| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 1 引言 | 第9-18页 |
| 1.1 免疫概述 | 第9-12页 |
| 1.1.1 免疫系统的组成 | 第9-10页 |
| 1.1.2 免疫应答反应 | 第10页 |
| 1.1.3 骨髓的生理生化功能 | 第10-12页 |
| 1.2 马常见疾病及免疫相关基因的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3 免疫相关基因研究技术 | 第13-15页 |
| 1.3.1 基因表达谱 | 第13页 |
| 1.3.2 转录组 | 第13-14页 |
| 1.3.3 高通量测序 | 第14-15页 |
| 1.3.4 Illumina/Solexa测序技术 | 第15页 |
| 1.4 多样本mRNA-seq数据的处理方法 | 第15-16页 |
| 1.4.1 表达差异GO类别富集分析 | 第16页 |
| 1.4.2 表达差异KOG富集分析 | 第16页 |
| 1.4.3 表达差异KEGG富集分析 | 第16页 |
| 1.5 蒙古马与纯血马的体况特征 | 第16-17页 |
| 1.6 本实验的目的意义以及主要研究内容 | 第17-18页 |
| 1.6.1 实验的目的和意义 | 第17-18页 |
| 1.6.2 实验内容与方法 | 第18页 |
| 2 蒙古马与纯血马骨髓表达谱文库差异基因的研究 | 第18-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第18-19页 |
| 2.1.2 实验主要设备和仪器 | 第19页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第19页 |
| 2.2 实验过程 | 第19-22页 |
| 2.2.1 总RNA的提取和检测 | 第19-20页 |
| 2.2.2 测序文库的制备 | 第20页 |
| 2.2.3 文库测序 | 第20-21页 |
| 2.2.4 骨髓表达谱文库数据的可靠性验证 | 第21-22页 |
| 2.2.5 数据的处理与分析 | 第22页 |
| 3 结果 | 第22-42页 |
| 3.1 蒙古马和纯血马骨髓表达谱文库的建立 | 第22-24页 |
| 3.1.1 实验提取的总RNA质量检测结果 | 第22-23页 |
| 3.1.2 构建的cDNA文库质量检测结果 | 第23-24页 |
| 3.2 测序数据处理和分析结果 | 第24-42页 |
| 3.2.1 基因组注释信息 | 第24-25页 |
| 3.2.2 染色体上的注释结果 | 第25页 |
| 3.2.3 基因表达谱分析结果 | 第25-39页 |
| 3.2.4 差异基因表达谱数据可靠性验证 | 第39-42页 |
| 4 分析讨论 | 第42-46页 |
| 4.1 建库所用RNA的质量评估 | 第42页 |
| 4.2 染色体注释结果分析 | 第42-43页 |
| 4.3 差异表达基因结果分析 | 第43-44页 |
| 4.4 差异表达基因GO富集分析 | 第44-45页 |
| 4.5 差异表达基因KOG富集分析 | 第45页 |
| 4.6 差异表达基因KEGG富集分析 | 第45-46页 |
| 5 结论、创新点与展望 | 第46-47页 |
| 5.1 结论 | 第46页 |
| 5.2 创新点 | 第46页 |
| 5.3 论文的局限性 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-52页 |
| 作者简介 | 第52页 |