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基于高通量测序分析预测羽扇豆醇与miRNA相关的抑癌路径

摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 绪论第9-17页
    1.1 课题的来源、背景和意义第9-10页
    1.2 国内外的研究现状及分析第10-16页
        1.2.1 羽扇豆醇抑制肿瘤细胞的分子作用机制第10-11页
        1.2.2 miRNA在肿瘤及凋亡中的作用第11-12页
        1.2.3 miRNA相关的细胞信号通路研究方法第12-15页
        1.2.4 国内外文献综述的简析第15-16页
    1.3 本文的主要研究内容第16-17页
第2章 材料与方法第17-29页
    2.1 实验材料及仪器第17-18页
        2.1.1 材料与试剂第17-18页
        2.1.2 实验仪器第18页
    2.2 实验方法第18-24页
        2.2.1 细胞培养、传代和冻存第18-19页
        2.2.2 药物配制第19页
        2.2.3 药物处理第19页
        2.2.4 总RNA的提取第19-20页
        2.2.5 RNA浓度的计算第20页
        2.2.6 琼脂糖凝胶电泳判断RNA提取效果第20页
        2.2.7 miRNA的反转录第20-21页
        2.2.8 miRNA荧光定量PCR第21-22页
        2.2.9 mRNA的反转录第22-23页
        2.2.10 mRNA荧光定量PCR第23-24页
        2.2.11 琼脂糖凝胶电泳检测miRNA靶基因荧光定量产物第24页
    2.3 高通量技术第24-26页
        2.3.1 小分子RNA测序第24-25页
        2.3.2 转录组测序第25-26页
        2.3.3 iTRAQ蛋白质组定量分析第26页
    2.4 数据处理及分析第26-29页
        2.4.1 miRNA注释第26页
        2.4.2 筛选显著差异表达的miRNA第26-27页
        2.4.3 差异表达的miRNA靶标预测第27页
        2.4.4 转录组数据分析第27页
        2.4.5 蛋白组数据分析第27-28页
        2.4.6 检测到的转录组与蛋白组的表达一致性分析第28-29页
第3章 高通量检测数据分析结果第29-38页
    3.1 小RNA测序数据分析结果第29-33页
        3.1.1 miRNA的预测结果第29页
        3.1.2 差异表达的miRNA第29-31页
        3.1.3 筛选出的miRNA的靶标预测结果第31-33页
    3.2 转录组测序的数据分析结果第33-34页
    3.3 iTRAQ蛋白组定量分析结果第34页
    3.4 转录组与蛋白组的表达关联性分析第34-35页
    3.5 差异表达的miRNA预测靶标与差异表达mRNA比较结果第35-36页
    3.6 差异表达的miRNA预测靶标与差异表达蛋白比较结果第36-37页
    3.7 本章小结第37-38页
第4章 HeLa细胞中miRNA的荧光定量PCR结果第38-47页
    4.1 样品制备第38-40页
        4.1.1 羽扇豆醇对HeLa细胞的抑制效果第38页
        4.1.2 RNA样品的紫外分光光度计鉴定结果第38-40页
        4.1.3 RNA样品的电泳检测结果第40页
    4.2 miRNA荧光定量PCR结果第40-46页
        4.2.1 内参的荧光定量PCR检测结果第40-41页
        4.2.2 hsa-miR-183的荧光定量PCR检测结果第41-43页
        4.2.3 hsa-miR-182的荧光定量PCR检测结果第43-44页
        4.2.4 hsa-miR-96的荧光定量PCR检测结果第44-46页
    4.3 本章小结第46-47页
第5章 HeLa细胞中mRNA的荧光定量PCR结果第47-56页
    5.1 mRNA荧光定量PCR结果第47-51页
        5.1.1 内参的荧光定量PCR检测结果第47-48页
        5.1.2 KIAA1199的荧光定量PCR检测结果第48-50页
        5.1.3 靶基因PBX1的荧光定量PCR检测结果第50-51页
    5.2 mRNA荧光定量PCR扩增片段的电泳结果第51-52页
    5.3 miRNA及其靶标荧光定量PCR结果的比较分析第52-53页
        5.3.1 hsa-miR-183与靶基因KIAA1199、PBX1第52-53页
        5.3.2 hsa-miR-182与靶基因PBX1第53页
        5.3.3 hsa-miR-183-96-182基因簇与靶基因第53页
    5.4 羽扇豆醇抑癌通路分析第53-55页
    5.5 本章小结第55-56页
结论第56-57页
参考文献第57-66页
附录1 转录组测序中检测到的显著差异表达的mRNA第66-68页
附录2 蛋白组学定量分析中检测到的显著差异表达的蛋白第68-77页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果第77-79页
致谢第79页

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