44页 |
| 3.3.3 植物表达载体pSuper-milRNA农杆菌转化 | 第44-45页 |
| 3.3.4 低丰度表达milRNA的Northern杂交验证 | 第45-47页 |
| 4 讨论 | 第47-51页 |
| 4.1 关于供试病原菌的选择 | 第47页 |
| 4.2 关于高通量测序技术的选择 | 第47-48页 |
| 4.3 关于真菌milRNA序列的长度分布 | 第48页 |
| 4.4 关于成熟milRNA序列碱基偏好性的分析 | 第48-49页 |
| 4.5 关于香蕉枯萎病菌milRNAs的Northern杂交 | 第49-51页 |
| 5 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 附录 | 第56-78页 |
| 在校期间发表文章及参与项目 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
