| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 缩略词表(ABBREVIATION) | 第10-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-26页 |
| 1.1 怀牛膝概况 | 第14-16页 |
| 1.1.1 怀牛膝生物学特征研究 | 第14-15页 |
| 1.1.2 怀牛膝主要化学成分及其药理作用 | 第15-16页 |
| 1.2 齐墩果烷型三萜皂苷代谢途径研究 | 第16-21页 |
| 1.2.1 三萜皂苷的生物合成途径研究 | 第17-19页 |
| 1.2.2 三萜皂苷生物合成关键酶基因的研究进展 | 第19-21页 |
| 1.3 植物生长调节剂在药用植物中的应用 | 第21-22页 |
| 1.4 RNA-Seq及其在药用植物研究中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4.1 RNA-Seq | 第22页 |
| 1.4.2 RNA-Seq在药用植物次级代谢产物生物合成中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4.3 转录组测序在牛膝研究中的应用 | 第23页 |
| 1.5 本课题的主要研究内容与技术路线 | 第23-25页 |
| 1.5.1 主要研究内容 | 第23-24页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第24页 |
| 1.5.3 创新点 | 第24-25页 |
| 1.6 本课题的目的与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 外源植物激素诱导的怀牛膝转录组分析 | 第26-66页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 材料 | 第26页 |
| 2.1.2 主要仪器与试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.3 方法 | 第27-30页 |
| 2.2 结果与分析 | 第30-60页 |
| 2.2.1 怀牛膝测序样品总RNA的提取与质检 | 第30页 |
| 2.2.2 怀牛膝转录组测序数据质量评估与产量统计分析 | 第30-32页 |
| 2.2.3 怀牛膝转录组测序组装 | 第32-33页 |
| 2.2.4 Unigene的功能注释 | 第33-37页 |
| 2.2.5 基因的表达水平分析 | 第37-39页 |
| 2.2.6 外源植物激素处理怀牛膝的差异基因分析 | 第39-44页 |
| 2.2.7 三萜皂苷合成相关基因的挖掘 | 第44-47页 |
| 2.2.8 三萜皂苷合成候选关键酶差异基因的表达分析 | 第47-54页 |
| 2.2.9 植物激素合成及信号转导途径中差异基因的挖掘 | 第54-58页 |
| 2.2.10 差异表达转录因子的挖掘 | 第58-59页 |
| 2.2.11 qRT-PCR验证转录组测序结果 | 第59-60页 |
| 2.3 讨论 | 第60-66页 |
| 2.3.1 Unigenes的功能注释率 | 第60-61页 |
| 2.3.2 转录组测序已成为挖掘药用植物功能基因的有效手段 | 第61-63页 |
| 2.3.3 茉莉酸介导三萜皂苷合成的转录调控 | 第63-66页 |
| 第三章 怀牛膝三萜皂苷合成关键酶基因的时空表达分析 | 第66-76页 |
| 3.1 材料与方法 | 第66-68页 |
| 3.1.1 材料 | 第66-67页 |
| 3.1.2 主要仪器与试剂 | 第67页 |
| 3.1.3 方法 | 第67-68页 |
| 3.2 结果与分析 | 第68-73页 |
| 3.2.1 三萜皂苷生物合成关键酶基因的空间特异性表达 | 第68-69页 |
| 3.2.2 三萜皂苷生物合成关键酶基因的时间特异性表达 | 第69-73页 |
| 3.3 讨论 | 第73-76页 |
| 第四章 结论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-90页 |
| 附录 | 第90-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第95-96页 |
