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组蛋白H3K4me2对鸡SSCs形成的作用机制研究

中文摘要第3-7页
Abstract第7-11页
缩略词表第12-18页
第一章 文献综述第18-47页
    1 精原干细胞的研究进展第18-24页
        1.1 精原干细胞的来源第18页
        1.2 精原干细胞的形态学特征第18-19页
        1.3 精原干细胞的鉴定第19-20页
        1.4 精原干细胞形成的调控机制第20-24页
            1.4.1 调控SSCs形成的关键转录因子第20-21页
            1.4.2 调控SSCs形成的关键基因第21-22页
            1.4.3 调控SSCs形成的关键信号通路第22-24页
    2 表观遗传学与组蛋白甲基化研究进展第24-30页
        2.1 表观遗传学第24-25页
            2.1.1 组蛋白修饰第24页
            2.1.2 染色质重塑第24-25页
            2.1.3 其他调控机制第25页
        2.2 组蛋白甲基化修饰第25-28页
            2.2.1 组蛋白甲基化及去甲基化第25-26页
            2.2.2 组蛋白H3K4甲基化酶第26页
            2.2.3 MLL1和MLL2第26-27页
            2.2.4 MLL3和MLL4第27页
            2.2.5 SET1A和SET1B第27-28页
            2.2.6 ASHlL第28页
        2.3 组蛋白H3K4去甲基化酶第28-30页
            2.3.1 LSD1和LSD2第28-29页
            2.3.2 JARID1家族第29-30页
        2.4 组蛋白甲基化发挥功能的方式第30页
    3 生殖细胞发生过程中的组蛋白甲基化修饰研究进展第30-32页
        3.1 原始生殖细胞发生与组蛋白甲基化修饰第30-31页
        3.2 精子发生与组蛋白甲基化修饰第31-32页
        3.3 卵子发生与组蛋白甲基化修饰第32页
    4 研究目的与意义第32-33页
    5 参考文献第33-47页
第二章 组蛋白甲基化修饰酶和H3K4me2在鸡不同组织和细胞中时序表达及定位研究第47-60页
    1 材料与方法第48-54页
        1.1 实验材料第48页
        1.2 实验试剂第48-50页
        1.3 鸡不同组织器官及不同类型细胞的收集第50页
        1.4 RT-qPCR检测组蛋白甲基化修饰酶的时序性表达第50-52页
            1.4.1 RNA的提取与定量第50页
            1.4.2 cDNA第一链的合成第50-51页
            1.4.3 实时定量PCR第51-52页
        1.5 Western Blot检测H3K4me2时序性表达第52-53页
            1.5.1 蛋白质的提取及定量第52页
            1.5.2 Western blot第52-53页
        1.6 细胞免疫荧光检测H3K4me2在鸡SSCs中的定位分析第53-54页
            1.6.1 鸡SSCs的分离与培养第53页
            1.6.2 细胞化学免疫荧光第53-54页
        1.7 数据分析第54页
    2 实验结果第54-57页
        2.1 组蛋白甲基化修饰酶在鸡不同细胞和器官组织中的表达检测第54-56页
        2.2 组蛋白H3K4me2在鸡不同细胞和器官组织中的表达水平检测第56-57页
        2.3 组蛋白H3K4me2在鸡精原干细胞中的定位第57页
    3 讨论第57-58页
    4 小结第58页
    5 参考文献第58-60页
第三章 鸡SSCs形成过程中组蛋白H3K4me2甲基化修饰酶的筛选第60-72页
    1 材料与方法第60-64页
        1.1 实验材料与试剂第60-61页
            1.1.1 实验材料第60-61页
            1.1.2 实验试剂第61页
        1.2 主要仪器和设备第61页
        1.3 实验方法第61-64页
            1.3.1 设计及合成shRNA靶序列第61-63页
            1.3.2 慢病毒重组质粒的构建第63页
            1.3.3 慢病毒干扰载体干扰活性检测第63-64页
            1.3.4 Western Blot第64页
        1.4 数据分析第64页
    2 实验结果第64-68页
        2.1 靶向组蛋白甲基化修饰酶慢病毒干扰载体的构建及鉴定第64-65页
        2.2 组蛋白甲基化修饰酶慢病毒干扰载体干扰效率检测第65-68页
        2.3 筛选调控组蛋白H3K4me2的组蛋白甲基化修饰酶第68页
    3 讨论第68-69页
    4 小结第69页
    5 参考文献第69-72页
第四章 组蛋白H3K4me2甲基化在鸡SSCs形成过程的作用研究第72-97页
    1 材料与方法第72-79页
        1.1 实验材料与试剂第72-73页
        1.2 主要仪器和设备第73页
        1.3 主要试剂配制第73页
        1.4 ESCs的分离培养第73-74页
        1.5 SSCs的分离培养第74页
        1.6 体外诱导检测第74-77页
            1.6.1 鸡ESCs体外诱导分化试验第74页
            1.6.2 BCIP/NBT碱性磷酸酯酶染色第74-75页
            1.6.3 Edu检测ESCs增殖能力第75页
            1.6.4 RT-qPCR检测相关基因表达第75-76页
            1.6.5 细胞化学免疫荧光检测F第76页
            1.6.6 流式细胞分析第76-77页
            1.6.7 Western blot第77页
        1.7 体内鸡胚慢病毒注射第77-79页
            1.7.1 慢病毒整合鸡胚基因组检测第78页
            1.7.2 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第78页
            1.7.3 流式细胞分析检测各组SSCs比例第78-79页
        1.8 统计分析第79页
    2 实验结果第79-93页
        2.1 体外研究H3K4me2在SSCs形成过程中的作用第79-89页
            2.1.1 稳定表达shRNA-LSD1和shRNA-MLL2的鸡ESCs构建及鉴定第79-80页
            2.1.2 组蛋白H3K4me2对鸡ESCs自我更新的作用第80-81页
            2.1.3 组蛋白H3K4me2对鸡ES细胞增殖能力的作用第81-82页
            2.1.4 细胞形态变化观察第82-84页
            2.1.5 体外SSCs形成效率检测第84-89页
        2.2 体内鸡胚慢病毒注射第89-93页
            2.2.1 慢病毒干扰载体在鸡胚中的整合情况检测第90-91页
            2.2.2 体内SSCs生成效率检测第91-93页
    3 讨论第93-94页
    4 结论第94-95页
    5 参考文献第95-97页
第五章 组蛋白H3K4me2甲基化调控鸡精SSCs形成的表观机制研究第97-117页
    1 材料与方法第97-102页
        1.1 实验材料与试剂第97-98页
        1.2 主要仪器和设备第98页
        1.3 主要试剂配制第98页
        1.4 鸡精原干细胞的分离培养第98页
        1.5 慢病毒干扰载体感染鸡精原干细胞第98页
        1.6 慢病毒干扰载体干扰效率检测第98-99页
        1.7 病毒感染精原干细胞的芯片分析第99页
        1.8 H3K4me2抗体的CHIP-qPCR实验第99-102页
            1.8.1 CHIP实验第99-102页
            1.8.2 RT-qPCR验证RNA-seq数据第102页
            1.8.3 CHIP数据的分析第102页
    2 实验结果第102-113页
        2.1 SSCs形态及鉴定第102-103页
        2.2 慢病毒干扰载体感染鸡精原干细胞第103-104页
        2.3 转录组测序分析结果概况第104-107页
            2.3.1 RNA提取和检测及质量检测第104-105页
            2.3.2 基因表达水平分布第105-106页
            2.3.3 相关性分析第106-107页
        2.4 差异基因分析第107-109页
            2.4.1 差异基因聚类第107页
            2.4.2 差异基因的筛选分析第107-108页
            2.4.3 差异基因GO注释分析第108-109页
        2.5 MLL2和LSD1下游基因筛选分析第109-112页
            2.5.1 组间差异基因韦恩分析第109-110页
            2.5.2 组间差异基因GO富集分析第110-111页
            2.5.3 差异基因pathway分析第111-112页
            2.5.4 MLL2和LSD1下游基因的鉴定第112页
        2.6 MLL2和LSD1下游基因启动子H3K4me2水平检测第112-113页
    3 讨论第113-115页
    4 结论第115页
    5 参考文献第115-117页
全文结论与创新第117-118页
致谢第118-119页
研究生期间发表的论文第119-120页

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