| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 英文縮略表 | 第9-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| 1.1 引言 | 第12页 |
| 1.2 全基因组选择的基本原理 | 第12-13页 |
| 1.3 全基因组选择的模型和算法 | 第13-15页 |
| 1.3.1 BLUP方法 | 第13-14页 |
| 1.3.2 贝叶斯Alphabet方法 | 第14-15页 |
| 1.4 育种值估计中的显性效应 | 第15-18页 |
| 1.4.1 加性显性模型及算法 | 第16-18页 |
| 1.4.2 基因组选择中考虑显性效应的意义 | 第18页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 基于加性显性模型的贝叶斯方法 | 第20-35页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 模型与算法 | 第20-26页 |
| 2.2.1 BayesA方法 | 第21-26页 |
| 2.3 数据验证 | 第26-28页 |
| 2.3.1 基因型数据的模拟 | 第26页 |
| 2.3.2 表型数据的模拟 | 第26-27页 |
| 2.3.3 参数设置 | 第27-28页 |
| 2.4 结果与分析 | 第28-33页 |
| 2.4.1 加性效应和显性效应的模拟 | 第28页 |
| 2.4.2 不同世代间估计准确性趋势 | 第28-30页 |
| 2.4.3 不同方差比重对估计准确性的影响 | 第30-31页 |
| 2.4.4 QTL数和全同胞个数对估计准确性的影响 | 第31-33页 |
| 2.5 小结 | 第33-35页 |
| 第三章 基于加性显性模型的GBLUP方法 | 第35-44页 |
| 3.1 引言 | 第35页 |
| 3.2 模型与算法 | 第35-37页 |
| 3.3 数据验证 | 第37页 |
| 3.4 结果与分析 | 第37-43页 |
| 3.4.1 不同方法计算的相关系数 | 第37-42页 |
| 3.4.2 不同全同胞个数对估计准确性的影响 | 第42-43页 |
| 3.5 小结 | 第43-44页 |
| 第四章 西门塔尔肉牛基于及加性显性模型的基因组选择应用 | 第44-56页 |
| 4.1 引言 | 第44页 |
| 4.2 材料与方法 | 第44-49页 |
| 4.2.1 参考群体的构建 | 第44-45页 |
| 4.2.2 标记基因型与质量控制 | 第45-46页 |
| 4.2.3 表型性状 | 第46-47页 |
| 4.2.4 计算方法 | 第47-48页 |
| 4.2.5 评价指标 | 第48-49页 |
| 4.3 结果分析 | 第49-54页 |
| 4.3.1 性状的遗传参数估计 | 第49页 |
| 4.3.2 标记信息构建亲缘矩阵 | 第49-50页 |
| 4.3.3 标记效应的显著性检验 | 第50-52页 |
| 4.3.4 不同GBLUP模型估计方差组分和育种准确性 | 第52-54页 |
| 4.3.5 贝叶斯A方法估计育种准确性 | 第54页 |
| 4.4 结论 | 第54-56页 |
| 第五章 讨论 | 第56-60页 |
| 5.1 标记效应的模拟 | 第56页 |
| 5.2 标记效应的先验分布假设 | 第56-57页 |
| 5.3 BAYESA在不同因素影响下的特性 | 第57-58页 |
| 5.4 构建亲缘关系矩阵 | 第58-59页 |
| 5.5 GBLUP在不同因素影响下的特性 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 作者简历 | 第66页 |
