摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 绪论 | 第9-17页 |
1.1 课题的来源、背景和意义 | 第9-10页 |
1.2 国内外的研究现状及分析 | 第10-16页 |
1.2.1 羽扇豆醇抑制肿瘤细胞的分子作用机制 | 第10-11页 |
1.2.2 miRNA在肿瘤及凋亡中的作用 | 第11-12页 |
1.2.3 miRNA相关的细胞信号通路研究方法 | 第12-15页 |
1.2.4 国内外文献综述的简析 | 第15-16页 |
1.3 本文的主要研究内容 | 第16-17页 |
第2章 材料与方法 | 第17-29页 |
2.1 实验材料及仪器 | 第17-18页 |
2.1.1 材料与试剂 | 第17-18页 |
2.1.2 实验仪器 | 第18页 |
2.2 实验方法 | 第18-24页 |
2.2.1 细胞培养、传代和冻存 | 第18-19页 |
2.2.2 药物配制 | 第19页 |
2.2.3 药物处理 | 第19页 |
2.2.4 总RNA的提取 | 第19-20页 |
2.2.5 RNA浓度的计算 | 第20页 |
2.2.6 琼脂糖凝胶电泳判断RNA提取效果 | 第20页 |
2.2.7 miRNA的反转录 | 第20-21页 |
2.2.8 miRNA荧光定量PCR | 第21-22页 |
2.2.9 mRNA的反转录 | 第22-23页 |
2.2.10 mRNA荧光定量PCR | 第23-24页 |
2.2.11 琼脂糖凝胶电泳检测miRNA靶基因荧光定量产物 | 第24页 |
2.3 高通量技术 | 第24-26页 |
2.3.1 小分子RNA测序 | 第24-25页 |
2.3.2 转录组测序 | 第25-26页 |
2.3.3 iTRAQ蛋白质组定量分析 | 第26页 |
2.4 数据处理及分析 | 第26-29页 |
2.4.1 miRNA注释 | 第26页 |
2.4.2 筛选显著差异表达的miRNA | 第26-27页 |
2.4.3 差异表达的miRNA靶标预测 | 第27页 |
2.4.4 转录组数据分析 | 第27页 |
2.4.5 蛋白组数据分析 | 第27-28页 |
2.4.6 检测到的转录组与蛋白组的表达一致性分析 | 第28-29页 |
第3章 高通量检测数据分析结果 | 第29-38页 |
3.1 小RNA测序数据分析结果 | 第29-33页 |
3.1.1 miRNA的预测结果 | 第29页 |
3.1.2 差异表达的miRNA | 第29-31页 |
3.1.3 筛选出的miRNA的靶标预测结果 | 第31-33页 |
3.2 转录组测序的数据分析结果 | 第33-34页 |
3.3 iTRAQ蛋白组定量分析结果 | 第34页 |
3.4 转录组与蛋白组的表达关联性分析 | 第34-35页 |
3.5 差异表达的miRNA预测靶标与差异表达mRNA比较结果 | 第35-36页 |
3.6 差异表达的miRNA预测靶标与差异表达蛋白比较结果 | 第36-37页 |
3.7 本章小结 | 第37-38页 |
第4章 HeLa细胞中miRNA的荧光定量PCR结果 | 第38-47页 |
4.1 样品制备 | 第38-40页 |
4.1.1 羽扇豆醇对HeLa细胞的抑制效果 | 第38页 |
4.1.2 RNA样品的紫外分光光度计鉴定结果 | 第38-40页 |
4.1.3 RNA样品的电泳检测结果 | 第40页 |
4.2 miRNA荧光定量PCR结果 | 第40-46页 |
4.2.1 内参的荧光定量PCR检测结果 | 第40-41页 |
4.2.2 hsa-miR-183的荧光定量PCR检测结果 | 第41-43页 |
4.2.3 hsa-miR-182的荧光定量PCR检测结果 | 第43-44页 |
4.2.4 hsa-miR-96的荧光定量PCR检测结果 | 第44-46页 |
4.3 本章小结 | 第46-47页 |
第5章 HeLa细胞中mRNA的荧光定量PCR结果 | 第47-56页 |
5.1 mRNA荧光定量PCR结果 | 第47-51页 |
5.1.1 内参的荧光定量PCR检测结果 | 第47-48页 |
5.1.2 KIAA1199的荧光定量PCR检测结果 | 第48-50页 |
5.1.3 靶基因PBX1的荧光定量PCR检测结果 | 第50-51页 |
5.2 mRNA荧光定量PCR扩增片段的电泳结果 | 第51-52页 |
5.3 miRNA及其靶标荧光定量PCR结果的比较分析 | 第52-53页 |
5.3.1 hsa-miR-183与靶基因KIAA1199、PBX1 | 第52-53页 |
5.3.2 hsa-miR-182与靶基因PBX1 | 第53页 |
5.3.3 hsa-miR-183-96-182基因簇与靶基因 | 第53页 |
5.4 羽扇豆醇抑癌通路分析 | 第53-55页 |
5.5 本章小结 | 第55-56页 |
结论 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-66页 |
附录1 转录组测序中检测到的显著差异表达的mRNA | 第66-68页 |
附录2 蛋白组学定量分析中检测到的显著差异表达的蛋白 | 第68-77页 |
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第77-79页 |
致谢 | 第79页 |