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Ascl1在非洲爪蛙胚胎早期发育中的功能研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
主要英文缩略词对照表第10-11页
第1章 前言第11-36页
    1.1 胚胎发育研究史和模式生物第11-14页
        1.1.1 胚胎发育研究史第11-12页
        1.1.2 胚胎发育研究的几种模式生物第12-14页
    1.2 爪蛙胚胎的早期发育过程第14-19页
        1.2.1 卵母细胞的生成和母源因子储备第14页
        1.2.2 受精和皮层转动第14-15页
        1.2.3 卵裂期和细胞分裂第15-16页
        1.2.4 囊胚期和MBT第16页
        1.2.5 原肠胚期和细胞重排第16-17页
        1.2.6 神经胚期和神经管形成第17-18页
        1.2.7 尾牙期和器官形成第18页
        1.2.8 蝌蚪期及个体生长第18-19页
    1.3 爪蛙胚层分化过程和调控机制第19-28页
        1.3.1 三胚层分化第19-20页
        1.3.2 母源因子在胚胎早期发育中具有重要的功能第20-21页
        1.3.3 胚胎早期发育过程受到多种信号通路调控第21-24页
        1.3.4 内胚层的分化和调控机制第24页
        1.3.5 中胚层的分化和调控机制第24-26页
        1.3.6 外胚层的分化和调控机制第26-28页
    1.4 Ascl1的结构及功能第28-32页
        1.4.1 Ascl1的结构及同源性第28-29页
        1.4.2 Ascl1在神经发育中的功能第29-31页
        1.4.3 Ascl1的转录调控研究第31-32页
    1.5 HDAC家族和蛋白功能第32-34页
    1.6 研究的问题和内容第34-35页
    1.7 论文结构第35-36页
第2章 实验材料与方法第36-52页
    2.1 仪器设备第36页
    2.2 实验试剂第36-39页
        2.2.1 细胞和胚胎培养试剂第36页
        2.2.2 分子生化实验试剂第36-37页
        2.2.3 溶液配制第37-39页
    2.3 胚胎相关实验方法第39-41页
        2.3.1 爪蛙的饲养第39页
        2.3.2 胚胎体外授精和注射第39-40页
        2.3.3 Host transfer技术第40页
        2.3.4 动物极帽的分离和诱导第40页
        2.3.5 胚胎原位杂交第40-41页
    2.4 细胞相关实验方法第41-42页
        2.4.1 细胞培养第41-42页
        2.4.2 质粒转染第42页
    2.5 分子生化相关实验方法第42-52页
        2.5.1 质粒构建第42-43页
        2.5.2 mRNA体外转录第43-44页
        2.5.3 探针的合成第44-45页
        2.5.4 RNA的提取和反转录第45-46页
        2.5.5 实时荧光定量PCR第46-48页
        2.5.6 荧光报告基因检测第48页
        2.5.7 免疫印迹第48-49页
        2.5.8 免疫共沉淀第49页
        2.5.9 染色质免疫共沉淀第49-52页
第3章 Ascl1在胚胎中的时间和空间表达分析第52-57页
    3.1 Ascl1 mRNA在胚胎发育时间和空间上的表达模式第52-54页
    3.2 Ascl1蛋白在胚胎发育时间和空间上的表达模式第54-55页
    3.3 讨论第55-56页
    3.4 小结第56-57页
第4章 过量表达Ascl1抑制中内胚层基因的表达第57-65页
    4.1 过量表达Ascl1导致中内胚层基因下调第57-58页
    4.2 Ascl1抑制VegT诱导中内胚层基因的过程第58-61页
        4.2.1 Ascl1抑制VegT诱导的中内胚层基因第58-60页
        4.2.2 Ascl1直接抑制VegT诱导中内胚层基因的过程第60-61页
    4.3 Ascl1不影响Nodal/Activin诱导的中内胚层基因的表达第61-63页
        4.3.1 Ascl1不影响Nodal/Activin信号通路及其诱导中内胚层基因第61-62页
        4.3.2 Xnr1拯救Ascl1对中内胚层基因的抑制作用第62-63页
    4.4 讨论第63-64页
    4.5 小结第64-65页
第5章 敲降Ascl1导致中内胚层基因上调第65-76页
    5.1 Ascl1 MO有效性验证第65-67页
    5.2 Ascl1 MO特异性验证第67-69页
    5.3 RNA-seq结果表明Ascl1抑制中内胚层分化第69-71页
    5.4 敲降Ascl1导致中内胚层基因上调第71-73页
    5.5 Ascl1对中内胚层基因的调控依赖于VegT第73-74页
    5.6 讨论第74-75页
    5.7 小结第75-76页
第6章 Ascl1通过HDAC1依赖的方式抑制VegT的活性第76-88页
    6.1 Ascl1蛋白N端具有抑制中内胚层基因的活性第76-77页
    6.2 Ascl1蛋白N端与HDAC1相互作用第77-79页
    6.3 HDAC1抑制中内胚层基因的表达第79-82页
        6.3.1 敲降HDAC1上调中内胚层基因第79-81页
        6.3.2 过量表达HDAC1抑制中内胚层基因的表达第81-82页
    6.4 Ascl1影响VegT靶基因上的乙酰化水平第82-84页
    6.5 Ascl1依赖HDAC1活性抑制中内胚层基因第84-86页
    6.6 讨论第86-87页
    6.7 小结第87-88页
第7章 Ascl1通过直接结合VegT的方式抑制其功能第88-95页
    7.1 Ascl1不通过结合E-box序列抑制Xnr1-luc活性第88-89页
    7.2 Ascl1可结合在Bix4启动子的T-box序列上第89-90页
    7.3 Ascl1蛋白N端和VegT有相互作用第90-92页
    7.4 VegT依赖HAT活性调控靶基因的转录第92-93页
    7.5 讨论第93-94页
    7.6 小结第94-95页
第8章 Ascl1赋予外胚层神经分化潜能第95-105页
    8.1 敲降Ascl1影响神经干性基因sox2的表达第95-96页
    8.2 敲降Ascl1影响神经前体基因的表达第96-97页
    8.3 Ascl1是神经分化充分且必要的调控因子第97-100页
        8.3.1 敲降Ascl1导致神经分化缺陷第97-98页
        8.3.2 Ascl1异位诱导神经分化基因第98-100页
    8.4 母源和合子Ascl1在胚胎早期发育中的功能对比第100-103页
    8.5 讨论第103-104页
    8.6 小结第104-105页
第9章 总结与展望第105-112页
    9.1 论文结论第105-107页
    9.2 讨论第107-110页
        9.2.1 母源Ascl1在胚层分化中的功能具有双重性第107-108页
        9.2.2 母源Ascl1通过一种新的机制调控基因的转录第108-109页
        9.2.3 Ascl1与其他外胚层因子在对抗中内胚层机制上的区别第109页
        9.2.4 VegT依赖HAT活性调控靶基因的转录第109-110页
    9.3 展望第110-112页
        9.3.1 Ascl1与HDCA1的相互作用在神经元分化中的研究第110页
        9.3.2 Ascl1蛋白稳定性和活性调控研究第110-111页
        9.3.3 Ascl1蛋白N端和C端不同的功能进一步研究第111-112页
参考文献第112-127页
致谢第127-130页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第130页

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