| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第7-24页 |
| §1.1 引言 | 第7-9页 |
| §1.1.1 淀粉样蛋白的研究背景 | 第7-8页 |
| §1.1.2 蛋白质的错误折叠、聚集与疾病 | 第8-9页 |
| §1.1.3 研究目的与意义 | 第9页 |
| §1.2 hIAPP介绍 | 第9-17页 |
| §1.2.1 蛋白质结构与性质 | 第9-12页 |
| §1.2.2 hIAPP的结构 | 第12-14页 |
| §1.2.3 hIAPP可能的致病机理 | 第14-17页 |
| §1.3 POPG/POPC介绍 | 第17-21页 |
| §1.3.1 磷脂分子的结构与性质 | 第17-20页 |
| §1.3.2 POPG/POPC的结构 | 第20-21页 |
| §1.4 hIAPP与POPG/POPC的作用 | 第21-24页 |
| 第二章 研究方法及分析方法 | 第24-35页 |
| §2.1 分子动力学模拟方法 | 第24-31页 |
| §2.1.1 分子动力学原理 | 第24-25页 |
| §2.1.2 周期性边界条件 | 第25-26页 |
| §2.1.3 分子动力学算法 | 第26-27页 |
| §2.1.4 能量优化方法 | 第27-29页 |
| §2.1.5 温度压强耦合 | 第29-31页 |
| §2.2 经验力场的介绍 | 第31-33页 |
| §2.3 分析方法 | 第33-35页 |
| 第三章 hIAPP单体吸附到带负电POPG膜过程的分子动力学研究 | 第35-48页 |
| §3.1 hIAPP单体与POPG模拟体系 | 第35-37页 |
| §3.1.1 hIAPP单体与POPG体系搭建及环境设置 | 第35-36页 |
| §3.1.2 模型及算法参数设置 | 第36-37页 |
| §3.2 模拟结果及分析 | 第37-47页 |
| §3.2.1 hIAPP单体从水溶液到POPG膜表面吸附过程 | 第37-43页 |
| §3.2.2 hIAPP单体在POPG膜表面的吸附面 | 第43-44页 |
| §3.2.3 能量分析 | 第44-45页 |
| §3.2.4 磷脂尾巴序参量分析 | 第45-47页 |
| §3.2.5 膜环境hIAPP聚集的可能机理 | 第47页 |
| §3.3 结论 | 第47-48页 |
| 第四章 hIAPP单体吸附到两性的POPC膜过程的分子动力学研究及与POPG体系的对比 | 第48-58页 |
| §4.1 hIAPP单体体系 | 第48-49页 |
| §4.1.1 hIAPP单体与POPC体系搭建及环境设置 | 第48-49页 |
| §4.1.2 模型及算法参数设置 | 第49页 |
| §4.2 模拟结果及分析 | 第49-57页 |
| §4.2.1 hIAPP单体从水溶液到POPC膜表面的吸附过程 | 第49-53页 |
| §4.2.2 hIAPP单体在POPC膜表面的吸附行为 | 第53-55页 |
| §4.2.3 电子密度分析 | 第55页 |
| §4.2.4 能量分析 | 第55-56页 |
| §4.2.5 氢键讨论 | 第56-57页 |
| §4.3 结论 | 第57-58页 |
| 总结与展望 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读硕士期间参加学术会议及论文发表情况 | 第66-67页 |
