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利用目标捕获高通量测序筛查人类非梗阻性无精子症单核苷酸变异

前言第4-5页
中文摘要第5-12页
Abstract第12-18页
第1章 绪论第23-75页
    1.1 高通量测序技术的发展、原理及展望第23-51页
        1.1.1 高通量测序技术的发展应用第24-31页
        1.1.2 高通量测序技术的工作原理及技术特点第31-43页
        1.1.3 高通量测序技术未来展望:三代测序第43-51页
    1.2 目标捕获测序技术第51-64页
        1.2.1 目标捕获测序技术检测范围及商品化panel第52-55页
        1.2.2 目标捕获原理第55-60页
        1.2.3 目标捕获方法技术特点及选择策略第60-64页
    1.3 非梗阻性无精子症相关基因SNP关联分析现状第64-75页
        1.3.1 SNV检测方法第66-68页
        1.3.2 NOA相关SNP关联研究文献回顾第68-75页
第2章 材料和方法第75-93页
    2.1 主要实验仪器第75-76页
    2.2 主要实验试剂(盒)第76-78页
        2.2.1 主要订购实验试剂(盒)第76-77页
        2.2.2 主要配制实验试剂第77-78页
    2.3 研究对象纳入和候选基因筛选第78-79页
        2.3.1 NOA组受试患者纳入第78页
        2.3.2 对照组受试者纳入第78页
        2.3.3 筛选目标区域捕获测序NOA相关基因第78-79页
    2.4 实验方法第79-93页
        2.4.1 相关基本信息收集和临床指标检测第79-82页
        2.4.2 目标区域捕获测第82-87页
        2.4.3 Case-Control study及统计分析方法第87-93页
第3章 结果第93-129页
    3.1 研究对象基本信息和NOA相关临床指标第93-94页
    3.2 目标区域捕获测序检测结果第94-98页
        3.2.1 目标区域捕获测序产出数据质量检测第94-96页
        3.2.2 目标区域捕获测序检测结果第96-98页
    3.3 目标区域捕获测序检出SNV变异与NOA关联研究第98-109页
        3.3.1 待研究候选SNV筛选第98-99页
        3.3.2 NOA组与对照组SNV等位基因频率对比第99-103页
        3.3.3 SNV等位基因与NOA关联研究第103-106页
        3.3.4 NOA相关SNV基因型分析第106-109页
    3.4 NOA相关SNV基因型与NOA相关临床表型关联研究第109-116页
        3.4.1 NOA相关SNV基因型频率对比第109-112页
        3.4.2 NOA相关SNV基因型与临床表型相关性分析第112-116页
    3.5 NOA相关SNV单体型分析第116-121页
        3.5.1 1号染色体相关SNV单体型分析第116-117页
        3.5.2 5号染色体相关SNV单体型分析第117-118页
        3.5.3 6号染色体相关SNV单体型分析第118-120页
        3.5.4 17号染色体相关SNV单体型分析第120-121页
    3.6 NOA相关SNV library构建第121-129页
        3.6.1 贝勒流程筛选候选SNM第121-122页
        3.6.2 筛选对照组内等位基因频率为0的SNM第122页
        3.6.3 SNV library构成、数据库分布及变异效果统计比较第122-129页
第4章 讨论第129-141页
    4.1 年龄对精子发生的影响第129-131页
    4.2 目标区域捕获结合高通量测序检测结果分析第131-134页
        4.2.1 关于目标NOA相关基因的讨论第131-132页
        4.2.2 关于目标区域捕获结合高通量测序产出数据质量的讨论第132-133页
        4.2.3 关于目标区域捕获结合高通量测序结果的讨论第133-134页
    4.3 NOA相关SNV关联研究结果分析第134-140页
        4.3.1 关于哈迪温伯格平衡的讨论第134-136页
        4.3.2 关于Bonferroni校正的讨论第136页
        4.3.3 关于NOA相关SNV及所在基因的讨论第136-140页
    4.4 关于贝勒流程的讨论第140-141页
第5章 结论第141-143页
创新点及实际应用价值第143-145页
参考文献第145-159页
附录1-目标区域捕获测序NOA相关基因列表第159-170页
附录2-患者基本信息问询表第170-171页
附录3-医生查体记录表第171-172页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第172-174页
致谢第174页

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