| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 引言 | 第14-22页 |
| 1 罗非鱼简介 | 第14页 |
| 2 鱼类中MHC基因的研究进展 | 第14-19页 |
| 2.1 MHC基因的分类 | 第14-15页 |
| 2.2 MHC基因的功能 | 第15-16页 |
| 2.3 MHC基因的遗传多样性 | 第16-17页 |
| 2.4 MHC基因遗传多样性与抗病相关性分析 | 第17-19页 |
| 3 单核苷酸多态性分子标记及在鱼类抗病性中的研究进展 | 第19-20页 |
| 3.1 单核苷酸多态性分子标记 | 第19页 |
| 3.2 SNP分子标记与鱼类抗病性的研究进展 | 第19-20页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第20-22页 |
| 第一章 尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因多态性与无乳链球菌抗性的关联分析 | 第22-34页 |
| 1 材料和方法 | 第22-25页 |
| 1.1 实验材料 | 第22-23页 |
| 1.2 感染实验 | 第23页 |
| 1.3 基因组的提取 | 第23-24页 |
| 1.4 引物设计和PCR扩增 | 第24页 |
| 1.5 PCR产物的克隆与测序 | 第24页 |
| 1.6 序列多态性分析 | 第24-25页 |
| 1.7 验证实验 | 第25页 |
| 2 结果与分析 | 第25-31页 |
| 2.1 易感群体和抗病群体的划分 | 第25页 |
| 2.2 MHC ⅡA基因序列分析 | 第25-26页 |
| 2.3 尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因的多态性 | 第26-28页 |
| 2.4 MHC ⅡA等位基因在易感群体和抗病群体中的分布 | 第28-29页 |
| 2.5 MHC ⅡA等位基因与无乳链球菌抗性相关性分析 | 第29-30页 |
| 2.6 惠州群体MHC ⅡA等位基因与无乳链球菌抗性相关性分析 | 第30-31页 |
| 3 讨论 | 第31-34页 |
| 第二章 尼罗罗非鱼MHCⅡB基因多态性与无乳链球菌抗性的关联分析 | 第34-44页 |
| 1 材料和方法 | 第34-35页 |
| 1.1 实验材料 | 第34页 |
| 1.2 感染实验 | 第34-35页 |
| 1.3 基因组的提取 | 第35页 |
| 1.4 引物设计和PCR扩增 | 第35页 |
| 1.5 PCR产物的克隆与测序 | 第35页 |
| 1.6 序列多态性分析 | 第35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-41页 |
| 2.1 12个尼罗罗非鱼家系的抗病性 | 第35-36页 |
| 2.2 MHC ⅡB基因序列分析 | 第36-38页 |
| 2.3 尼罗罗非鱼MHC ⅡB基因的多态性 | 第38-39页 |
| 2.4 MHC ⅡB等位基因在12个尼罗罗非鱼家系的分布 | 第39-40页 |
| 2.5 MHC ⅡB基因多态性与无乳链球菌抗性的关联性分析 | 第40-41页 |
| 3 讨论 | 第41-44页 |
| 第三章 尼罗罗非鱼β_2m基因单核苷酸多态性与无乳链球菌抗性的关联分析 | 第44-56页 |
| 1 材料和方法 | 第45-46页 |
| 1.1 实验材料 | 第45页 |
| 1.2 感染实验 | 第45页 |
| 1.3 基因组DNA的提取 | 第45页 |
| 1.4 尼罗罗非鱼β_2m基因序列SNP位点的筛查 | 第45-46页 |
| 1.5 β_2m基因序列SNP位点的基因分型 | 第46页 |
| 1.6 数据统计分析 | 第46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-54页 |
| 2.1 β_2m基因序列SNP位点及分析 | 第46-47页 |
| 2.2 β_2m基因SNP位点遗传参数分析 | 第47-50页 |
| 2.3 β_2m基因SNP位点基因型和等位基因频率与无乳链球菌抗性关联分析 | 第50-52页 |
| 2.4 β_2m基因SNP位点的单倍型分析及单倍型与无乳链球菌抗性关联分析 | 第52-54页 |
| 3 讨论 | 第54-56页 |
| 第四章 3个不同尼罗罗非鱼群体MHC ⅡA基因多态性和遗传分化 | 第56-64页 |
| 1 材料和方法 | 第56-57页 |
| 1.1 实验材料 | 第56页 |
| 1.2 基因组提取 | 第56页 |
| 1.3 引物设计与PCR扩增 | 第56页 |
| 1.4 PCR产物的克隆与测序 | 第56-57页 |
| 1.5 序列结果分析 | 第57页 |
| 1.6 MHCⅡA等位基因的命名规则 | 第57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-61页 |
| 2.1 MHCⅡA第二外显子区域的基因结构 | 第57页 |
| 2.2 3个不同尼罗罗非鱼养殖群体MHC ⅡA基因序列多态性分析 | 第57-60页 |
| 2.3 群体内和群体间的遗传分化 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-64页 |
| 全文总结 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-81页 |
| 附录 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
